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文檔簡介
1、背景:
精子發(fā)生是一項涉及精原細胞有絲分裂,精母細胞減數(shù)分裂及精子變形的復雜生物學過程。在精子發(fā)生中,這些環(huán)節(jié)受到一系列基因的調(diào)控。其中任何一個環(huán)節(jié)發(fā)生錯誤,都有可能導致精子發(fā)生的異常,甚至會導致雄性不育,這已經(jīng)被各種來自臨床及實驗動物模型的數(shù)據(jù)所證實。
精子發(fā)生機制非常復雜,受到轉(zhuǎn)錄水平與轉(zhuǎn)錄后水平多層次的調(diào)控。其中磷酸化修飾,一種被廣泛研究并在多種通路中發(fā)揮作用的修飾,在精子發(fā)生過程中也發(fā)揮著重要調(diào)控作用。因此,
2、在睪丸中系統(tǒng)分析磷酸化修飾對深入研究精子發(fā)生的分子調(diào)控是十分必要的。之前的研究已經(jīng)幫助我們對磷酸化修飾在精子發(fā)生中的作用有一定的認識。而另一方面,隨著高分辨率、大規(guī)模質(zhì)譜儀器的發(fā)展和應用,蛋白質(zhì)組學可以幫助我們?nèi)笆降牧私饩影l(fā)生。構建睪丸磷酸化蛋白譜系,是通過蛋白質(zhì)組學研究精子發(fā)生中磷酸化修飾的一種直接有效的方式。然而,目前為止,小鼠中僅有3周的磷酸化蛋白質(zhì)譜系的研究,人睪丸磷酸化蛋白質(zhì)位點的組成及調(diào)控機制亦未見報道。
研究
3、方法與結果:
在本研究中,我們利用高分辨率的LTQ Orbitrap Velos質(zhì)譜儀器,基于IMAC與TiO2兩種磷酸化肽段富集策略,在成年小鼠睪丸中鑒定到17829個磷酸化位點,對應3955個磷酸化蛋白質(zhì)。對譜系數(shù)據(jù)進行初步分析表明,富集到的磷酸化位點殘基的絲氨酸(pS),蘇氨酸(pT)及酪氨酸(pY)的比例約為82%,16%及2%,共有48.31%的磷酸化位點在IMAC及TiO2富集中均鑒定到。通過進一步生物信息學分析,
4、發(fā)現(xiàn)在本研究的三種(Total,IMAC及TiO2)數(shù)據(jù)統(tǒng)計均顯示為精子發(fā)生(GO:0007283)為最顯著富集。蛋白的自體磷酸化(GO:0046777)也顯示顯著富集,這些結果說明在睪丸中,磷酸化調(diào)控是大量存在的。通過構建睪丸中激酶及其底物磷酸化位點網(wǎng)絡進行磷酸化位點分析,我們預測了與精子發(fā)生相關的重要調(diào)控性激酶及其底物調(diào)控關系。盡管兩種富集方法鑒定得到的磷酸化位點只有大約50%的重合率,但對底物對應的激酶活性程度分析結果顯示,pol
5、o-like激酶在兩種富集方法中都顯示出顯著高活性,因此,我們推測polo-like激酶在精子發(fā)生中有重要功能。通過western blot檢測PLK1激酶活性位點pT210磷酸化水平確定PLK1在睪丸中和其余組織中的不同活性。實驗結果與預測結果一致,PLK1在睪丸中的活性隨著睪丸的成熟增加,并且比同周齡的其他組織中PLK1具有更高活性。體外實驗中,在精母細胞系GC2中進行抑制實驗,結果顯示PLK1-3的活性調(diào)控細胞周期。
在
6、構建了小鼠睪丸磷酸化蛋白質(zhì)譜系的基礎上,調(diào)整了IMAC與TiO2富集方式與一維分離策略,進一步對成年人睪丸的磷酸化修飾蛋白質(zhì)進行分析,共鑒定到16364個磷酸化位點,對應4683個磷酸化蛋白質(zhì)。兩種方法富集到的磷酸化位點殘基的絲氨酸(pS),蘇氨酸(pT)及酪氨酸(pY)的比例約為86%,12%及2%。GO分析顯示,有絲分裂細胞周期(GO:0000278),基因表達(GO:0010467),RNA剪切(GO:0008380),有絲分裂(
7、GO:0007067),蛋白質(zhì)磷酸化(GO:0006468)及精子發(fā)生(GO:0007283)均呈現(xiàn)顯著富集。對本研究中鑒定到的磷酸化位點構建激酶及其底物磷酸化位點網(wǎng)絡,結果顯示,大于60%的激酶對應不僅一個底物,這說明磷酸化激酶是復雜的多重調(diào)控。將小鼠睪丸磷酸化蛋白質(zhì)譜系與人睪丸磷酸化蛋白質(zhì)譜系進行磷酸化位點序列同源分析,結果顯示,以人睪丸磷酸化位點為背景,30.1%的位點為人和小鼠同源的磷酸化位點,39.5%的基因可表達人和小鼠磷酸
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