基于SSR分子標(biāo)記的葡萄種質(zhì)資源遺傳多樣性分析及品種鑒定.pdf

1、本研究利用SSR分子標(biāo)記分析了葡萄種質(zhì)資源的親緣關(guān)系和遺傳多樣性。利用核SSR分子標(biāo)記分析了南京農(nóng)業(yè)大學(xué)葡萄試驗(yàn)基地79份葡萄種質(zhì)資源的親緣關(guān)系;根據(jù)葡萄葉綠體序列開發(fā)了7對葉綠體SSR引物，并結(jié)合核SSR引物初步鑒定了優(yōu)良實(shí)生單株‘2004-2-5’的親本;分析了南京地區(qū)9個野生蘡薁葡萄群體286份資源和黃山地區(qū)3個野生刺葡萄群體40份資源的遺傳多樣性，為野生葡萄資源的保護(hù)、開發(fā)和利用提供了參考依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:
　　

2、1.利用SSR分子標(biāo)記分析了79份葡萄種質(zhì)資源的親緣關(guān)系。15對SSR引物在79份葡萄材料中共擴(kuò)增出158個等位基因，位點(diǎn)多態(tài)率為100％，其中中國野生葡萄資源（蘡薁和刺葡萄）特有等位位點(diǎn)數(shù)為22個，占總位點(diǎn)數(shù)的13.9％?？设b別67個品種，鑒別率為84.8％。通過非加權(quán)組平均法(UPGMA)對所得數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析，79份資源間的遺傳相似性系數(shù)為0.72～1.00，在遺傳相似系數(shù)為0.72時，79份材料聚為兩類，砧木品種‘99R’、‘5

3、BB’和中國野生葡萄資源刺葡萄、蘡薁聚為一類，歐亞種、歐美雜種和優(yōu)良實(shí)生單株聚為一類，說明抗病抗逆性較強(qiáng)的中國野生葡萄資源和砧木品種與用于鮮食的栽培種親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
　　 2.‘2004-2-5’是通過實(shí)生選種選育的品質(zhì)優(yōu)良的實(shí)生單株，親本未知。本文根據(jù)葡萄葉綠體全序列設(shè)計(jì)了26對葉綠體SSR引物，篩選出7對有多態(tài)性且擴(kuò)增效果較好的引物。用15對核SSR引物分析了‘2004-2-5’和55個候選疑似親本之間的似然比分?jǐn)?shù)，用7對葉

4、綠體SSR引物進(jìn)一步鑒定母本。結(jié)果表明:‘大瀨戶’和‘圣誕玫瑰’組成的親本對為‘2004-2-5’親本概率最大，其次為‘魏可’和‘大瀨戶’;‘大瀨戶’是雄性不育品種，為‘2004-2-5’母本概率較大，‘魏可’與‘2004-2-5’cpSSR擴(kuò)增結(jié)果不同，可以否定其為母本的可能。
　　 3.野生蘡薁葡萄資源在南京地區(qū)分布廣泛，本研究利用8對SSR分子標(biāo)記分析了南京地區(qū)9個野生蘡薁群體的遺傳多樣性。8對SSR引物在286份蘡薁資源

5、中共擴(kuò)增出99個等位基因，位點(diǎn)多態(tài)率(PPL)為100％，平均有效等位基因數(shù)(Ne)為3.127個;觀測雜合度(Ho)為0.451，期望雜合度(He)為0.581;Nei's多樣性指數(shù)(H)為0.580; Shannon多樣性指數(shù)(Ⅰ)為1.392;多態(tài)性信息量(PIC)為0.559;固定指數(shù)F為-0.047～0.750。說明供試的蘡薁葡萄材料存在較高的遺傳多樣性。9個野生蘡薁葡萄群體的平均觀測等位基因數(shù)(Na)為3.125～9.000

6、，平均有效等位基因數(shù)(Ne)為2.072～3.124;觀測雜合度(Ho)為0.359～0.486，期望雜合度(He)為0.417～0.591;Nei's多樣性指數(shù)(H)為0.391～0.588; Shannon多樣性指數(shù)(Ⅰ)為0.728～1.328;基因分化Fst為0.025～0.154，基因流Nm為1.375～9.793，平均為2.042;遺傳一致度為0.647～0.974，遺傳距離為0.027～0.435。群體間基因交流頻繁，遺傳

7、分化較小，地理距離是影響遺傳一致度和遺傳距離的主要因素，但不是唯一因素，有時會受到客觀因素如生境、人類活動等的影響。
　　 4.利用8對SSR分子標(biāo)記引物分析了安徽黃山地區(qū)40份野生刺葡萄資源的遺傳多樣性，結(jié)果表明:8對SSR引物擴(kuò)增的等位基因數(shù)(Na)為36個，每個引物擴(kuò)增等位基因數(shù)(Na)為2～10個，有效等位基因數(shù)(Ne)為1.285～5.378個;觀測雜合度(Ho)為0.250～0.775，期望雜合度(He)為0.224

8、～0.824; Nei's多樣性指數(shù)(H)為0.222～0.814;Shannon多樣性指數(shù)(Ⅰ)為0.417～1.884;多態(tài)性信息含量(PIC)為0.202～0.789。依據(jù)地理位置將黃山地區(qū)刺葡萄資源分為3個群體(POP1，POP2，POP3)，3個群體之間遺傳相似度為0.829～0.912，遺傳距離為0.093～0.188，表明黃山地區(qū)刺葡萄資源的遺傳差異較少。通過非加權(quán)組平均法(UPGMA)對黃山地區(qū)40份刺葡萄和湖南、福建的