利用EST序列與cDNA芯片分析板栗疫病菌基因表達譜.pdf

1、廣西大學碩士學位論文利用EST序列與cDNA芯片分析板栗疫病菌基因表達譜姓名：吳曉松申請學位級別：碩士專業(yè)：生物化學與分子生物學指導教師：陳保善20050601墨堅絲! 型望望! 壁型! ! ! 旦型! ：堡叢! ! 塑塹墨堡塑墮苧鬯查些! ! ! ! 一A n a l y s i so f E x p r e s s i o n P r o f i l eo f C r y p h o n e c t r i a p a r a s

2、i t i c ab yU s i n gE S T s a n d c D N A M i c r o a r r a yA B S T R A C TH y p o v i r u s ／C r y p h o n e c t r i a p a r a s i t i c ah a sp r o v e nt ob eat r a c t a b l es y s t e mf o rs t u d y i n gt h ei n

3、 t e r a c t i o nb e t w e e nv i r u s a n dh o s t ．I no r d e rt o g a i n ab e t t e ru n d e r s t a n d i n go f t h em o l e c u l a rb a s i s f o rt h ei n t e r a c t i o n ，ac D N A l i b r a r y w a sc o n s

4、 t m c t e d f l r o m m R N A s i s o l a t e d f r o m t h e w i l d —t y p e ( v i r u s —f r e e ) a n dh y p o v i r u s ．．i n f e c t e dC p a r a s i t i c as t r a i n s a tt h es t a g eo f s p o r u l a t i o n

5、 - At o t a l o f2 4 0 3 e x p r e s s e d s e q u e n c e t a g s ( E S T s ) r e p r e s e n t i n g 14 0 2 t e n t a t i v e u n i q u et r a n s c r i p t s ( T U T s ) w e r ec o l l e c t e db ys e q u e n c i n gt

6、 h ec D N A l i b r a r y ．Ac D N Am i c r o a r r a yr e p r e s e n t i n g4 8 4 5T U T s o f C p a r a s i t i c a ，o f w h i c h 3 8 0 6T U T s w e r 。f r o m n o n —s p o r u l a t i n g s t a g e c o l l e c t e d

7、p r e v i o u s l y a n d 14 0 2 T U T S f r o ms p o r u l a t i n gs t a g e ，w a s s p o t t e do nan y l o nm e m b r a n e ．T h ea r r a yw a su s e dt om o n i t o r c h a n g e s i n t h e e x p r e s s i o n p r

8、o f i l e a f t e r i n f e c t i o n b y h y p o v i r u sC H V 1 一E P 7 13 ．A l t e r e dt r a n s c r i p ta c c u m u l a t i o n sw e r eo b s e r v e df o r 10 5 5c l o n e s ，i n w h i c h3 7 0g e n e s w e r eu p

9、 —r e g u l a t e d a n d 6 8 5 d o w n —r e g u l a t e d ·T h e a r r a yh y b r i d i z a t i o n r e s u l t s w e r e v e r i f i e d b y t h e r e a l _ t i m e q u a n t i t a t i v e r e v e 。8 。t r a n s c

10、r i p t i o n ．P C Ra n d i t w a s r e v e a l e dt h a t8o u t o f10r a n d o m l ys e l e c t e dT U T sw i t ha l t e r e d e x p r e s s i o nw e r ec o i n c i d e d i nt r e n dw i t ht h ea r r a y a n a l y s i

11、s ·T h eg e n e sw h o s e e x p r e s s i o nw e r e m o d u l a t e d b yt h ev i r u sc o v e r ab r o a ds p e c t r u mo fb i o l o g i c a lp r o c e s s e s ，i n c l u d i n gs t r e s sr e s p o n s e ，n u c