合浦珠母貝選育群體的遺傳多樣性評價.pdf

1、合浦珠母貝（Pinctada fucata）是養(yǎng)殖海水珍珠的主要貝類之一。近年來，合浦珠母貝頻頻出現(xiàn)大量死亡、個體小型化等現(xiàn)象。因此，近年來相繼開展了合浦珠母貝的遺傳改良計劃。為了保障遺傳改良的可持續(xù)性，必須充分了解選育種群或家系的遺傳結(jié)構(gòu)與遺傳多樣性。微衛(wèi)星標(biāo)記是種群遺傳分析的重要手段，為此，本論文開展了微衛(wèi)星標(biāo)記篩選與合浦珠母貝選育種群的遺傳分析，以期為合浦珠母貝的良種選育提供理論指導(dǎo)。主要結(jié)果如下：
　　1.合浦珠母貝微衛(wèi)星

2、標(biāo)記篩選。基于合浦珠母貝轉(zhuǎn)錄組部分測序結(jié)果設(shè)計引物，用合浦珠母貝野生群體篩選了微衛(wèi)星分子標(biāo)記，結(jié)果獲得20對有多態(tài)位點(diǎn)的微衛(wèi)星標(biāo)記。每個位點(diǎn)等位基因數(shù)目為2-6個，觀測雜合度為0.0263-1.0000，期望雜合度為0.0506-0.7424，有10個微衛(wèi)星位點(diǎn)極顯著地偏離了哈迪-溫伯格平衡（P<0.01）。基于合浦珠母貝基因草圖結(jié)果設(shè)計微衛(wèi)星引物，用合浦珠母貝野生群體篩選微衛(wèi)星分子標(biāo)記，結(jié)果獲得15對有多態(tài)位點(diǎn)的微衛(wèi)星標(biāo)記。每個位點(diǎn)等

3、位基因數(shù)目為3-8個，觀測雜合度為0.1154-0.6216，期望雜合度為0.490-0.8491，有14個微衛(wèi)星位點(diǎn)極顯著的偏離了哈迪-溫伯格平衡（P<0.01）。本研究篩選的35個微衛(wèi)星多態(tài)位點(diǎn)，可用于合浦珠母貝群體遺傳多樣性分析和分子標(biāo)記輔助選育等方面。
　　2.選育群體的遺傳多樣性與生長性狀相關(guān)分析。對2012年3月構(gòu)建的12個合浦珠母貝群體使用35對微衛(wèi)星標(biāo)記進(jìn)行了性狀相關(guān)分析。5個微衛(wèi)星標(biāo)記與合浦珠母貝的生長性狀顯著相

4、關(guān)，對體重性狀有正效應(yīng)的位點(diǎn)共3個位點(diǎn)6種基因型，對殼長有正效應(yīng)的位點(diǎn)共有5個位點(diǎn)8種基因型，對殼高性狀呈正效應(yīng)的位點(diǎn)共3個位點(diǎn)8種基因型，對殼寬性狀呈正效應(yīng)的位點(diǎn)共4個位點(diǎn)7種基因型。
　　3.選育群體的遺傳多樣性分析。對2012年3月和2012年6月構(gòu)建的兩批共17個合浦珠母貝群體進(jìn)行遺傳多樣性分析。6對微衛(wèi)星引物在17個群體共680個個體中檢測到29個等位基因，每個位點(diǎn)的等位基因數(shù)在2-7之間，平均有效等位基因數(shù)在2.06-

5、3.07之間，平均觀測雜合度在0.31-0.58之間，平均期望雜合度在0.46-0.65之間，平均多態(tài)信息含量在0.39-0.58之間，高度多態(tài)（PIC≥0.50）群體有11個（占64.7％）。Hardy-Weinberg平衡檢驗（卡方檢驗）的結(jié)果顯示，在檢測得到的102個數(shù)據(jù)結(jié)果中，有53個（占52.0%）極顯著地偏離了Hardy-Weinberg遺傳平衡（P<0.01）。從遺傳偏離指數(shù)（D）的結(jié)果可以看出，17個群體在不同的微衛(wèi)星位

6、點(diǎn)存在不同程度的雜合子缺失現(xiàn)象。
　　4.群體遺傳結(jié)構(gòu)與性狀表現(xiàn)的相關(guān)性。利用6對微衛(wèi)星引物分析合浦珠母貝12個選育群體的遺傳多樣性，分別從個體和群體遺傳結(jié)構(gòu)的角度探討遺傳多樣性與群體性狀表現(xiàn)的相關(guān)性。結(jié)果顯示，12個群體的平均雜合度與各個群體的體重、殼長、殼高、殼寬之間呈正相關(guān)關(guān)系，R2分別為0.2779、0.0721、0.0344、0.3071。3個群體（群體DS22、DY27、SY29）的個體雜合度與體重之間呈負(fù)相關(guān)關(guān)系，線