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文檔簡(jiǎn)介
1、海洋放線(xiàn)菌可產(chǎn)生多種結(jié)構(gòu)新穎、功能多樣的活性物質(zhì),是天然活性產(chǎn)物和新藥開(kāi)發(fā)的重要來(lái)源,因此日益受到人們的關(guān)注。鹵化酶修飾對(duì)多種天然產(chǎn)物的生理學(xué)活性具有重要影響,因此基于鹵化酶的基因篩選有助于快速發(fā)現(xiàn)新的鹵化抗生素,對(duì)新型鹵化酶的催化機(jī)制進(jìn)行研究,有助于利用鹵化酶進(jìn)行活性物質(zhì)的修飾,提高化合物活性。
本課題利用基于鹵化酶的基因篩選,從海洋放線(xiàn)菌菌種文庫(kù)中獲得了四株陽(yáng)性菌株,編號(hào)分別為L(zhǎng)131、S077、S104和S187。其中菌
2、株L131和S077的鹵化酶片段氨基酸序列與萬(wàn)古霉素生物合成基因簇中的鹵化酶相似性最高(71%),對(duì)這兩株菌株的抗菌活性進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)兩株菌株都可產(chǎn)生抗真菌活性物質(zhì),對(duì)白色念珠菌和番茄葉霉菌具有良好的拮抗活性。16S rRNA分析結(jié)果顯示,菌株L131與灰白鏈霉菌(Streptomyces canescens)同源性最高(99%),但其與灰白鏈霉菌在形態(tài)和生理生化特征方面存在一定差異。L131在Bennett培養(yǎng)基上生長(zhǎng)良好,菌落邊緣褶
3、皺,孢子為白色,基內(nèi)產(chǎn)淡黃色色素,不能夠利用阿拉伯糖和果糖作為菌種惟一碳源,且NaCl濃度的耐受范圍為0-110g/L,pH值的耐受范圍為7-11,可能與其更強(qiáng)的海洋環(huán)境適應(yīng)能力有關(guān)。通過(guò)培養(yǎng)基優(yōu)化確定了最佳液體發(fā)酵培養(yǎng)基(玉米粉15.0 g/L,大豆粉15.0 g/L,酵母浸粉1.5 g/L,CaCO30.5 g/L,甘油0.2%,pH自然),在該培養(yǎng)基培養(yǎng)72 h,發(fā)酵液具有較好抑制白色念珠菌活性,且活性物質(zhì)能夠在pH5-10的范圍
4、內(nèi)穩(wěn)定,同時(shí)比乙酸乙酯極性大。進(jìn)一步提出了活性物質(zhì)粗提物的純化路線(xiàn):使用AB-8大孔吸附樹(shù)脂吸附離心后的L131發(fā)酵液上清,使用40%甲醇去除未被吸附物質(zhì),再使用100%甲醇洗脫活性物質(zhì),粗提物對(duì)白色念珠菌和番茄葉霉菌的最小抑菌濃度均為32.0μg/mL,同時(shí)該活性物質(zhì)能夠造成番茄葉霉菌細(xì)胞膜、孢子損傷和ROS的大量積累。
對(duì)星海鏈霉菌S187(Streptomyces xinghaiensis)的鹵化酶SinH功能進(jìn)行了深入
5、研究,氨基酸序列分析顯示,其與替考拉寧生物合成基因簇的鹵化酶StaI和StaK相似性最高(87%)。為獲得可溶的鹵化酶,在大腸桿菌(Escherichia coli) DE3中進(jìn)行了SinH的體外異源表達(dá),研究了蛋白可溶表達(dá)的條件。pET28a表達(dá)載體得到的為不可溶鹵化酶蛋白,因此構(gòu)建帶有融合標(biāo)簽泛素和自剪切內(nèi)含肽的pHUIE-sinH表達(dá)載體,誘導(dǎo)獲得了可溶的目標(biāo)蛋白,并分離純化獲得目標(biāo)蛋白SinH,但純度較低。構(gòu)建含有鏈霉菌分子伴侶
6、的共表達(dá)體系BL21/pET28a-sinH/pETcoco-pL ISL2,誘導(dǎo)獲得可溶目標(biāo)蛋白,使用Ni-NTA親和層析分離純化獲得目標(biāo)蛋白SinH,構(gòu)建pET28a-fre表達(dá)載體,并誘導(dǎo)表達(dá)分離純化獲得目標(biāo)蛋白黃素還原酶Fre。利用L-Tyr、D-Tyr、L-Trp、D-Trp、4-hydroxy-D-phenylglycine作為底物對(duì)鹵化酶SinH進(jìn)行酶活檢測(cè)均未檢測(cè)到酶活,推斷SinH的底物不是游離氨基酸,其作用于生物合成
7、稍后的步驟。
進(jìn)一步利用基因破壞對(duì)鹵化酶SinH的功能進(jìn)行研究,使用λ-Red以及結(jié)合轉(zhuǎn)移的方法,獲得了sinH的破壞子△sinH,破壞子的抗補(bǔ)體活性與野生型在4d基本一致,在6d、8d時(shí)高于野生型,同時(shí),△SinH破壞子發(fā)酵液具有更強(qiáng)的抑制金黃色葡萄球菌和鮑曼不動(dòng)桿菌的活性,推斷產(chǎn)生的脫鹵類(lèi)似物具有更強(qiáng)的抗菌活性,與以往的報(bào)道中鹵化提高化合物活性的結(jié)論不一致。通過(guò)HPLC分析發(fā)現(xiàn)野生型S187的出峰時(shí)間為7.842 min的
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