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文檔簡介
1、木薯(Manihot esculenta Crantz),是一種重要的熱帶塊根作物,由于具有抗旱、耐貧瘠的特點(diǎn),是熱帶及亞熱帶干旱貧瘠地區(qū)主要的糧食來源。但目前有關(guān)木薯抗旱機(jī)制的研究相對較少,尤其是相關(guān)基因的功能研究還鮮見報道。前期研究表明木薯在受到干旱脅迫時,其谷氧還蛋白基因(GRX)以及DREB1D基因被顯著誘導(dǎo),但GRX和DREB1D在木薯抗旱中的作用還不清楚。本文中系統(tǒng)研究了木薯基因組內(nèi)的eGRXs基因家族,同時通過遺傳轉(zhuǎn)化體系
2、對MeGRXs以及MeDREB1D基因進(jìn)行抗旱功能分析。主要結(jié)果如下:
1.通過與擬南芥GRX序列比對,從木薯基因組中篩選出38個MeGRXs。遺傳進(jìn)化樹分析顯示,38個MeGRXs可劃分為四類,分別為CC-type、CPYC、CGFS和GRL,植物特有CC-type GRX含有17個MeGRXs基因,占比最高。表達(dá)譜分析顯示,17個 CC-type MeGRXs中14個受干旱誘導(dǎo)表達(dá),其中6個(MeGRX232、MeGRX3
3、60、MeGRX785、MeGRX058、MeGRX892和MeGRX496)在木薯抗旱品種SC124葉片中顯著上調(diào)表達(dá)。
2.將MeGRX785和MeGRX058過表達(dá)及RNA干涉轉(zhuǎn)基因木薯本體進(jìn)行抗旱功能分析,結(jié)果顯示過表達(dá)MeGRX785木薯植株對干旱敏感,而RNA干涉MeGRX785木薯植株提高了植株的抗旱性。與MeGRX785不同,過表達(dá)MeGRX058轉(zhuǎn)基因木薯提高了植株抗旱性,而RNA干涉植株表現(xiàn)為對干旱敏感。同
4、時將MeGRX785和MeGRX058轉(zhuǎn)化擬南芥進(jìn)行抗旱性分析,結(jié)果顯示與轉(zhuǎn)基因木薯抗旱評價結(jié)果一致,過表達(dá)MeGRX785擬南芥植株對干旱敏感,而過表達(dá)MeGRX058擬南芥抗旱,表明以擬南芥為模式植物對木薯MeGRXs基因進(jìn)行功能分析具有可行性?;谏鲜鼋Y(jié)果,采用擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化進(jìn)行MeGRX232和MeGRX360抗旱功能分析,結(jié)果顯示過表達(dá)MeGRX232擬南芥植株對ABA敏感較弱,對干旱敏感,而過表達(dá)MeGRX360擬南芥對干旱
5、表現(xiàn)出一定的抗性,與MeGRX785和MeGRX058抗旱功能差異具有對應(yīng)性,表明不同MeGRX基因?qū)δ臼淼目购嫡{(diào)節(jié)具有不同的作用機(jī)制。對轉(zhuǎn)基因植株進(jìn)行相關(guān)基因表達(dá)譜分析顯示,與乙稀調(diào)控相關(guān)的ERF、GA2OX6等基因在過表達(dá)MeGRX232和MeGRX785轉(zhuǎn)基因擬南芥植株中表現(xiàn)為上調(diào)表達(dá),可能對兩者在干旱負(fù)調(diào)控作用中起著一定作用,也表明MeGRX可能通過乙稀信號途徑對木薯植株進(jìn)行干旱調(diào)控。
3.對MeGRX785和MeGR
6、X058基因抗旱功能差異進(jìn)行分析,蛋白序列比對顯示,MeGRX785和MeGRX058 C末端ALWL元件的差異,可能是兩者抗旱功能差異的主要原因。將兩者轉(zhuǎn)化酵母菌株進(jìn)行轉(zhuǎn)錄自激活顯色檢測,發(fā)現(xiàn)MeGRX785酵母轉(zhuǎn)化菌株具有自激活顯色現(xiàn)象,而MeGRX058沒有,與木薯抗旱功能的差異具有對應(yīng)性。對MeGRX785和MeGRX058 ALWL元件進(jìn)行氨基酸刪除和突變分析,結(jié)果顯示刪除MeGRX785 ALWL元件及將ALWL第一個丙氨酸
