整合組學數(shù)據(jù)、尋找神經(jīng)膠質瘤相關通路.pdf

1、神經(jīng)膠質瘤是神經(jīng)系統(tǒng)最為常見的惡性腫瘤。神經(jīng)膠質瘤的發(fā)生、發(fā)展是一個多步驟、多階段、多基因參與的過程，伴隨著復雜的基因改變。微陣列技術具有高信息量、高通量等突出優(yōu)點，現(xiàn)已廣泛地應用于腫瘤機制的研究中。
　　 然而很多的研究都是關注疾病差異基因的表達，為了尋找神經(jīng)膠質瘤相關的重要生物通路，本文整合了神經(jīng)膠質瘤相關的組學數(shù)據(jù)，如基因表達譜芯片、MicroRNA芯片以及ChIP-Seq的數(shù)據(jù)，驗證了不同數(shù)據(jù)集的分子特征在系統(tǒng)水平上的相

2、似性高于基因水平的相似性這一假設，并發(fā)現(xiàn)了新穎的神經(jīng)膠質瘤相關通路，如：Regulation of epithelial-to-mesenchymal transition(EMT),TGF-beta-dependent induction of EMT via SMADs等。這些通路仍需要進一步的實驗驗證，同時也為神經(jīng)膠質瘤的臨床研究、個性化治療和分子機制研究提供有意義的信息。在差異基因篩選的過程中，本文采用了一種新穎的特征基因鑒別方