20558.東方田鼠線粒體基因組序列及y染色體部分序列的測(cè)定及分析

1、東華大學(xué)碩士學(xué)位論文東方田鼠線粒體基因組序列及Y染色體部分序列的測(cè)定及分析姓名：姜憲環(huán)申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專(zhuān)業(yè)：生物化工指導(dǎo)教師：肖君華201201麟東方田鼠線粒體基因組序列及Y染色體部分序列的測(cè)定及分析因組全序列和Y染色體序列，主要結(jié)果如下：1東方田鼠長(zhǎng)江亞種線粒體基因組為雙鏈環(huán)狀分子，序列總長(zhǎng)為163lObp，GenBank登錄號(hào)為JF261175；包含了與其他脊椎動(dòng)物一致的37個(gè)基因(13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、2個(gè)rRNA基因、22個(gè)t

2、RNA基因)和1個(gè)控制區(qū)(CR)。其基因組組成有很強(qiáng)的AT偏向性，全線粒體序列H一鏈的堿基百分含量為：A％(326)C％(277)T％(262)G％(134)，AT％(588)GC％(411)。2東方田鼠長(zhǎng)江亞種mtDNA的13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因最常用的起始密碼子是ATG(COXl、COX2、ATP8、ATP6、COX3、ND4L、ND4、ND6、C川b基因)，其次是ArT(ND3和ND5)。NDl和ND2基因比較特殊，起始密碼子分別是G

3、TG和問(wèn)阪。COXl，COX2，ATPase8，ATPase6，ND3，ND4L，ND5和C叭b基因的終止密碼子是TAA；ND2和ND6基因的終止密碼子是TAG；另外，COX3和ND4以不完整的T作為終止密碼子。3東方田鼠長(zhǎng)江亞種mtDNA的22個(gè)tIⅢA基因中，有21個(gè)可以折疊成標(biāo)準(zhǔn)的三葉草二級(jí)結(jié)構(gòu)；tRNA5叫AGⅥ僅有59bp，二級(jí)結(jié)構(gòu)缺少DHU環(huán)，這種tRNA結(jié)構(gòu)在其他嚙齒類(lèi)動(dòng)物中也很常見(jiàn)。4東方田鼠長(zhǎng)江亞種mtDNA控制區(qū)的結(jié)