基于GSEA分析的犬膨大性心肌癥關(guān)鍵基因通路篩選.pdf

1、上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文基于基于GSEA分析的犬膨大性心肌癥關(guān)鍵基因通路篩選分析的犬膨大性心肌癥關(guān)鍵基因通路篩選碩士研究生：劉春慧學(xué)號(hào)：1101502022導(dǎo)師：潘玉春教授第二導(dǎo)師：楊長(zhǎng)鎖研究員申請(qǐng)學(xué)位：獸醫(yī)碩士學(xué)科：獸醫(yī)所在單位：農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院答辯日期：2012年5月授予學(xué)位單位：上海交通大學(xué)上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文I基于基于GSEA分析的犬膨大性心肌癥關(guān)鍵基因通路篩選分析的犬膨大性心肌癥關(guān)鍵基因通路篩選摘要犬膨大性心肌癥(DCM)是

2、以心室功能受損，心房室都顯著膨大為顯著特征的犬常見(jiàn)疾病。盡管此病的發(fā)病率非常高，但該疾病的的遺傳機(jī)制研究較少。本研究利用基因集富集分析(GSEA)的方法針對(duì)NCBI的GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中的DCM的表達(dá)芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，共發(fā)現(xiàn)與犬膨大性心肌癥相關(guān)的上調(diào)的基因85個(gè)，下調(diào)的基因19個(gè)。通過(guò)基因集富集分析得到與犬膨大性心肌癥相關(guān)的顯著上調(diào)的基因通路4個(gè)，顯著上調(diào)的GO集合15個(gè)。這些顯著的基因集合可作為犬膨大性心肌癥相關(guān)的候選通路，為進(jìn)一步進(jìn)行犬膨