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1、研究背景:布加綜合征(Budd Chiari syndrome, BCS)是血管外科的疑難病,也是我國(guó)血管外科的常見(jiàn)病,其自然預(yù)后較差,出現(xiàn)癥狀后的5年生存率很低,非手術(shù)治療死亡率高。因缺乏早期特異性臨床表現(xiàn)和有效的早期檢測(cè)手段,患者就診時(shí)多已屬晚期,嚴(yán)重影響其治療效果,愈后常欠佳,故如何提高BCS的早期診斷率是提高患者生存與預(yù)后的關(guān)鍵問(wèn)題。BCS的病因和發(fā)生機(jī)制尚不明確,目前國(guó)內(nèi)外對(duì) BCS研究主要集中于肝靜脈型,對(duì)下腔靜脈隔膜型(m
2、embranous obstruction of the inferior vena cava, MOVC)的研究較少。本課題以MOVC患者為研究對(duì)象,在國(guó)內(nèi)首次以外周血檢測(cè)作為切入點(diǎn),應(yīng)用基因芯片技術(shù)比較MOVC患者與正常人外周血單個(gè)核細(xì)胞的基因表達(dá),篩選出患者與正常人外周血單個(gè)核細(xì)胞的差異基因表達(dá)譜,旨在較全面了解MOVC疾病過(guò)程中基因的表達(dá)情況,深入研究其相關(guān)基因的生物功能,以期能發(fā)現(xiàn)早期診斷MOVC和判斷其預(yù)后的標(biāo)志基因,并為發(fā)
3、現(xiàn)早期篩查的血液標(biāo)志物做初步探討。
研究目的:本文利用Affymetrix公司的基因表達(dá)譜芯片對(duì)MOVC患者和正常人外周血單個(gè)核細(xì)胞的表達(dá)譜進(jìn)行研究,篩選MOVC相關(guān)基因,并對(duì)這些基因的功能進(jìn)行初步的分析,為MOVC的臨床診斷和治療提供新的途徑。
研究方法患病組和正常對(duì)照組各3例。將每個(gè)血液樣本單獨(dú)抽提總 RNA,鑒定其質(zhì)量,純化后使用生物素標(biāo)記,制成 RNA探針,通過(guò)與包括全轉(zhuǎn)錄本的Affymetrix Human
4、 Gene1.0 ST Array表達(dá)譜芯片雜交,雜交后的芯片用激光掃描儀進(jìn)行掃描,經(jīng)過(guò)信號(hào)檢測(cè)、微陣列圖像分析、計(jì)算機(jī)軟件數(shù)據(jù)處理,將所得的數(shù)據(jù)進(jìn)行比較,得出兩組基因的表達(dá)信息,用t檢驗(yàn)篩選患者外周血和正常對(duì)照組外周血單核細(xì)胞的差異表達(dá)基因(以P<0.05為條件),根據(jù) Gene Ontology對(duì)所篩選的部分差異基因進(jìn)行功能分析。
研究結(jié)果:經(jīng)過(guò)分析,以p<0.05作為標(biāo)準(zhǔn),得到1,609個(gè)差異表達(dá)的基因。以p<0.05且
5、Fold change值>2為標(biāo)準(zhǔn),得到100個(gè)顯著差異基因,其中有54(54%)差異表達(dá)基因?yàn)樯险{(diào)基因,46(46%)基因?yàn)橄抡{(diào)基因。以p<0.01作為標(biāo)準(zhǔn),得到303個(gè)差異表達(dá)的基因。以p<0.01且Fold change值>2為標(biāo)準(zhǔn),得到25個(gè)極顯著差異基因,其中有8個(gè)(32%)差異表達(dá)基因?yàn)樯险{(diào)基因,17個(gè)(68%)基因?yàn)橄抡{(diào)基因。在對(duì)極顯著差異基因進(jìn)行功能分析時(shí),我們發(fā)現(xiàn)有13個(gè)差異基因無(wú)功能注釋?zhuān)仓饕嬖谟诒磉_(dá)下調(diào)的基因中
6、,表達(dá)上調(diào)的8個(gè)基因部分有功能注釋?zhuān)饕婕懊庖?,?xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),炎癥反應(yīng),凝血,血管生成抑制,細(xì)胞周期相關(guān)等方面,功能亦十分復(fù)雜。
研究結(jié)論:應(yīng)用基因芯片技術(shù)能篩選出MOVC型BCS和正常人外周血單個(gè)核細(xì)胞差異表達(dá)的基因,并能探討部分差異基因的生物功能。從基因角度研究 MOVC,為進(jìn)一步深入研究布加綜合征的發(fā)病機(jī)制提供依據(jù)并奠定分子生物學(xué)基礎(chǔ)。這些差異基因可能有助于發(fā)現(xiàn)MOVC早期篩查的血液標(biāo)志物的研究?;蛐酒夹g(shù)作為一種新
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