喉鱗狀細胞癌特征性microRNA表達譜的研究.pdf

1、占人類基因1％的microRNA（miRNA）幾乎調(diào)節(jié)著至少30％的mRNA，它們通過調(diào)控相關靶基因mRNA的表達水平影響腫瘤細胞的表型。喉癌是最常見的頭頸部惡性腫瘤，也是僅次于肺癌的呼吸道第二高發(fā)癌。目前，尚少見有喉癌的miRNA特征性表達譜或與其生物學行為相關的差異表達miRNA的研究報道。
　　 本項研究采用基于基因芯片技術的miRNA表達譜的分析方法，分別以福爾馬林固定石蠟包埋（formalin-fixed and pa

2、raffin-embedded，F(xiàn)FPE）組織和新鮮凍存組織為研究材料，以獲得喉鱗狀細胞癌特征性的miRNA表達譜型；進而篩選出與喉鱗癌生物學特征密切相關的差異表達miRNA。同時比較從FFPE和新鮮凍存兩種組織材料中所獲得的喉鱗癌miRNA表達譜的差異，評價FFPE組織miRNA表達譜分析的有效性和可行性。這項研究的遠期目標為，從上述“分子變化譜型”中篩選出具有鑒別意義的miRNA，對喉癌發(fā)生與發(fā)展、淋巴結轉移或復發(fā)風險進行評估預測，

3、以輔助診斷和指導治療。
　　 首先，應用Agilent公司的人類miRNA芯片，針對24例喉鱗癌FFPE組織樣品以及8例新鮮凍存的喉鱗癌患者配對癌組織和癌旁組織樣品的總RNA進行了miRNA表達譜檢測。繼而，采用基因芯片分析軟件GeneSpring和統(tǒng)計學軟件R project分析了上述miRNA芯片的實驗數(shù)據(jù)。結果顯示，從24例喉鱗癌FFPE織標本中鑒定到319個miRNA，其中96個miRNA在全部24例中均有表達；從8例喉

4、鱗癌新鮮凍存癌組織標本中鑒定到342個miRNA，其中161個miRNA在全部8例中均有表達；從而初步獲得喉鱗癌的miRNA表達譜。在FFPE組織中檢測到的319個miRNA信號中有233個也能在新鮮凍存喉癌組織中檢測到；在FFPE組織中檢測到的79個與淋巴結轉移相關（p<0.05）的miRNA中有16個也在新鮮凍存喉癌組織中發(fā)現(xiàn)的與淋巴結轉移相關的52個miRNA中出現(xiàn)，這16個miRNA包括miR-17、miR-130b、miR-1

5、83、miR-30b、miR-20a、miR-96、miR-188-5p等；從而確認了上述FFPE組織miRNA表達譜分析的有效性。進而采用檢錯率FDR<0.05進行校正，以篩選FFPE組織樣品中顯著差異表達的miRNA，獲得5個與喉鱗癌淋巴轉移密切相關的差異表達miRNA：miR-23a*、miR-28-5p、miR-15a、miR-16和miR-425。
　　 本項研究表明，具有不同生物學行為的喉鱗癌之間存在miRNA的差異