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1、為了研究扁桃和其它李屬物種SSR的進化模式和突變機制,扁桃EST序列經(jīng)序列拼接獲得重疊群,利用MISA軟件分別從冗余和非冗余序列中篩選SSR-EST序列。隨機挑選6個EST-SSR和2個桃基因組的SSR座位對李屬材料進行SSR多態(tài)性分析,對所有8個座位中栽培扁桃的等位變異進行片斷回收、克隆和測序,對其中4個座位的所有等位變異進行序列分析,發(fā)現(xiàn)ASSR60的2個等位變異是由7個堿基缺失引起的,ASSR61座位是由于3個堿基缺失形成的2個等
2、位變異,多處位置的堿基替換存在種的特異性。編碼多聚泛素蛋白類似物基因中的ASSR4座位位于5'-UTR,屬于不完美3imp重復(fù)類型,等位變異是重復(fù)和側(cè)翼區(qū)5個堿基缺失共同作用的結(jié)果。編碼生長素阻遏蛋白基因中的ASSR17座位位于3'-UTR,屬于(AG)15重復(fù)類型,等位變異是由于AG重復(fù)和側(cè)翼區(qū)indels所致。由此可見ASSR17座位SSR突變過程較為復(fù)雜,不能單純用一種模型來解釋。源于桃基因SSR的兩個座位BPPCT010和BPP
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