五個(gè)山羊品種遺傳多樣性的微衛(wèi)生分析.pdf

1、本研究利用15個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記,對唐山奶山羊、遼寧絨山羊、南江黃羊、承德無角山羊、雷州黑山羊5個(gè)山羊品種共計(jì)319個(gè)個(gè)體的遺傳多樣性進(jìn)行了研究。探討了各品種內(nèi)的遺傳變異及群體間的遺傳關(guān)系。旨在為山羊遺傳資源的合理利用和科學(xué)保護(hù)提供理論依據(jù)。從GeneBank中篩選出來的15個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn),在5個(gè)山羊品種中均得到了較好的特異性擴(kuò)增結(jié)果。共檢測到169個(gè)等位基因,平均每個(gè)位點(diǎn)達(dá)11.3個(gè),數(shù)目最多的位點(diǎn)是BM3413和BMS1004,為14個(gè),最

2、少的位點(diǎn)是BM203,為8個(gè)；可以較好的用于5個(gè)山羊品種的遺傳多樣性評估。有效等位基因數(shù)為76.5518,明顯小于實(shí)際觀察的等位基因數(shù),這是等位基因頻率分布不均勻的因?yàn)?。?jīng)哈代—溫伯格平衡檢驗(yàn),幾乎所有的位點(diǎn)在5個(gè)山羊品種中都處于遺傳不平衡狀態(tài),只有個(gè)別位點(diǎn)在個(gè)別品種中基本達(dá)到平衡,如BMS1248位點(diǎn)在承德無角山羊中,BMS574位點(diǎn)在遼寧絨山羊中,基本達(dá)到平衡。以等位基因頻率為基礎(chǔ),得出的位點(diǎn)的雜合度(H)在0.6566～0.887

3、5之間,群體的雜合度(H)在0.7936～0.8202之間；屬于高度雜合位點(diǎn)和高度雜合群體。位點(diǎn)的多態(tài)信息含量(PIC)在0.5982～0.8773之間；群體的多態(tài)信息含量(PIC)在0.7675～0.7973之間；均屬于高度多態(tài)；其中BMS1724位點(diǎn)的雜合度和多態(tài)信息含量最高,分別為0.8561和0.8405；雷州黑山羊的雜合度和多態(tài)信息含量最低,分別為0.7936和0.7675,表明15個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)在5個(gè)山羊群體中均具有較高的多態(tài)

4、性。通過對15個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)進(jìn)行中性測試,發(fā)現(xiàn)有3個(gè)位點(diǎn)(BM203、BM3413和BMS2508)置于95％的置信區(qū)間,屬于中性位點(diǎn)；其余12個(gè)位點(diǎn)則為非中性位點(diǎn)。運(yùn)用F-統(tǒng)計(jì)量分析結(jié)果顯示:5個(gè)山羊品種在15個(gè)位點(diǎn)上的亞群體固定指數(shù)(FIS)>0,說明群體內(nèi)存在一定程度的近交；FST的平均值為0.0620,說明這5個(gè)品種的遺傳分化程度較低。群體每代遷移數(shù)在1.9795～9.9089之間變動,平均值為4.3128。計(jì)算了總?cè)后w雜合度、亞