藏雞三個(gè)基因的SNPs檢測(cè)及其與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析和金水烏雞資源群體的構(gòu)建.pdf

1、藏雞是我國(guó)青藏高原在原始飼養(yǎng)狀態(tài)下保存下來(lái)的珍貴家禽品種。藏雞具有耐寒、抗病、抗缺氧、肉質(zhì)鮮美、藥用價(jià)值較高,耐粗放和可觀賞性強(qiáng)等優(yōu)良特性,同時(shí)也有生長(zhǎng)速度慢、產(chǎn)蛋率低的缺點(diǎn)。如何在保存好這一珍貴遺傳資源的同時(shí),通過(guò)經(jīng)濟(jì)雜交和產(chǎn)品開(kāi)發(fā)利用好藏雞就成為當(dāng)前重要的研究課題。
　　 本研究以我室所建的藏雞與隱性白羽群體為材料,通過(guò)利用生物信息學(xué)分析方法,利用分子生物學(xué)技術(shù)克隆和分離與藏雞生長(zhǎng)性狀有關(guān)的基因,為分子標(biāo)記輔助選擇提供分子基

2、礎(chǔ)。主要取得了如下結(jié)果:
　　 1.根據(jù)雞SNPs數(shù)據(jù)庫(kù)信息設(shè)計(jì)引物,通過(guò)PCR方法對(duì)MSTN基因進(jìn)行SNPs篩查,發(fā)現(xiàn)第1外顯子上有2個(gè)同義突變位點(diǎn)A2100G,A2109G。對(duì)于2個(gè)位點(diǎn),G等位基因均占優(yōu)勢(shì),每個(gè)位點(diǎn)的3種基因型頻率在2個(gè)品種間均沒(méi)有顯著差異。與藏雞的部分生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)結(jié)果表明,A2100G位點(diǎn)與16周齡體重存在顯著相關(guān)(P<0.01);A2109G位點(diǎn)與初生脛長(zhǎng)、4周齡管?chē)嬖跇O顯著的相關(guān)(P<0.01)。

3、
　　 2.根據(jù)雞SNPs數(shù)據(jù)庫(kù)信息設(shè)計(jì)引物,通過(guò)PCR方法對(duì)CMYA3基因進(jìn)行SNPs篩查,發(fā)現(xiàn)第4外顯子上有4個(gè)同義突變位點(diǎn),T1182C,A4950G,A7776G,A8140G。對(duì)于T1182C位點(diǎn),T等位基因占優(yōu)勢(shì)；A4950G,A等位基因占優(yōu)勢(shì);A7776G,A8140G,G等位基因均占優(yōu)勢(shì);每個(gè)位點(diǎn)的3種基因型頻率在2個(gè)品種間均沒(méi)有顯著差異。與藏雞的部分生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)結(jié)果表明,T1182C位點(diǎn)與2周齡體重存在顯著的

4、相關(guān)(P<0.05)；A4950G位點(diǎn)與2周齡體重和4周齡脛長(zhǎng)呈相關(guān)趨勢(shì)；A7776G位點(diǎn)與初生脛長(zhǎng)顯著相關(guān)(P<0.05)；A8140G位點(diǎn)與16周齡體重極顯著相關(guān)(P<0.01)。
　　 3.根據(jù)雞SNPs數(shù)據(jù)庫(kù)信息設(shè)計(jì)引物,通過(guò)PCR方法對(duì)CMYA5基因進(jìn)行SNPs篩查,發(fā)現(xiàn)第2外顯子上有2個(gè)錯(cuò)義突變位點(diǎn)T1541G(Ser-Cys),T1618C(Val-Gly)。對(duì)于2個(gè)位點(diǎn),T等位基因占優(yōu)勢(shì),每個(gè)位點(diǎn)的3種基因型頻率