利用規(guī)則推導(dǎo)方法預(yù)測人類非小細(xì)胞肺癌中microRNA介導(dǎo)的基因調(diào)控模塊.pdf

1、中國醫(yī)科大學(xué)研究生學(xué)位論文獨創(chuàng)性聲明本人申明所呈交的學(xué)位論文是我本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。據(jù)我所知，除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含為獲得我?；蚱渌逃龣C(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料，與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示謝意。申請學(xué)位論文與資料若有不實之處，本人承擔(dān)一切相關(guān)責(zé)任。論文作者簽名：在壘生f日期：型墜壘一中國醫(yī)科

2、大學(xué)研究生學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本人完全了解中國醫(yī)科大學(xué)有關(guān)保護(hù)知識產(chǎn)權(quán)的規(guī)定，即：研究生在攻讀學(xué)位期間論文工作的知識產(chǎn)權(quán)單位屬中國醫(yī)科大學(xué)。本人保證畢業(yè)離校后，發(fā)表論文或使用論文工作成果時署名單位為中國醫(yī)科大學(xué)，且導(dǎo)師為通訊作者，通訊作者單位亦署名為中國醫(yī)科大學(xué)。學(xué)校有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和磁盤，允許論文被查閱和借閱。學(xué)校可以公布學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容(保密內(nèi)容除外)，以采用影印、縮印或其他手段保存論文。論文

3、作者簽名：指導(dǎo)教師簽名：廂堋。f懈l／沙日期：墅塑壁∑壘!矽中文論著摘要利用規(guī)則推導(dǎo)方法預(yù)測人類非小細(xì)胞肺癌中microRNA介導(dǎo)的基因調(diào)控模塊刖舌microRNA是一類非編碼小分子RNA，在轉(zhuǎn)錄后水平負(fù)性調(diào)控基因表達(dá)。越來越多的研究表明miRNA和多種癌癥相關(guān)并在腫瘤的發(fā)生發(fā)展、轉(zhuǎn)移及預(yù)后中起到重要的作用。肺癌是發(fā)病率和死亡率增長最快、對人類健康與生命危害最大的惡性腫瘤之一。目前在肺癌miRNA方面的研究絕大部分集中在發(fā)現(xiàn)新的miRN

4、A及其靶基因。本研究嘗試尋找miRNA與其靶基因在肺癌中的調(diào)控模塊。miRNA調(diào)控模塊(MRM)是參與到相似生物學(xué)過程具有相似的生物學(xué)功能的一組miRNA及其靶基因，用來揭示miRNA與其靶基因的關(guān)系和相互作用材料與方法本研究從EBI(wwwebiacuk)的Arrayexpress中使用檢索策略一“l(fā)ungcancer“and“microRNA“，下載實驗ETABM一22中的miRNA表達(dá)數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)集共有245個人類肺癌和肺癌細(xì)胞系

5、樣本的miRNA表達(dá)數(shù)據(jù)，其中包含104個非小細(xì)胞肺癌樣本(65個腺癌和39個鱗狀細(xì)胞癌)表達(dá)數(shù)據(jù)，135個miRNA。本研究所使用的基因表達(dá)數(shù)據(jù)是GSE2514、GSE3141、GSE4573、GSE5123，GSE5843和GSE6253。miRNA與靶基因結(jié)合數(shù)據(jù)從mirnaorg(WWwmirnaorg)中下載。對比miRNA表達(dá)數(shù)據(jù)和miRNA靶基因結(jié)合數(shù)據(jù)確定需要分析的miRNA。將8個基因表達(dá)數(shù)據(jù)表分別與miRNA靶基因結(jié)