基于線粒體ND2基因序列的華南地區(qū)斑鱧遺傳多樣性研究.pdf

1、斑鱧(Channa maculata)主要分布于我國長江以南,包括海南島及臺(tái)灣島等。斑鱧的生長速度快,并具有獨(dú)特的藥用價(jià)值和營養(yǎng)價(jià)值,已經(jīng)越來越受到人們的青睞,是人們餐桌上常見的佳肴。但近些年來,由于水利工程建設(shè)、過度捕撈、水域環(huán)境污染和不合理的人工養(yǎng)殖等影響,導(dǎo)致野生斑鱧的數(shù)量越來越少,種質(zhì)資源嚴(yán)重退化。
　　本研究測定了珠江、漠陽江、南流江、南渡江、昌化江和萬泉河6個(gè)水系14個(gè)地點(diǎn)132尾斑鱧的線粒體ND2基因序列,分析不同地

2、理群體的遺傳多樣性、遺傳分化水平及種群歷史動(dòng)態(tài)等,客觀評(píng)價(jià)中國野生斑鱧的遺傳背景,為種質(zhì)資源的開發(fā)、保護(hù)和利用提供科學(xué)依據(jù),具體實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:
　　1、線粒體ND2序列特征。斑鱧ND2基因全序列1044bp中,其中保守位點(diǎn)975個(gè),變異位點(diǎn)66個(gè),單堿基變異位點(diǎn)44個(gè),簡約信息位點(diǎn)22個(gè)。A、T、G、C四種堿基組成分別是27.1％、23.8%、12.2%、36.9%。A+T的含量為50.9%,G+C的含量為49.1%,A+T的含量

3、明顯高于G+C的含量,與大多數(shù)魚類堿基組成相似。
　　2、遺傳多樣性和遺傳分化。132個(gè)ND2序列中共檢測到36個(gè)單倍型,其中共享單倍型有15個(gè)(占全部單倍型的41.67%)。14個(gè)地理群體中,廣西合浦(HP)和海南南開(NK)擁有最多的單倍型數(shù),均為7個(gè)。系統(tǒng)樹均表明36個(gè)單倍型群體間的親緣關(guān)系比較近,沒有形成譜系結(jié)構(gòu)。
　　將所有斑鱧群體作為一個(gè)整體分析時(shí),平均單倍型多樣型為0.857±0.024,平均核苷酸多樣性為0.

4、00284±0.00146,表明斑鱧的遺傳性多樣性較低。南渡江(NDJ)與昌化江(CHJ)群體間的Fst值最小(Fst=0.01511),群體間沒有遺傳分化,基因交流頻繁;萬泉河(WQH)與南流江(NLJ)群體間的Fst值最大(Fst=0.53119),群體間存在高度分化;珠江(ZJ)與南流江(NLJ)、昌化江(CHJ)群體間的Fst值分別為0.15349、0.18198,表明群體間存在中度分化;漠陽江(MYJ)與南流江(NLJ)、昌化

5、江(CHJ),萬泉河(WQH)與其它5個(gè)水系的Fst值都大于0.25,表明這幾個(gè)群體間存在高度分化;南渡江(NDJ)與南流江(NLJ)群體間的Fst值分別為0.02702,表明南渡江與南流江群體間不存在分化。
　　AMOVA分析顯示,6個(gè)水系之間的變異百分比為-0.58%,不同水系內(nèi)群體間的變異百分比為31.58%,群體內(nèi)個(gè)體間的變異百分比為69.00%,表明6個(gè)水系的斑鱧的變異主要來源于群體內(nèi)個(gè)體間。14個(gè)地理群體間的遺傳距離都

6、在0.000-0.004之間,各地理群體都處于同一個(gè)水平,并且結(jié)合Fst值、各種系統(tǒng)發(fā)育樹及TCS網(wǎng)絡(luò)圖等分析結(jié)果,本研究中的14個(gè)地理群體之間還沒達(dá)到亞種的分化程度。
　　3、種群動(dòng)態(tài)分析。將6個(gè)水系中的所有群體作為一個(gè)整體進(jìn)行中性檢驗(yàn)的Tajima‘s D值和Fu‘s Fs值均為負(fù)值,且南流江、南渡江和昌化江水系都表現(xiàn)明顯的P值顯著,說明斑鱧群體在歷史有經(jīng)歷種群擴(kuò)張。同時(shí),6個(gè)水系的斑鱧群體岐點(diǎn)分布圖都大致呈現(xiàn)單峰,這也表明了