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文檔簡介
1、背景(:)
艾滋病(Acquired Immune Deficiency Syndrome,AIDS)是由人類免疫缺陷病毒(Human Immunodeficiency Virus,HIV)引起的一種慢性傳染病。HIV病毒主要是通過感染CD4+細(xì)胞來摧毀人的免疫系統(tǒng),從而引起獲得性免疫缺陷綜合癥,最終導(dǎo)致死亡。有研究顯示不同的人對HIV的易感性不同,HIV感染者疾病進(jìn)展的速度也不一樣,這種現(xiàn)象可能與宿主的遺傳背景有關(guān)。大量
2、研究關(guān)注了趨化因子受體及其配體基因的多態(tài)性與HIV感染及疾病進(jìn)展的關(guān)系。其中對趨化因子受體5(CC-chemokine receptor,CCR5)基因的研究較多,CCR5是HIV進(jìn)入CD4+細(xì)胞的輔助受體,在HIV的早期感染和疾病的早期進(jìn)展中起著重要的作用。CCR5基因的調(diào)控區(qū)和編碼區(qū)存在大量的多態(tài)性,這些多態(tài)性可以影響CCR5在CD4+細(xì)胞表面的表達(dá),從而影響HIV感染CD4+細(xì)胞,最終影響宿主對HIV的易感性以及疾病的進(jìn)展速度。目
3、前對CCR5基因的多態(tài)性與HIV的易感性及疾病進(jìn)展的關(guān)系已做了大量的研究,但是研究的結(jié)論尚存在較大的爭議。
目的:
本研究全面收集了以往有關(guān)CCR5基因多態(tài)性與HIV感染及疾病進(jìn)展關(guān)系的研究,并對收集的文獻(xiàn)進(jìn)行全面的系統(tǒng)評價(jià)。期望明確在HIV感染及疾病進(jìn)展的過程中,宿主CCR5基因的多態(tài)性有沒有起到一定的作用,以及在這一過程中的影響因素都有哪些,從而為艾滋病預(yù)防與治療策略的制定提供可靠的證據(jù)。
4、方法:
采用循證醫(yī)學(xué)系統(tǒng)評價(jià)的方法擬定技術(shù)路線,主要內(nèi)容如下(:)
1.文獻(xiàn)檢索:同時(shí)使用主題詞和自由詞進(jìn)行檢索,以查全為前提兼顧特異性,制定檢索策略。檢索詞主要包括三個(gè)方面:(1)與AIDS相關(guān)的詞匯;(2)與CCR5相關(guān)的詞匯;(3)與易患性、多態(tài)性和疾病進(jìn)展相關(guān)的詞匯。主要檢索的數(shù)據(jù)庫包括PubMed,EMBASS,CBM,VIP等。其他檢索途徑包括參考文獻(xiàn),網(wǎng)絡(luò)搜索引擎和AIDS相關(guān)專業(yè)雜志和網(wǎng)站。<
5、br> 2.制定文獻(xiàn)的納入和排除標(biāo)準(zhǔn):納入標(biāo)準(zhǔn)主要包括所有關(guān)于CCR5基因多態(tài)性與HIV感染及疾病進(jìn)展關(guān)系的研究。排除標(biāo)準(zhǔn)主要包括排除非人群研究以及不能獲得所需詳細(xì)數(shù)據(jù)的研究。
3.篩選文獻(xiàn),評價(jià)文獻(xiàn)的質(zhì)量:由兩名評價(jià)員同時(shí)篩選和評價(jià)文獻(xiàn)質(zhì)量,采用CASP(Critical Appraisal Skills Programme)和NOS(Newcastle-Ottawa Scale)文獻(xiàn)質(zhì)量評價(jià)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行文獻(xiàn)質(zhì)量評價(jià)。
6、
4.分析納入文獻(xiàn)的異質(zhì)性:綜合使用Q檢驗(yàn)、I2檢驗(yàn)和H檢驗(yàn)評價(jià)各研究之間的異質(zhì)性,分析異質(zhì)性來源。
