鼠疫耶爾森氏菌基因分型與適應(yīng)性微進(jìn)化研究.pdf

1、目的：細(xì)菌基因組進(jìn)化的分子策略包括點(diǎn)突變、基因組重排和基因水平轉(zhuǎn)移等。我們針對(duì)上述三種進(jìn)化機(jī)制對(duì)鼠疫耶爾森氏菌(以下簡(jiǎn)稱鼠疫菌)進(jìn)行了系統(tǒng)的分析與研究，為研究鼠疫菌的進(jìn)化規(guī)律和建立中國鼠疫菌基因分型系統(tǒng)提供科學(xué)依據(jù)。 方法：采用抑制削減雜交技術(shù)尋找古典型鼠疫菌特有的序列；通過對(duì)鼠疫菌和假結(jié)核菌基因組中IS序列插入位點(diǎn)進(jìn)行詳細(xì)的比較基因組學(xué)分析，選擇40個(gè)IS插入位點(diǎn)設(shè)計(jì)等位基因特異PCR引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。 結(jié)果：發(fā)現(xiàn)了

2、一個(gè)長383bp、天山山地灰旱獺、長尾黃鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌特有的DFR；根據(jù)40個(gè)IS插入位點(diǎn)的重排譜，將260株鼠疫菌分成33個(gè)基因型，這些菌株大多分布在13個(gè)基因型中，占89.2％(232/260)。這13個(gè)基因型與鼠疫菌的自然疫源地和生物型等密切相關(guān)；以260株鼠疫菌的差異片段(DFRs)譜、假基因譜和IS插入位點(diǎn)的重排譜為基礎(chǔ)建立了中國鼠疫菌基因分型系統(tǒng)；應(yīng)用該分型系統(tǒng)將中國902株鼠疫菌分成59個(gè)基因組型。 結(jié)論：

3、進(jìn)一步證實(shí)鼠疫菌由假結(jié)核菌進(jìn)化而來，天山山地灰旱獺、長尾黃鼠鼠疫自然疫源地可能是我國鼠疫菌和演化的源頭之一，北天山西段的溫泉縣可能就是鼠疫菌從中亞地區(qū)傳入我國的入口處。田鼠型鼠疫菌作為一個(gè)古老且獨(dú)特分支，其致病性和演化規(guī)律與其他鼠疫菌存在顯著差別。中國鼠疫菌基因分型系統(tǒng)簡(jiǎn)單可靠，基本上可以將中國各個(gè)鼠疫自然疫源地區(qū)分開。初步確定了中國鼠疫自然疫源地基因組型的分布狀況，并提出了主要基因組型和次要基因組型的概念。在疫源地?cái)U(kuò)張和鼠疫菌微進(jìn)化的