結(jié)腸直腸癌相關(guān)差異基因表達譜的薈萃分析.pdf

1、蘇州大學碩士學位論文結(jié)腸直腸癌相關(guān)差異基因表達譜的薈萃分析姓名：史丹華申請學位級別：碩士專業(yè)：應用數(shù)學指導教師：沈百榮20100401英義摘要 結(jié)腸直腸j ；；；相關(guān)差異摶I 訇表達講的薈萃分析M e t a - - a n a l y s i s o f t h e d i r e n t i a l l ye x p r e s s e d c o l o r e c t a lc a n c e r - r e l a t e d

2、 g e n ee x p r e s s i o np r o f i l e sA b s t r a c tT h eo c c u r r e n c ea n dd e v e l o p m e n to f c o l o r e c t a l c a n c e ri s a c o m p l e xp r o c e s so fs t e p s ，p h a s e sa n d p o l y g e n e

3、 ．W ed i dd a t ap r e p r o c e s s i n g o f t h ef i v em i c r o a r r a yd a t a s e t so f c o l o r e c t a lc a n c e r t h a tw e r ef r o mt h ep u b l i cd a t a b a s e ( G E O ) b y b i o i n f o r m a t i c

4、 st o o l si n t h i s a r t i c l e ，C a n c e r O u t l i e r P r o f i l e A n a l y s i s W a su s e d t o s e l e c t d i f f e r e n t i a l l ye x p r e s s e dg e n e s ，a n dK E G G a n dG e n e G Od a t a b a s

5、 ew e r eu s e dt os e a r c h t h ep a t h w a y sw h i c hw e r er e l a t e dt ot h ed i f f e r e n t i a l l ye x p r e s s e dg e n e s ．W i t h t h eG e n e G Od a t a b a s e ，t h er a t e w h i c hg e n eo v e r

6、 l a p i s l e s st h a np a t h w a yo v e r l a pi s 7 0 ％． 10 5o ft h e2 6 2p a t h w a y sw e r ec o n f i r m e dt ob er e l a t e dt oe o l o r e c t a lc a n c e r ，a n df o u rp a t h w a y sw e r es h a r e d i

7、nf o u rd a t a s e t s a t l e a s t ．1 9 ．2 p e r c e n to fg e n e si n t h e ( L ) - s e l e n o a m i n o a c i d si n c o r p o r a t i o ni np r o t e i n s d u r i n gt r a n s l a t i o n p a t h w a yw a sc o n

8、 f i r m e dt o b er e l a t e d t oe o l o r e c t a lc a n c e r ．T h i s p a t h w a ym a y b ea n e w c o l o r e c t a lc a n c e r - r e l a t e dp a t h w a y ，b u t i tn e e d sf u r t h e r e x p e r i m e n t a

9、 l t e s t i n g ．T h r o u g hm e t a —a n a l y s i so fm i c r o a r r a y e x p r e s s i o np r o f i l i n g s a t p a t h w a y l e v e l ，w e v e r i f i e dt h a tt h e a n a l y s i sa t p a t h w a yl e v e l

10、i s m o r er e p r o d u c i b l et h a nt h a ta tg e n el e v e l ．A n di t i sm e a n i n g f u lt o u n d e r s t a n d t h em o l e c u l a rm e c h a n i s m o f o c c u r r e n c ea n d d e v e l o p m e n to f c

11、o l o r e c t a lc a n c e r m o r e b e t t e r ．K e y w o r d s ：c o l o r e c t a lc a n c e r ' d i f f e r e n t i a l l ye x p r e s s e d g e n e s ，m e t a —a n a l y s i s ，p a t h w a ye n r i c h m e n ta