5.合并效應(yīng)量:研究間沒有異質(zhì)性,使用固定效應(yīng)模型合并效應(yīng)量。如果研究間存在異質(zhì)性,按異質(zhì)性來源進(jìn)行亞組分析或使用隨機(jī)效應(yīng)模型。納入研究較少且異質(zhì)性較大時(shí),只進(jìn)行描述性分析。
6.敏感性分析:分析可能影響結(jié)果穩(wěn)定性的因素,排除此因素重新分析,考查結(jié)果的穩(wěn)定性?;蛲瑫r(shí)使用固定效應(yīng)模型和隨機(jī)效應(yīng)模型
7、合并效應(yīng)量,考查結(jié)果的穩(wěn)定性。
7.發(fā)表偏倚分析:綜合使用Begg's和Egger's檢驗(yàn)以及非參數(shù)剪補(bǔ)法來考查發(fā)表偏倚。
8.數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析用Stata10.0統(tǒng)計(jì)軟件包完成。
結(jié)果:
第一部分:CCR5基因多態(tài)性與HIV感染的關(guān)系
1.共納入文獻(xiàn)37篇,研究的CCR5基因的多態(tài)性包括了編碼區(qū)的△32多態(tài),啟動(dòng)子區(qū)的59029A/G、59353T/C、59356C/
8、T、59402A/G和59653C/T等多態(tài)。研究的設(shè)計(jì)均為病例對照研究,研究的質(zhì)量基本符合病例對照研究的評價(jià)標(biāo)準(zhǔn)。
2.CCR5基因編碼區(qū)△32的多態(tài)與HIV感染的關(guān)系
(1)有20個(gè)研究以一般人群為對照組,病例組總?cè)藬?shù)為4397人,對照組總?cè)藬?shù)為5776人。病例組共檢出CCR5△32/△32純合子2例,檢出率是0.05%,對照組檢出CCR5△32/△32純合子37例,檢出率是0.64%。CCR5△32/△
9、32突變純合子與野生純合子相比,合并的OR及95%的可信區(qū)間(confidenceinterval,CI)是0.172(0.069~0.434),CCR5△32/WT雜合子與野生純合子相比,合并的OR及95%的CI是1.033(0.829~1.288)。
(2)有9個(gè)研究以長期暴露不感染人群為對照組,病例組總?cè)藬?shù)為1793人,對照組總?cè)藬?shù)為655人。在病例組中沒有檢測出CCR5△32/△32突變純合子,在長期暴露不感染組中
10、檢出9例CCR5△32/△32突變純合子,檢出率為1.37%。CCR5△32/△32突變純合子與野生純合子相比,合并的OR及95%CI是0.057(0.008~0.420),CCR5△32/WT雜合子與野生純合子相比,合并的OR及95%的CI是0.900(0.648~1.252)。
(3)有9個(gè)研究以兒童(均出生于HIV陽性的母親)為研究對象,病例組總?cè)藬?shù)1388人,對照組總?cè)藬?shù)1928人,病例組檢出1例△32/△32純合
11、子,檢出率為0.07%,對照組檢出4例△32/△32純合子,檢出率為0.2%。CCR5△32/△32突變純合子與野生純合子相比,合并的OR及95%CI是0.438(0.097~1.974),CCR5△32/WT雜合子與野生純合子相比,合并的OR及95%的CI是1.019(0.781~1.329)。
3.CCR5基因啟動(dòng)子區(qū)基因的多態(tài)性與HIV感染的關(guān)系
(1)有7個(gè)研究分析了啟動(dòng)子區(qū)59029A/G位點(diǎn)的多態(tài)
