SSR分子標(biāo)記在高粱屬品種鑒定及種質(zhì)資源遺傳多樣性分析中的應(yīng)用研究.pdf

1、本研究利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)，構(gòu)建了國(guó)審蘇丹草與高丹草品種的SSR指紋圖譜，并進(jìn)行了遺傳多樣性分析。主要結(jié)果如下：
　　1.多態(tài)性引物的篩選
　　本研究使用已經(jīng)報(bào)道的具有多態(tài)性的108對(duì)引物在17份材料中進(jìn)行多態(tài)性驗(yàn)證，經(jīng)初篩選、復(fù)篩選兩步得到20對(duì)適合進(jìn)行分析的引物。20對(duì)具有多態(tài)性的SSR引物，共擴(kuò)增出121條譜帶，變幅為3-13條，平均6.05條；其中多態(tài)性譜帶為117條，多態(tài)性條帶比率變幅為75％-100%，平均97

2、.08%；多態(tài)性信息量（PIC）變幅為0.529-0.889，均值0.703，Shannon指數(shù)（I）變幅為0.8536-2.1954，平均值1.5189，基因多樣性指數(shù)（H）變幅為0.5276-0.8444，平均值為0.7212。
　　2.取樣策略分析
　　使用篩選出來(lái)的20對(duì)引物對(duì)17個(gè)品種材料的20、40、60、80、100株混樣進(jìn)行PCR擴(kuò)增，實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，大部分供試材料在取樣量為20株時(shí)可達(dá)到穩(wěn)定，部分材料在部分引

3、物下取樣量需達(dá)到40株時(shí)才可達(dá)到穩(wěn)定。為了兼顧準(zhǔn)確和經(jīng)濟(jì)的原則，本試驗(yàn)最終選取的60株混樣進(jìn)行品種指紋圖譜構(gòu)建。
　　3.指紋圖譜的構(gòu)建與聚類(lèi)分析
　　實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，單一的引物都無(wú)法區(qū)分開(kāi)所有材料，遵循使用盡量少的引物鑒別盡量多材料的原則，最終確定了BAC5、SG8兩對(duì)引物，進(jìn)行品種DNA指紋圖譜的構(gòu)建，并構(gòu)建了指紋圖譜代碼。根據(jù)20對(duì)引物的擴(kuò)增結(jié)果，利用NTSYS2.10e對(duì)17份材料進(jìn)行聚類(lèi)分析，17個(gè)品種間遺傳相似系數(shù)

4、范圍為0.57-0.95，平均相似系數(shù)為0.76。在0.58處聚為兩大類(lèi)，第一類(lèi)包含冀草2號(hào)、天農(nóng)1號(hào)、天農(nóng)2號(hào)、皖草2號(hào)、晉牧1號(hào)、樂(lè)食、皖草3號(hào)，第2類(lèi)包含烏拉特2號(hào)、寧農(nóng)、新蘇3號(hào)、新蘇2號(hào)、奇臺(tái)、鹽池、烏拉特1號(hào)、內(nèi)農(nóng)1號(hào)、蒙農(nóng)3號(hào)、蒙農(nóng)2號(hào)。
　　4.17份品種材料遺傳多樣性分析
　　采用 Popgen32進(jìn)行基因多樣性計(jì)算，結(jié)果顯示各個(gè)品種的shannon指數(shù)（I）的在0.5148-1.0264之間，平均為0.9

5、375。Nei指數(shù)在0.3582-0.5887之間，平均值為0.4826。種內(nèi)Shannon信息多樣性指數(shù)與Nei’s基因多樣性指數(shù)分別為0.8199、0.4797，均小于種間的1.5189、0.72112，說(shuō)明品種間的遺傳多樣性大于品種內(nèi)的遺傳多樣性。
　　5.161份高粱屬種質(zhì)材料遺傳多樣性分析
　　利用15對(duì)SSR引物對(duì)161份國(guó)內(nèi)外高粱屬種質(zhì)材料進(jìn)行遺傳多樣性分析，結(jié)果顯示，共擴(kuò)增出118個(gè)等位變異，每個(gè)SSR位點(diǎn)的