棉花纖維發(fā)生的AFLP分子標(biāo)記.pdf

1、西南農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文棉花纖維發(fā)生的AFLP分子標(biāo)記姓名：羅明申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：植物學(xué)指導(dǎo)教師：李名揚(yáng)裴炎2001.6.1棉聿乞期慷冀魚(yú)的AFLP分日叫崎H己纖維的23株都有CF，標(biāo)記，無(wú)絨無(wú)絮的兩個(gè)單株無(wú)CF，標(biāo)記。說(shuō)明CF。標(biāo)記可能是與纖維有無(wú)相關(guān)的分子標(biāo)記。鑒于F：分離群體中無(wú)絨無(wú)絮單株偏少，于是用R分離群體繼續(xù)進(jìn)行驗(yàn)證。對(duì)分別來(lái)自21個(gè)R，家系的21個(gè)有纖維單株和來(lái)自7個(gè)F2，家系的17個(gè)無(wú)纖維單株進(jìn)行AFLP分析。17

2、個(gè)無(wú)纖維單株均無(wú)CFI標(biāo)記，而21個(gè)有纖維單株都具有CFI標(biāo)記。說(shuō)明CF，標(biāo)記與有纖維呈共分離，是與棉纖維發(fā)生相關(guān)的分子標(biāo)記。選用纖維發(fā)育正常的渝棉～號(hào)、徐州142、9202034、T586和泗棉3號(hào)5個(gè)陸地棉品種(系)進(jìn)行AFLP驗(yàn)證。以上品種都具有CF，標(biāo)記在一定程度上進(jìn)一步說(shuō)明CF，與棉纖維的發(fā)生相關(guān)。4Cb和CFl片段的回收、克隆和序列分析從銀染的聚丙烯酰胺凝膠上回收特征片段(CF，)和緊鄰的共有片段(Cb)。重組質(zhì)粒經(jīng)PCR和

3、酶切分析鑒定，回收片段成功地克隆到PUCmTVector上。在advancedBLAST2中查找核酸序列的相似性，發(fā)現(xiàn)特征片段與擬南芥染色體上的一段序列、煙草葉綠體基因組的一段序列以及幾個(gè)人類的克隆序列有一定程度的相似性。同時(shí)在advancedBLAST2中根據(jù)6種開(kāi)放閱讀框查找其編碼氨基酸序列的相似性，發(fā)現(xiàn)與酚羥化酶q一亞基(phenolhydroxylasealphasubunit)、外表皮蛋白C(outersurfaceprote

4、inC)、NADH脫氫酶亞基1(NADHdehydrogenasesubunit1)、NADHCoQ氧化還原酶(NADHubiquinoneoxidoreductase)、2氧代鐵氧還蛋白氧化還原酶(2oxoacidferredoxinoxidoreduct)以及假擬145KD蛋白(hypothetical145KDprotein)等有一定的相似性(Highscore分別為：61、68、51、46、60、44)。對(duì)Cb和CF，的核苷酸序