12、與HIV感染的關(guān)系,病例組總?cè)藬?shù)1282人,對照組總?cè)藬?shù)1194。59029G等位突變頻率在歐美人群較低(39%~43%),在亞洲人群較高(55%~61%)。在歐洲人群中,59029G等位突變可能增加了感染HIV的風(fēng)險(xiǎn)(G/G&G/AvsAA(:)OR=1.478,95%CI(:)1.033~2.115),但是在非洲人群(G/G&G/AvsAA(:)OR=0.711,95%CI(:)0.523~0.948)和亞洲人群(印度人)(G/G&
13、G/AvsAA(:)OR=0.489,95%CI(:)0.257~0.931)59029G等位突變可能降低了感染HIV的風(fēng)險(xiǎn)。
(2)有7個(gè)研究分析了59353T/C位點(diǎn)的多態(tài)與HIV感染的關(guān)系,病例組總?cè)藬?shù)751人,對照組總?cè)藬?shù)1023人。在歐美人群,59353C等位突變頻率為52%~57%,亞洲人群為39%~42%??偟膩砜矗?9353T/C位點(diǎn)的多態(tài)與HIV的易感性無關(guān)。但是在兒童亞組,(C/C&C/TvsT/T)比
14、較模型合并的OR及95%的CI是0.712(0.522~0.971),提示在兒童中,59353C等位突變可能降低了感染HIV的風(fēng)險(xiǎn)。
(3)有5個(gè)研究(4個(gè)以兒童為研究對象)分析了59356C/T位點(diǎn)的多態(tài)與HIV感染的關(guān)系,病例組總?cè)藬?shù)553人,對照組總?cè)藬?shù)982人。59356T等位突變頻率較低,在兒童為7%~12%,在成人(印度)為2%。在兒童人群,59356T/T純合突變基因型與純合野生型(C/C)相比可能增加了感染
15、HIV的風(fēng)險(xiǎn),合并的OR及95%的CI是3.718(1.777~7.777)。
(4)有6個(gè)研究分析了59402A/G位點(diǎn)的多態(tài)性與HIV感染的關(guān)系,病例組總?cè)藬?shù)846人,對照組總?cè)藬?shù)1440人。在兒童人群,59402G等位突變頻率為24%~28%,在成人中,59402G等位突變頻率為43%~51%(亞洲)和13%(非洲)。Meta分析結(jié)果顯示,無論在兒童組還是成人組,59402A/G位點(diǎn)的多態(tài)與HIV的易感性均不相關(guān)。但
16、單個(gè)研究提示,59402G等位突變可能降低了兒童和成人感染HIV的風(fēng)險(xiǎn)。
(5)有6個(gè)研究分析了59653C/T位點(diǎn)的多態(tài)性與HIV感染的關(guān)系,病例組總?cè)藬?shù)1013人,對照組總?cè)藬?shù)977人。59653T等位突變頻率9%~17%,但在印度人未檢出。Meta分析結(jié)果顯示,59653C/T位點(diǎn)的多態(tài)性與HIV的易感性不相關(guān)。
第二部分:CCR5基因多態(tài)性與HIV疾病進(jìn)展的關(guān)系
1.共納入24篇關(guān)于CC
17、R5基因多態(tài)性與HIV疾病進(jìn)展關(guān)系的研究,研究設(shè)計(jì)主要是病例對照研究和生存分析。分析的CCR5基因的多態(tài)包括了編碼區(qū)的△32,啟動(dòng)子區(qū)的59029A/G,59353C/T。
2.CCR5基因編碼區(qū)△32多態(tài)性與HIV疾病進(jìn)展的關(guān)系
(1)有11個(gè)研究分析比較了CCR5△32/WT突變雜合子在長期感染不進(jìn)展(LTNP)組、典型進(jìn)展(TP)組和快速進(jìn)展(RP)組中的分布差異。LTNP組總?cè)藬?shù)671人,CCRS△3
