內(nèi)蒙古錫林郭勒牧區(qū)健康家畜腸道菌群多樣性研究.pdf

1、本研究運(yùn)用純培養(yǎng)技術(shù)結(jié)合16S rRNA基因序列分析方法對采集自內(nèi)蒙古錫林郭勒牧區(qū)的36份健康家畜（牛、馬、山羊、綿羊）糞便樣品中的微生物進(jìn)行了分離鑒定，利用變性梯度凝膠電泳(DGGE)技術(shù)和實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)技術(shù)對腸道微生物的多樣性和數(shù)量進(jìn)行了分析比較，以期為促進(jìn)牧區(qū)家畜腸道有益菌的開發(fā)和篩選奠定基礎(chǔ)。試驗(yàn)結(jié)果如下:
　　1.結(jié)合形態(tài)學(xué)觀察法，采用改良MRS培養(yǎng)基對腸道細(xì)菌進(jìn)行分離，共獲得179株細(xì)菌純培養(yǎng)物。運(yùn)用1

2、6S rRNA基因序列分析技術(shù)將所有分離株分類鑒定到了14個(gè)屬，32個(gè)種，包括乳桿菌屬、丙酸菌屬、鏈球菌屬、埃希氏桿菌屬、葡萄球菌屬、擬桿菌屬、放線菌屬、布勞特氏菌屬、梭菌屬、腸球菌屬、雙歧桿菌屬、腸桿菌屬、克呂沃氏菌屬和瘤胃球菌屬。此外，從微生物多樣性來看，牛樣品中的分離株主要集中于厚壁菌門(61.4％)、變形菌門(25.0％)和放線菌門(11.4％);馬樣品中的分離株主要集中于厚壁菌門(87.2％)和擬桿菌門(10.3％);山羊和綿

3、羊樣品的分離株主要集中在厚壁菌門(61.5％)和放線菌門(32.3％)。
　　2.運(yùn)用PCR-DGGE技術(shù)研究家畜腸道菌群及乳桿菌屬的多樣性，結(jié)果表明不同家畜腸道菌群及乳桿菌屬構(gòu)成存在差異，且組內(nèi)樣品間也存在一定差異。牛腸道內(nèi)的菌群多樣性較高，其次為綿羊和山羊，馬腸道內(nèi)的菌群多樣性較低，主要的差異性菌種有巨大芽孢桿菌、維氏氣單胞菌、小韋榮球菌、施氏葡萄球菌和拉托氏假單胞桿菌等。此外，相較于馬和山羊腸道內(nèi)乳桿菌屬的多樣性，綿羊腸道內(nèi)

4、的較高，牛的較低，主要差異性菌種為嗜酸乳桿菌、L.kitasatonis、L.pontis、L.taiwanensis、L.equi、發(fā)酵乳桿菌或陰道乳桿菌。
　　3.運(yùn)用qPCR技術(shù)研究家畜腸道優(yōu)勢菌群的數(shù)量，結(jié)果表明:對于乳桿菌和擬球梭菌，山羊、綿羊和馬腸道內(nèi)的數(shù)量顯著高于牛，而它們?nèi)咧g無顯著差異;對于脫硫弧菌，四種家畜腸道內(nèi)的數(shù)量相當(dāng);對于巨型球菌，綿羊腸道內(nèi)的數(shù)量顯著高于牛和馬，而山羊與其他三組之間無顯著性差異;對于雙