中國部分地方黃牛品種遺傳多樣性研究.pdf

1、本研究以中國部分地方黃牛皖南牛、吉安黃牛、威寧黃牛、務(wù)川黑牛、隆林黃牛、潿洲黃牛、秦川牛、迪慶黃牛、三江牛、徐聞牛和三個(gè)引進(jìn)品種西門塔爾牛、夏洛來牛、德國黃牛為研究對(duì)象，采用聯(lián)合國糧農(nóng)組織(FAO)和國際動(dòng)物遺傳學(xué)會(huì)(ISAG)聯(lián)合推薦的15對(duì)微衛(wèi)星DNA引物，以ABI3100-Avant全自動(dòng)基因序列分析儀為平臺(tái)，結(jié)合熒光．多重PCR技術(shù)，檢測了10個(gè)中國地方黃牛和3個(gè)引進(jìn)品種，共計(jì)756個(gè)個(gè)體的基因型，并對(duì)標(biāo)記后擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行序列分析

2、。通過計(jì)算等位基因數(shù)和頻率、特有等位基因數(shù)、雜合度、多態(tài)信息含量、有效等位基因數(shù)、Nei氏遺傳距離(D<,A>)和Nei氏標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離(D<,S>)，采用非加權(quán)組平均法等方法，分析了中國地方黃牛群體內(nèi)和群體間的遺傳變異。結(jié)果如下： 1、在15個(gè)微衛(wèi)星座位上共檢測到了242個(gè)等位基因，每個(gè)座位平均等位基因是16.1個(gè)，UKSTS034座位的等位基因最多，達(dá)到26個(gè)，ILSTS054和BM1824座位的等位基因最少，為10個(gè)，其余座

3、位等位基因在11～22之間。13個(gè)黃牛品種中，平均等位基因數(shù)在7～11個(gè)，三江牛和西門塔爾牛、德國黃牛的平均等位基因數(shù)最少，威寧黃牛、務(wù)川黑牛和隆林黃牛的平均等位基因數(shù)最多。13個(gè)黃牛品種的遺傳多樣性豐富，遺傳變異較大。 2、在13個(gè)黃牛品種中，共發(fā)現(xiàn)32個(gè)特有等位基因，除務(wù)川黑牛、隆林黃牛和德國黃牛沒有特有等位基因，其他黃牛都至少在某一微衛(wèi)星座位上有一特有等位基因，其中秦川牛和迪慶黃牛的特有等位基因數(shù)最多，達(dá)到5個(gè)。在15個(gè)微

4、衛(wèi)星座位中，ILSTS054和SPS115兩個(gè)座位沒有發(fā)現(xiàn)特有等位基因，TGLA122的特有等位基因數(shù)最多，為6個(gè)。13個(gè)中外黃牛品種在15個(gè)微衛(wèi)星座位中的特有等位基因頻率都比較低，只有夏洛來牛在ETH185座位上的243bp等位基因頻率(0.052)和德國黃牛在TGLA122座位上的180bp等位基因頻率(0.112)大于0.05。13個(gè)中外黃牛品種在15個(gè)微衛(wèi)星座位中一共發(fā)現(xiàn)19個(gè)優(yōu)勢等位基因，等位基因頻率都大于0.50。

5、3、13個(gè)黃牛品種在15個(gè)微衛(wèi)星座位上，多態(tài)信息含量(PIC)、群體雜合度和有效等位基因數(shù)，分別為0.3232～0.8973，0.3340～0.9043和1.5016～10.4534。務(wù)川黑牛在ILSTS034座位上最高，西門塔爾牛在INRA032座位上最低。ILSTS034座位的平均多態(tài)信息含量和平均雜合度都最高，達(dá)到0.8250和0.8381，HEL13座位的最低，分別為0.6052和0.6479；迪慶黃牛的這三項(xiàng)指標(biāo)最高，分別為0

6、．7744，0.8003和5.3573，德國黃牛的最低，分別為0.6203，0.6651和3.3308。13個(gè)黃牛品種遺傳變異較大，迪慶黃牛的遺傳變異最大，德國黃牛最小。本研究所選用的15個(gè)微衛(wèi)星座位，屬于高度多態(tài)性座位，可以用于黃牛的遺傳多樣性的分析研究。 4、10個(gè)地方黃牛品種與3個(gè)引進(jìn)品種之間有很大差異，兩者之間的遺傳距離較大。10個(gè)地方黃牛品種中，皖南牛、吉安黃牛、隆林黃牛、潿洲黃牛和徐聞牛之問的遺傳距離都很小(D<,A

7、>為0.0646～0.1286，D<,S>為0.0356～0.0987)；而三江牛與其它地方黃牛品種間的遺傳距離較大，為0.1373～0.2647(D<,A>)和0.1628～0.3466(D<,S>)。在3個(gè)引進(jìn)品種之間的遺傳距離較小。 5、13個(gè)黃牛品種聚為三大類，第一類為皖南牛、吉安黃牛、隆林黃牛、潿洲黃牛和徐聞牛；第二大類為威寧黃牛、務(wù)川黑牛、迪慶黃牛、秦川牛和三江牛；第三大類為西門塔爾牛、夏洛來牛和德國黃牛三個(gè)外來品種