圈養(yǎng)斑嘴環(huán)企鵝的種群遺傳管理.pdf

1、學(xué)校代碼：1 0 2 2 5學(xué) 號(hào)：S 1 5 5 3 3學(xué)位論文圈養(yǎng)斑嘴環(huán)企鵝的種群遺傳管理指導(dǎo)教師姓名：申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：論文提交日期：授予學(xué)位單位：耿廣耀楊淑慧東北林業(yè)大學(xué)、碩士 學(xué)科專業(yè)： 特種經(jīng)濟(jì)動(dòng)物飼養(yǎng)2 0 1 5 年6 月 論文答辯日期： 2 0 1 5 年6 月東北林業(yè)大學(xué) 授予學(xué)位日期： 2 0 1 5 年6 月答辯委員會(huì)主席：論文評(píng)閱人：素夕厶櫛素大學(xué)摘要摘要斑嘴環(huán)企鵝( S p h e n i s c u sd e

2、m e r s u s ) 又名非洲企鵝，該種企鵝作為一種南半球特有觀賞鳥類于上世紀(jì)9 0 年代引入我國(guó)上海動(dòng)物園，隨著動(dòng)物觀賞市場(chǎng)需求變化，需要更多的斑嘴環(huán)企鵝來(lái)滿足廣大動(dòng)物愛好者的觀賞需求。但是圈養(yǎng)在動(dòng)物園的斑嘴環(huán)企鵝由于無(wú)野外種群和圈養(yǎng)種群模式小，一般采用“拉婚配”的配種方式，加之養(yǎng)殖時(shí)間長(zhǎng)，譜系關(guān)系記錄不明確等原因，長(zhǎng)期無(wú)計(jì)劃繁育或者被迫近親繁育，導(dǎo)致基因多樣性嚴(yán)重匱乏，種群發(fā)展受限。為解決以上問題，本文對(duì)動(dòng)物園圈養(yǎng)斑嘴環(huán)企鵝群

3、體在線粒體D N A 和核D N A 層次進(jìn)行了遺傳多樣性研究，以期確定我國(guó)圈養(yǎng)斑嘴環(huán)企鵝的親子關(guān)系、譜系關(guān)系，為斑嘴環(huán)企鵝的合理繁殖制定科學(xué)的方案。本課題主要以圈養(yǎng)在上海動(dòng)物園的斑嘴環(huán)企鵝種群為研究對(duì)象，主要采用非傷害性取樣法，以4 6 只斑嘴環(huán)企鵝胸部廓羽為主要實(shí)驗(yàn)樣本，利用試劑盒法提取D N A 。選擇適當(dāng)?shù)囊镞M(jìn)行P C R 擴(kuò)增反應(yīng)，擴(kuò)增Z W 基因片段進(jìn)行性別鑒定；利用M E G A 4 ．0 、C E R V U S3 ．

4、0 、P O P G E N EV e r s i o n 1 ．3 2 、S T R U C T U R E2 ．2 等分子生物學(xué)軟件對(duì)線粒體D N A 和核D N A 進(jìn)行遺傳多樣性分析，構(gòu)建種群系統(tǒng)進(jìn)化樹，進(jìn)行種群分析。結(jié)果如下：1 ．在3 9 個(gè)斑嘴環(huán)企鵝個(gè)體中發(fā)現(xiàn)1 5 個(gè)變異位點(diǎn)定義了1 0 個(gè)單倍型，不同單倍型的遺傳距離在0 ．0 0 2 ．0 ．0 1 9 之間，平均遺傳距離為0 ．0 1 2 。利用N J 法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)

5、化樹，1 0 個(gè)單倍型分化為2 個(gè)大的進(jìn)化分支。利用相同的方法構(gòu)建上海和已知日本種群的線粒體控制區(qū)系統(tǒng)進(jìn)化樹。與M u r a t a 和M u r a k a m i ( 2 0 1 4 ) 的研究結(jié)果相同，斑嘴環(huán)企鵝存在2 個(gè)明顯的世系( A 和B ) ，且上海種群的單倍型均屬于包含單倍型數(shù)目較多的A 世系。2 ．實(shí)驗(yàn)用P N N 0 1 、P N N 0 3 、P N N 0 6 、P N N 0 9 、P N N 0 1 2 、

6、G 2 ．2 、B 3 ．2 、S h 2 C a 2 1 共8 個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)在4 6 個(gè)樣品中共檢測(cè)到3 4 個(gè)等位基因，等位基因變化范圍在3 - 6 個(gè)。該套遺傳標(biāo)記系統(tǒng)單個(gè)位點(diǎn)排除率在O ．5 6 ．0 ．8 7 之間，有5 個(gè)位點(diǎn)的D P > 0 ．8 ，其中P N N 0 9 位點(diǎn)的非父排除率最高為0 ．8 6 9 ，8 個(gè)位點(diǎn)的累積個(gè)體識(shí)別力達(dá)到9 9 ．9 9 ％，完全可以用于斑嘴環(huán)企鵝的個(gè)體識(shí)別，檢測(cè)沒有親緣關(guān)系的