應(yīng)用生物信息學(xué)篩選，Id2對(duì)人膠質(zhì)母細(xì)胞瘤化療藥物敏感性的影響.pdf

1、第二軍醫(yī)大學(xué)博士學(xué)位論文應(yīng)用生物信息學(xué)篩選，Id2對(duì)人膠質(zhì)母細(xì)胞瘤化療藥物敏感性的影響姓名：趙振宇申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：外科學(xué)（神經(jīng)外科）指導(dǎo)教師：盧亦成陳菊祥20100501第二軍醫(yī)大學(xué)博士學(xué)位論文第一部分應(yīng)用生物信息學(xué)篩選人膠質(zhì)母細(xì)胞瘤化療相關(guān)的基因目的：本部分實(shí)驗(yàn)旨在應(yīng)用生物信息學(xué)技術(shù)篩選影響膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者生存時(shí)間和化療藥物作用相關(guān)的基因。方法：對(duì)2批膠質(zhì)瘤患者Biostar基因芯片和1批膠質(zhì)瘤患者Affymetrix基因芯片

2、進(jìn)行分析。通過(guò)長(zhǎng)期隨訪，完善芯片中膠質(zhì)瘤患者的臨床資料。以生存時(shí)間12個(gè)月將膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者分為生存時(shí)間長(zhǎng)、短兩組，篩選兩組間差異基因及與化療藥物作用相關(guān)的差異基因，明確差異基因參與的功能和通路，并構(gòu)建與化療藥物作用相關(guān)基因參與的信號(hào)傳導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)，從而篩選出影響化療效果的核心基因。結(jié)果：2003年BIOSTAR芯片，2007年BIOSTAR芯片和2007Affymetrix芯片中GBM生存時(shí)間長(zhǎng)短兩組間與化療藥物相關(guān)的差異基因分別是429條

3、，74條，2018條。3批芯片的差異基因主要參與8l項(xiàng)基因功能，主要參與36條信號(hào)傳導(dǎo)通路。通過(guò)對(duì)差異基因功能、通路、網(wǎng)絡(luò)的分析，得到影響膠質(zhì)母細(xì)胞瘤化療藥物作用的核心基因29條。結(jié)論：通過(guò)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶?shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和科學(xué)的統(tǒng)計(jì)學(xué)判別，結(jié)合患者完整的生存資料，可應(yīng)用生物信息學(xué)對(duì)基因芯片的大量數(shù)據(jù)進(jìn)行挖掘和分析。篩選出29條影響GBM患者生存時(shí)間，影響GBM化療藥物作用的核心基因，為進(jìn)一步功能實(shí)驗(yàn)奠定基礎(chǔ)，為GBM患者的預(yù)后判斷和個(gè)性化治療提供依據(jù)。

4、關(guān)鍵詞：膠質(zhì)母細(xì)胞瘤，基因芯片，生物信息學(xué)，化療敏感性第二部分Id2在腦膠質(zhì)瘤組織和膠質(zhì)瘤細(xì)胞株中的表達(dá)研究目的：研究Id2在正常腦組織、不同級(jí)別腦膠質(zhì)瘤組織及膠質(zhì)細(xì)胞株和惡性膠質(zhì)瘤細(xì)胞株U87、U251、SHG44中的mRNA和蛋白表達(dá)水平。方法：應(yīng)用real—timePCR檢測(cè)Id2mRNA的在28例不同級(jí)別腦星形膠質(zhì)細(xì)胞瘤和4例正常腦組織以及膠質(zhì)細(xì)胞株和惡性膠質(zhì)瘤細(xì)胞株U87、U251、SHG44中的表達(dá)。應(yīng)用免疫組織化學(xué)染色檢測(cè)

5、Id2在56例腦星形膠質(zhì)細(xì)胞瘤組織和4例正常腦組織中的蛋白表達(dá)水平，應(yīng)用Westernblot檢測(cè)Id2的在28例不同級(jí)別腦星形膠質(zhì)細(xì)胞瘤和4例正常腦組織的蛋白表達(dá)水平。結(jié)果：real—timePCR結(jié)果提示Id2mRNA表達(dá)水平在星形膠質(zhì)瘤組織中明顯上調(diào)，與正常腦組織相比差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(43533532VS189116：P=O000)。Id2mRNA水平在高級(jí)別膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)水平明顯高于低級(jí)別膠質(zhì)瘤，二者之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(5