24104.dna序列中串聯(lián)重復(fù)定位的研究

1、DNA序列中串聯(lián)重復(fù)定位的研究重慶大學(xué)碩士學(xué)位論文學(xué)生姓名：王嘉指導(dǎo)教師：田逢春教授專(zhuān)業(yè)：通信與信息系統(tǒng)學(xué)科門(mén)類(lèi)：工學(xué)重慶大學(xué)通信工程學(xué)院二O一一年四月重慶大學(xué)碩士學(xué)位論文中文摘要I摘要隨著生物學(xué)的不斷進(jìn)步和基因組學(xué)的長(zhǎng)期發(fā)展，現(xiàn)代生物學(xué)研究早已不再是一門(mén)單一的學(xué)科，而是融合生物學(xué)、數(shù)學(xué)、化學(xué)、通信技術(shù)、計(jì)算機(jī)技術(shù)、信息技術(shù)等多門(mén)學(xué)科于一身的交叉、綜合性研究領(lǐng)域。生物系統(tǒng)自身的復(fù)雜性也為眾多領(lǐng)域的分析理論和研究方法提供了其應(yīng)用于生物學(xué)研

2、究的可能性。隨著基因工程的不斷推進(jìn)，各大生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)中所存儲(chǔ)的生物大分子數(shù)據(jù)數(shù)量更是呈現(xiàn)指數(shù)增長(zhǎng)。面對(duì)如此海量的信息，進(jìn)一步深入了解這些信息中所蘊(yùn)含的更高層次的生物意義成為生物信息學(xué)研究中迫切的需求。采用新方法、技術(shù)和工具對(duì)其進(jìn)行分析也就成為了探索生物信息數(shù)據(jù)中奧秘的重要途徑。遺傳信息中除了含有類(lèi)似于信息學(xué)中數(shù)據(jù)類(lèi)信息的外顯子序列和類(lèi)似于程序類(lèi)信息的內(nèi)含子序列以外，還存在著不編碼蛋白質(zhì)，也不被轉(zhuǎn)錄成RNA的重復(fù)序列。分子遺傳標(biāo)記則因核

3、心序列重復(fù)數(shù)目的變化而在群體中呈現(xiàn)出遺傳多樣性。對(duì)重復(fù)序列的定位是進(jìn)一步研究非編碼區(qū)中重復(fù)序列起源和功能的基礎(chǔ)，在遺傳信息研究中具有基礎(chǔ)性的作用。本文以研究DNA序列中串聯(lián)重復(fù)序列為方向，結(jié)合生物學(xué)、線性代數(shù)理論、通信編碼理論以及計(jì)算機(jī)技術(shù)進(jìn)行了一定基礎(chǔ)性研究。在總結(jié)已有研究成果如DNA序列數(shù)值表示方法、矩陣秩原理的基礎(chǔ)上，討論了串聯(lián)重復(fù)序列表象及基因突變對(duì)其影響，提出了一種新的基于線性代數(shù)中矩陣秩的理論和伽羅華域運(yùn)算規(guī)則的DNA序列串