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文檔簡(jiǎn)介
1、絨山羊是經(jīng)過(guò)若干世紀(jì)的自然選擇與人工選育,逐步分化出的、分布于特定生態(tài)環(huán)境中的山羊品種,具有多種用途及極高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值,是重要的家畜資源,其所產(chǎn)羊絨稀有而珍貴。但目前,由于絨山羊生存環(huán)境逐步惡化,其生長(zhǎng)發(fā)育受到生態(tài)條件制約,良種化程度較低、優(yōu)質(zhì)種羊匱乏,而且羊絨品質(zhì)下降。因此,加強(qiáng)絨山羊優(yōu)良基因的保護(hù)、提高繁殖力、增加羊絨產(chǎn)量、提高羊絨品質(zhì)成為迫切的任務(wù)。
雄性絨山羊在繁殖中具有重要的作用,不僅具有繁殖能力,而且產(chǎn)絨量也較高。所
2、以,大力培育良種種公羊勢(shì)在必行。而種公羊的培育和繁殖主要取決于Y染色體上分布的許多與繁殖性狀相關(guān)基因的作用機(jī)制。由于至今還沒(méi)有完成山羊Y染色體測(cè)序工作,因此,繁殖相關(guān)基因的作用機(jī)制無(wú)法清楚地了解。
為此,本研究通過(guò)PCR技術(shù)對(duì)絨山羊基因組BAC文庫(kù)進(jìn)行了Y染色體序列的篩選、FISH鑒定和測(cè)序組裝及序列分析,主要結(jié)果如下:
1.本研究通過(guò)PCR技術(shù)從絨山羊基因組BAC文庫(kù)中篩選出10個(gè)BAC,經(jīng)克隆測(cè)序和BAC末端測(cè)序
3、比對(duì)初步確定為絨山羊Y染色體BAC。
2.利用FISH技術(shù)對(duì)614B22、516O16、405D22及570A194個(gè)BAC進(jìn)行了Y染色體的進(jìn)一步鑒定,從而確定其為Y染色體BAC。
3.應(yīng)用軟件對(duì)4個(gè)BAC進(jìn)行測(cè)序拼接,得到contig335個(gè),其中614B22103個(gè),516O16135個(gè),405D2267個(gè),570A1930個(gè);scaffold314個(gè),其中614B2298個(gè),516O16126個(gè),405D226
4、2個(gè),570A1928個(gè)。4個(gè)BAC中516O16最長(zhǎng),405D22最短。
4.對(duì)570A19和516O16兩個(gè)BAC部分序列的轉(zhuǎn)錄因子起始位點(diǎn)和結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè),分別得到了4個(gè)和1個(gè)起始位點(diǎn)、多個(gè)結(jié)合位點(diǎn)及轉(zhuǎn)錄結(jié)合因子。
5.預(yù)測(cè)到570A19和516O16兩個(gè)BAC具有多個(gè)ORF,而且通過(guò)蛋白質(zhì)編碼序列比對(duì),確定其分別為TSPY和USP9Y蛋白編碼框。
6.對(duì)所有編碼框進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè),570A19
5、只預(yù)測(cè)到一個(gè)保守的跨膜螺旋區(qū)域;516O16預(yù)測(cè)到一個(gè)保守的跨膜螺旋區(qū)域和一個(gè)高度保守的結(jié)構(gòu)域-UCH,表明TSPY和USP9Y基因在物種間的保守性較低。
7. TSPY和USP9Y蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)顯示,兩種蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)均由多個(gè)α螺旋和β-折疊組成。
8. USP9Y基因的進(jìn)化樹(shù)表明,絨山羊、牛、人、恒河猴、狐猴等9個(gè)物種間的親緣關(guān)系同其在分類學(xué)中的位置基本一致,其中絨山羊與牛的親緣關(guān)系最近,聚為一類。
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