7、(A)突變?yōu)楦拾彼?G)將使MeGRX785失去轉(zhuǎn)錄自激活現(xiàn)象,但將MeGRX058 ALWL元件的第一個G突變A,MeGRX058產(chǎn)生轉(zhuǎn)錄自激活現(xiàn)象,因此得出ALWL元件對MeGRX785的功能作用具有重要作用,且ALWL元件中A位點(diǎn)的差異是引起MeGRX785和MeGRX058功能差異的主要原因。將MeGRX058 ALWL元件突變序列(058mC)轉(zhuǎn)基因擬南芥進(jìn)行抗旱性評價,結(jié)果表明突變序列產(chǎn)生了對干旱的敏感性,驗(yàn)證了ALWL元件
8、中A位點(diǎn)的差異是引起MeGRX785和MeGRX058抗旱功能差異的主要原因。利用氨基酸突變結(jié)合酵母遺傳轉(zhuǎn)化對MeGRX785中的CDMC、L**LL和P****G蛋白結(jié)構(gòu)域進(jìn)行功能分析顯示,刪除L**LL元件的后兩個L或?qū)⒑髢蓚€L替換成天冬氨酸(NN),將P****G元件突變?yōu)長****G和P****D以及將CDMC突變?yōu)锳DMA也均使MeGRX785失去轉(zhuǎn)錄自激活現(xiàn)象。將MeGRX785 L**LL和P****G元件突變序列(785
9、mLL和785mG)轉(zhuǎn)基因擬南芥進(jìn)行抗旱性評價,結(jié)果顯示突變序列失去對干旱的敏感性,表明MeGRX785功能是各結(jié)構(gòu)域綜合作用的結(jié)果。比較MeGRX232和MeGRX360蛋白序列顯示,兩者功能結(jié)構(gòu)域無明顯差異,但兩者的亞細(xì)胞定位不同,其中MeGRX232定位在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中,MeGRX360主要定位在細(xì)胞核中,而是否為其功能差異的原因還有待進(jìn)一步研究。
4.表達(dá)譜分析顯示MeDREB1D受干旱誘導(dǎo)上調(diào)表達(dá),基因克隆測序獲得
10、兩個等位基因MeDREB1D(R-2)和MeDREB1D(Y-3),序列分析顯示兩者在NLS結(jié)構(gòu)域上有1個氨基酸的差異。亞細(xì)胞定位顯示MeDREB1D(R-2)主要定位在細(xì)胞核中,但MeDREB1D(Y-3)定位在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中??剐苑治鲲@示,過表達(dá)MeDREB1D(R-2)和MeDREB1D(Y-3)轉(zhuǎn)基因擬南芥均可提高植株的抗旱性和抗寒性。但過表達(dá)MeDREB1D(R-2)擬南芥在正常條件下表現(xiàn)為矮化表型和開花延遲現(xiàn)象,而MeDR
11、EB1D(Y-3)與野生型無明顯差異。對轉(zhuǎn)基因植株進(jìn)行RNA-Seq分析顯示,多個POD基因在轉(zhuǎn)基因植株中顯著上調(diào)表達(dá),可能是轉(zhuǎn)基因植株抗旱及抗寒性提高的原因。通路分析顯示MeDREB1D(R-2)和MeDREB1D(Y-3)在“Photosynthesis”和“Photosynthesis-antenna proteins”通路富集差異較大,MeDREB1D(R-2)轉(zhuǎn)基因植株在兩條通路中有28個基因下調(diào)表達(dá),但MeDREB1D(Y-
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