18、2/WT突變雜合子的分布頻率為27.1%;TP組總?cè)藬?shù)為1088人,CCR5△32/WT突變雜合子的分布頻率為14.5%;RP組總?cè)藬?shù)為413人,CCR5△32/WT突變雜合子的分布頻率為8.5%。LTNP組與TP組比較(11個(gè)研究),合并效應(yīng)量后總的OR及其95%的CI是0.460(0.308~0.686)。按種族分層,歐洲人群合并的OR值及其95%的CI是0.423(0.262~0.684)。按年齡分層,在成人中合并的OR值及其95
19、%的CI是0.470(0.300~0.739),在兒童中合并的OR及其95%的CI是0.331(0.124~0.886)。LTNP組與RP組比較(6個(gè)研究),合并效應(yīng)量后總的OR及95%的CI是0.237(0.106~0.529)。按種族分層,在歐洲人群中合并的總的OR及95%的CI是0.217(0.092~0.510);按年齡分層,在成人中合并的總的OR及95%的CI是0.274(0.122~0.613),在兒童中合并的總的OR及95
20、%的CI是0.145(0.006~3.290)。TP組與RP組相比(6個(gè)研究),合并后總的OR及其95%的CI是0.496(0.225~1.093)。按種族分層后,在歐洲人群中總的OR及其95%的CI是0.455(0.195~1.059);按年齡分層后,在成人中總的OR及其95%的CI是0.544(0.232~1.272),在兒童中總的OR及其95%的CI是0.362(0.027~4.780)。結(jié)果表明,總的來看CCR5△32雜合子基因
21、型在TP和RP人群中分布的差異沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Z=1.74,P=0.082)。
(2)有8個(gè)研究分析了CCRS△32雜合子與野生純合子相比進(jìn)展到AIDS的風(fēng)險(xiǎn),按照人種進(jìn)行分層分析。在歐洲人亞組中,合并的總的HR及其95%的CI是0.629(0.471~0.840),結(jié)果表明在歐洲人中,攜帶CCR5△32雜合子的HIV感染者進(jìn)展到AIDS的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶純合野生型的62.9%。
3.CCR5基因啟動(dòng)子區(qū)多態(tài)性與H
22、IV疾病進(jìn)展的關(guān)系
(1)有3個(gè)研究分析了CCR5啟動(dòng)子59029位點(diǎn)A/G多態(tài)在LTNP,RP和TP人群中的分布差異,LTNP組總?cè)藬?shù)為348人,RP組總?cè)藬?shù)為175人,TP總?cè)藬?shù)為404人。LTNP組與RP組比較(:)59029(AvsG)和(AA&AGvsGG)在排除了CCR5△32突變和CCR2-64I突變后,合并后總的OR及其95%的CI是1.863(1.010~3.437)和2.112(1.235~3.614)
23、。LTNP組與TP組比較(:)排除CCR5△32與CCR2-64I突變前后,總OR的95%的CI均包含1,假設(shè)檢驗(yàn)的P均大于0.05。RP組與TP組比較(:)在排除CCR5△32突變和CCR2-64I突變后,59029(AvsG)比較模型總的OR及95%的CI是1.442(1.050~1.980),59029(AAvsGG)比較模型總的OR及95%的CI是2.120(1.102~4.080),59029(AA&AGvsGG)比較模型總的
24、OR及95%的CI是1.772(1.060~2.963)。有3個(gè)研究分析了HIV感染者攜帶59029A/A或A/G基因型與攜帶G/G基因型相比,進(jìn)展到AIDS或死亡的風(fēng)險(xiǎn)。結(jié)果顯示,在歐洲人群,攜帶59029A/A基因型的HIV感染者進(jìn)展到AIDS的風(fēng)險(xiǎn)高于攜帶59029G/G的HIV感染者。
(2)有3個(gè)研究分析了CCR5啟動(dòng)子59353位點(diǎn)T/C多態(tài)在LTNP、RP和TP組的分布差異,LTNP組總?cè)藬?shù)是123人,RP組
