栽培西瓜品牌抗枯萎病基因Fon-1定位.pdf

1、西瓜枯萎病是西瓜生產(chǎn)上的世界性病害，嚴重影響西瓜的產(chǎn)量和品質(zhì)，其病原菌生理小種有4個，1號小種是國內(nèi)的主要生理小種。因此，開展西瓜枯萎病菌生理小種1的抗病基因研究是解決西瓜枯萎病的首要突破口。
　　在前期研究中，我們發(fā)現(xiàn)栽培西瓜Calhoun Gray對枯萎病菌生理小種1有著高度抗性，且其抗性是由單個顯性基因Fon-1控制。本研究采用BSA分析方法對Fon-1基因進行初步區(qū)間定位。依據(jù)11份栽培西瓜重測序信息，獲取位于初步定位區(qū)間

2、內(nèi)的候選SNP位點，并分別設(shè)計標記。通過231株F2代分離群體和164份種質(zhì)資源驗證，進一步精細定位Fon-1基因。此外，通過初步定位區(qū)域基因注釋，并對該區(qū)域內(nèi)的抗病同源基因進行了克隆和比對多態(tài)性差異研究。主要研究結(jié)果如下:
　　1.利用BSA方法完成了西瓜枯萎病菌生理小種1抗性基因Fon-1的初步定位。通過對F2群體進行枯萎病苗期接種表型鑒定，結(jié)合BSA法從西瓜950個SSR/Indel/dCAPS引物中，篩選出SSR標記WMG

3、00291和dCAPS標記197728_ fon2個與Fon-1基因連鎖的分子標記，最終將Fon-1基因初步定位于1號染色體15cM范圍內(nèi)，研究結(jié)果為Fon-1基因的精細定位奠定了基礎(chǔ)。
　　2.利用生物信息學(xué)方法精細定位Fon-1基因。通過對11份栽培西瓜初步定位區(qū)間序列進行BLAST，獲取與其抗、感表型完全吻合的SNP位點，開發(fā)與Fon-1基因緊密連鎖的3個標記，其最近遺傳距離達到0.8cM;利用164份西瓜種質(zhì)資源進行驗證發(fā)

4、現(xiàn)，7716_fon和7419_fon均可高效地應(yīng)用于輔助選擇高抗Fon-1基因的西瓜育種工作。
　　3.候選Fon-1基因的獲取。依據(jù)西瓜基因組信息，對親本初步定位區(qū)間內(nèi)的抗病同源基因進行全長擴增。通過序列比對，結(jié)果發(fā)現(xiàn)FW-2基因編碼區(qū)存在SNP突變差異，初步認為該基因為候選Fon-1基因。
　　綜上所述，本研究精細定位了栽培西瓜抗枯萎病基因Fon-1，并開發(fā)了與Fon-1基因緊密連鎖的分子標記。研究結(jié)果不僅為西瓜抗枯萎