核酸測(cè)序法檢測(cè)HCV基因型及分子流行病學(xué)研究.pdf

1、目的：
　　丙型肝炎病毒(HCV)感染所致丙型肝炎為全球傳染性疾病，是導(dǎo)致慢性肝病、肝硬化和肝細(xì)胞癌的主要原因之一。HCV基因型在HCV感染、傳播、預(yù)后及抗病毒治療效果等方面有重要意義，同時(shí)能夠給流行病學(xué)研究提供重要依據(jù)。HCV基因組具有高度的變異性，根據(jù)基因組核苷酸序列的差異，HCV被分為6種基因型。近年來，雖然國(guó)內(nèi)關(guān)于HCV基因型分布的報(bào)道逐漸增多，但存在地域性差異及選用分型方法不同等問題。因此，為了更好的了解中國(guó)HCV的分子

2、流行病學(xué)特征，我們使用核酸測(cè)序法對(duì)國(guó)內(nèi)11個(gè)省份的307例HCV標(biāo)本進(jìn)行基因型檢測(cè)，通過分析本研究結(jié)果，深入地探討我國(guó)HCV基因型及亞型的地域分布以及分子流行病學(xué)特征，為中國(guó)的HCV感染的相關(guān)研究提供有價(jià)值的資料。
　　方法：
　　收集307份來自我國(guó)不同地區(qū)的HCV感染者血清標(biāo)本，使用HCV核酸定量檢測(cè)試劑提取HCV RNA，實(shí)時(shí)PCR定量檢測(cè)HCV RNA載量；同時(shí)使用RNA提取試劑提取HCV RNA，反轉(zhuǎn)錄PCR法擴(kuò)增

3、HCV Core/E1區(qū)基因片段，對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序，然后使用NCBI基因分型工具確定基因亞型，分析我國(guó)基因型與基因亞型的地域分布特征，以及基因型與宿主性別、年齡和病毒載量的關(guān)系。
　　結(jié)果：
　　1.在307例HCV標(biāo)本中，共檢測(cè)出6個(gè)基因亞型，1b型占50.8％(156/307)，2a型占19.9％(61/307)，3a型占10.7％(33/307)，3b和6a型各占8.1％(25/307)；1a型占2.3％(7/307

4、)，3a、3b、6a和1a型合計(jì)占29.3％(90/307)。
　　2.296例可測(cè)得載量的HCV標(biāo)本，80.7％(239/296)的標(biāo)本屬于高HCV RNA載量組(>106IU/mL)。在高、中、低載量組中，1b型均有較高檢出率，但中載量組(500-106IU/mL)中以2a型檢出為主，占58.5％(24/41)。
　　3.HCV基因型與地域分布、性別、年齡
　　(1)地域分布：HCV基因亞型分布表現(xiàn)出地域性差異，各

5、省份HCV基因型檢出率有所差別。南方以1b型為主，占50.0％(97/194)，其次為3a型，占16.0％(31/194)；北方以1b型為主要基因型，占52％(59/113)，其次為2a型，占42.5％(48/113)；南北方之間，HCV基因型分布存在差異(P<0.01)。
　　(2)性別分布：性別資料明確的286例標(biāo)本，男女基因型分布總體上無顯著差異(χ2=7.102，p>0.05)，6a型在男女間分布存在顯著差異(χ2=8.7

6、41，p<0.01)，男女間其他基因型分布沒有差異(p>0.01)。
　　(3)年齡分布：年齡資料明確的274例HCV標(biāo)本，基因型在各年齡分布存在顯著差異(χ2=62.322，p<0.05)。1b、2a型在各年齡組檢出率均較高，主要分布在≥31歲以上患者中；21-30歲和31-40歲年齡組中，基因型分布趨于均衡，1b和2a兩型分別占44％和50％，非1b、2a型感染總和≥50％。
　　結(jié)論：
　　本研究結(jié)果表明，在我國(guó)