25、總?cè)藬?shù)是125人,TP組總?cè)藬?shù)為199人。RP組的C/C基因型的頻率要顯著高于LTNP組和TP組。攜帶59353(C/C&C/T)基因型的HIV感染者進(jìn)展到AIDS的風(fēng)險(xiǎn)(CD4+T<200)高于攜帶59353T/T基因型的HIV感染者。
結(jié)論:
第一部分:CCR5基因多態(tài)性與HIV感染的關(guān)系
1.CCR5△32的突變主要分布在歐洲人群,等位突變頻率是9.34%。在其他的人種檢出很少。因此在歐洲
26、人中考查CCR5△32與HIV感染的關(guān)系意義更大。
2.在HIV感染者中極少檢出CCR5△32/△32突變純合子,而突變雜合子有一定的檢出率。
3.在成人中,無論是以一般人群為對照,還是以長期暴露不感染者作為對照組,CCR5△32/△32純合突變型都降低了感染HIV的風(fēng)險(xiǎn),而CCR5△32/WT雜合子與HIV的易感性無關(guān)。因此可以得出結(jié)論,CCR5△32/△32突變純合子可以阻止HIV在成人中的傳播(傳播途徑
27、主要包括了性傳播和注射吸毒傳播)。
4.無論是CCR5△32/△32突變純合子還是CCR5△32/WT雜合子都沒有降低HIV垂直傳播中兒童感染HIV的風(fēng)險(xiǎn)。因此我們可以認(rèn)為,HIV在成人中的傳播機(jī)制和在垂直傳播中的傳播機(jī)制可能不同。
5.CCR5基因啟動(dòng)子59029G等位突變可能降低了非洲裔美國人和印度人感染HIV的風(fēng)險(xiǎn)。
6.CCR5基因啟動(dòng)子59353C等位突變可能降低了兒童感染HIV的風(fēng)險(xiǎn)
28、。
7.在兒童中CCR5基因啟動(dòng)子59356T/T純合子與C/C純合子相比增加了感染HIV的風(fēng)險(xiǎn)。
8.總的來看,CCR5基因啟動(dòng)子59402G突變與HIV的易感性無關(guān),但單個(gè)研究提示,59402G等位突變可能降低了兒童和成人感染HIV的風(fēng)險(xiǎn)。
9.CCR5基因啟動(dòng)子59653C/T多態(tài)與HIV的感染沒有關(guān)系。
第二部分:CCR5基因多態(tài)性與HIV疾病進(jìn)展的關(guān)系
1.
29、在歐洲人群中,攜帶CCR5△32/WT雜合子的HIV感染者進(jìn)展到AIDS的風(fēng)險(xiǎn)要顯著低于攜帶野生純合子的HIV感染者。在LTNP組中,CCR5△32/WT雜合基因型頻率顯著高于TP人群和RP人群,但TP組和RP組中CCR5△32/WT雜合基因型頻率差異卻沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。這表明CCR5△32/WT雜合基因型在LTNP人群中起到阻止HIV疾病進(jìn)展的作用,一旦疾病開始進(jìn)展,其阻止作用就可能很有限了。
2.CCR5啟動(dòng)子59029
30、位點(diǎn)的A等位頻率在RP組要顯著高于LTNP組和TP組,而LTNP組和TP組的A等位頻率卻沒有顯著性差異,這表明59029A多態(tài)與HIV的快速進(jìn)展相關(guān)。生存分析也顯示,在歐洲人,攜帶59029A/A基因型的HIV感染者進(jìn)展到AIDS的風(fēng)險(xiǎn)顯著增加,而進(jìn)展到死的風(fēng)險(xiǎn)卻沒有顯著增加。另外研究結(jié)果顯示,攜帶CCR5啟動(dòng)子59353C/C基因型的HIV感染者進(jìn)展到AIDS的風(fēng)險(xiǎn)顯著增加。因?yàn)?9029A與59353C在染色體上是緊密連鎖的,因此5
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