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文檔簡介
1、目的:
micC是一種編碼小分子非編碼RAN(small non-coding RNA,sRNA)的基因,存在于多種革蘭陰性細菌基因組內(nèi)。micC位于E.coli基因組ompN與ybdK基因之間,其中ompN與ybdK轉(zhuǎn)錄方向一致,而與micC轉(zhuǎn)錄方向相反。micC啟動子位于ompN與micC基因間,長度為227個堿基對(base pair,bp)。該啟動子是否具有雙向轉(zhuǎn)錄活性還未知曉,micC的應激性表達仍有待進一步探索。本
2、文對micC啟動子的雙向轉(zhuǎn)錄活性、micC應激性表達進行了研究。
方法:
(1)本研究以大腸埃希菌DH5為實驗菌株,用天根生物科技公司產(chǎn)的試劑盒提取其基因組,以其為模板,設計引物分別擴增micC基因227bp、485bp的5'側(cè)翼序列,并分別正向、反向連接到質(zhì)粒pJRS462表達β-葡萄糖苷酸酶(be ta-gluc uro nidase,gus)報告基因的上游構(gòu)建報告載體,檢測攜帶各報告載體菌株的GUS活性。
3、> (2)在實驗(1)正反向啟動子都有活性的情況下,利用Red重組系統(tǒng)將各啟動子連同gus報告基因和卡那霉素抗性基因重組到DH5ɑ基因組上,對啟動子特性進行驗證。
?。?)檢測各重組菌在各種應激條件下的GUS活性,如溫度、酸堿度、滲透壓、抗生素、氧化應激刺激等。
結(jié)果:
?。?)250bp和500bp的DNA片段正向、反向插入到質(zhì)粒gus報告基因上游后,均檢測出gus基因表達,實驗組GUS活性是陰性對照組的兩
4、倍以上。
?。?)啟動子連同gus基因和篩選標記成功重組到DH5ɑ基因組上;重組菌進入穩(wěn)定生長期后GUS活性大幅度提高。
?。?)在不同應激環(huán)境下,各重組菌gus基因表達水平不盡相同:GUS活性隨著溫度升高而升高,隨著溫度的降低而降低;GUS活性隨著滲透壓的增高而降低;氧化應激條件下,正向啟動子誘導的GUS活性表達升高,而反向啟動子GUS活性無顯著變化;在pH應激下,GUS活性無明顯改變。
結(jié)論:
1
5、.介于micC與ompN基因間的DNA序列為一個雙向啟動子。
2.同一長度的啟動子其正、反向間的轉(zhuǎn)錄活性沒有差異。
3.細菌進入穩(wěn)定期后micC啟動子表達大幅度提高。
4. micC啟動子主要受溫度和滲透壓刺激的調(diào)節(jié):在溫度升高時,正反向啟動子表達都增高,反之都降低;正反向啟動子在高滲下表達都降低。
5.氧化應激促進正向啟動子表達,而對反向啟動子表達沒有影響。
6. micC啟動子對pH
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