賽葵上雙生病毒的分子鑒定.pdf

1、粉虱傳雙生病毒病(Whitefly-transmittedgeminiviruses，WTGVs)是世界多種經(jīng)濟(jì)作物生產(chǎn)上重要病害之一，己給39個(gè)國家的作物生產(chǎn)造成了嚴(yán)重?fù)p失。近年來在云南、海南、廣東等局部地區(qū)持續(xù)流行，但在福建地區(qū)僅有發(fā)生煙草曲葉病毒的報(bào)道。田間調(diào)查發(fā)現(xiàn)，福建地區(qū)普遍存在的雜草賽葵(Malvastrumcoromandelianum)表現(xiàn)出典型的雙生病毒癥狀。經(jīng)設(shè)計(jì)通用引物、PCR擴(kuò)增、克隆和測序，首次從分子水平鑒定了

2、雜草賽葵上的雙生病毒。 從雜草賽葵上采集了2組病毒樣本Fz1和Fs1，用雙生病毒通用引物PA、PB對雜草樣本進(jìn)行特異性的PCR檢測，結(jié)果發(fā)現(xiàn)：賽葵樣本Fz1和Fs1都出現(xiàn)約500bp的條帶，說明這些雜草賽葵上存在雙生病毒。PCR產(chǎn)物測序進(jìn)行序列比較發(fā)現(xiàn)：2組賽葵樣本上病毒之間的差異極小，核苷酸序列同源性大約為96％，因此推測：這兩組賽葵樣本可能是由同一種病毒侵染。在此基礎(chǔ)上，我們對賽葵Fz1樣品中雙生病毒的全基因組進(jìn)行了研究。

3、 對賽葵樣本Fz1DNA-A進(jìn)行了克隆和序列測定，F(xiàn)z1DNA-A全長2741個(gè)核苷酸(nt)。Fz1DNA-A基因組結(jié)構(gòu)具有典型的粉虱傳雙生病毒特征：共編碼6個(gè)開放閱讀框(ORFs)，其中病毒鏈編碼AV1(CP)和AV2兩個(gè)ORFs，互補(bǔ)鏈編碼AC1(Rep)、AC2、AC3和AC4四個(gè)ORFs。經(jīng)NCBI檢索和序列比較分析發(fā)現(xiàn)，F(xiàn)z1與廣東番木瓜曲葉病毒分離物(PaCuLGDV-[GD2]，AJ558122)的同源性最高，為8

4、6.14％，與中國番木瓜曲葉病毒(PaCuLCNV，AY650283)同源性次之，而與其它雙生病毒的同源性均在83％以下。根據(jù)“雙生病毒科病毒全基因組核苷酸序列同源性小于89％，往往定名為不同病毒；大于89％，則認(rèn)為是同一病毒的不同株系”這一原則，F(xiàn)z1為雙生病毒的一種新種，根據(jù)病毒分類委員會(huì)命名原則，我們將該病毒命名為福建番木瓜曲葉病毒，英文名為PapayaculrleafFujianvirus，簡稱PaCuLFJV。這是首次報(bào)道番木