利用基因芯片探索神經(jīng)管缺陷患兒基因表達譜的改變.pdf

1、目的：神經(jīng)管缺陷(NTDs)是常見的出生缺陷之一，為出生一年內(nèi)嬰兒死亡的首要病因，世界各地均有發(fā)生，平均發(fā)病率為1‰。目前認為NTDs的發(fā)生是環(huán)境因素與遺傳因素綜合作用的結(jié)果，但其具體病因以及所涉及的相關(guān)基因尚未闡明。由于cDNA微陣列能夠同時鑒別出同一時間基因表達差異，本研究利用基因芯片技術(shù)從基因水平探索與NTDs相關(guān)的基因，探索其與NTDs的關(guān)聯(lián)性。
　　 方法：樣本為孕43周男性無腦兒，經(jīng)陰道助產(chǎn)分娩。提取該嬰兒病變骨組織

2、總RNA，以正常骨組織作對照。用紫外分光光度計和變性膠電泳分別檢測RNA的質(zhì)量和完整性后，利用U133Plus2.0型基因芯片檢測樣本中基因的表達。比較其基因表達差異，篩選差異表達的基因，結(jié)合生物信息學(xué)分析。
　　 結(jié)果：病變骨組織和正常骨組織所獲的總RNA OD260/OD280分別為1.9和2.0，終濃度分別為0.5968 ng/μl和0.6051ng/μl，變性膠電泳圖譜顯示質(zhì)量良好，達到cDNA微陣列的檢測標準。芯片雜交

3、出65530個基因。其中兩倍以上上調(diào)基因2362個，下調(diào)基因1219個。16倍以上上調(diào)基因48個，6倍以上下調(diào)基因24個。16倍以上上調(diào)基因中與細胞分化相關(guān)的基因有7個，分別為NHLH2、OTX2、NEUROD1、EN2、OLIG1、INSM1和PAX6；6倍以上下調(diào)基因中與細胞分化相關(guān)的基因只有CSRP3。
　　 結(jié)論：利用cDNA微陣列技術(shù)篩選到了一批NTDs病變骨組織和正常骨組織差異表達的基因，了解這些基因可以幫助我們揭示