來源于柑橘和葡萄的類病毒的檢測與序列分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、類病毒是危害植物的一類重要病原物。在柑橘上,柑橘裂皮類病毒(Citrusexocortisviroid,CEVd)和柑橘類病毒Ⅱ(CitrusviroidⅡ,CVd-Ⅱ,又名啤酒花矮化類病毒Hopstuntviroid,HSVd)可導致柑橘樹體矮化、樹勢減弱和產(chǎn)量降低,這兩種類病毒也可侵染葡萄,但有關其對葡萄生長的影響尚不明確。本研究對我國柑橘及葡萄上發(fā)生的類病毒進行了分子鑒定及分子變異特點的分析,以期為深入了解我國發(fā)生的果樹類病毒種類

2、,明確其分子特性提供有用的信息。本研究主要結果如下:
   1.采用RT-PCR方法對來自湖北秭歸縣、武漢市和江西贛州市等地的24份柑橘樣品進行了CEVd、CVd-Ⅰ(CBLVd)、CVd-Ⅰ-LSS、CVd-Ⅱ(HSVd)、CVd-Ⅲ、CVd-Ⅳ和CVd-OS共7種類病毒的檢測。檢測結果顯示我國柑橘上至少存在4種柑橘類病毒,包括CEVd、CVd-Ⅰ、CVd-Ⅱ和CVd-Ⅲ。其中感染CVd-Ⅱ、CEVd、CVd-Ⅰ和CVd-Ⅲ的

3、樣品分別有9個、7個,3個和5個,除2個樣品為CVd-Ⅱ單獨感染和1個樣品為CEVd單獨感染外,其它檢測到感染類病毒的柑橘樣品均為2種或2種以上類病毒復合侵染。
   2.對來自同一柑橘樣品Hb-C1的CEVd、CVd-Ⅰ、CVd-Ⅱ和CVd-Ⅲ的全長基因組RNA進行了克隆,每種類病毒隨機選取20個克隆進行了測序和群體結構分析。結果表明,CEVd、CVd-Ⅰ、CVd-Ⅱ和CVd-Ⅲ均存在一定的分子變異,為多個分子變種組成的準種。

4、在同一個分離物內(nèi)的各分子變種相似性都在90%以上。其中,CVd-Ⅰ的變異程度最小,各分子變種間的相似性為96.3%-100%,優(yōu)勢分子變種占20%,兩個亞優(yōu)勢變種的比例約占10%,非優(yōu)勢分子變種為60%;CVd-Ⅱ各分子變種間的相似性為95.1%-100%,優(yōu)勢分子變種占35%,亞優(yōu)勢變種的比例占15%,非優(yōu)勢分子變種占50%;CEVd各分子變種間的相似性為92.6%-100%,有一個優(yōu)勢分子變種,占15%,兩個亞優(yōu)勢變種,比例各約占1

5、0%,非優(yōu)勢分子變種為65%;CVd-Ⅲ的變異程度較大,各分子變種間的相似性為92.4%-100%,有兩個主要的優(yōu)勢分子變種,各占15%。
   3.采用RT-PCR方法對來自鄭州和湖北的40份葡萄樣品進行了CEVd和HSVd的檢測,檢測結果顯示,有2份樣品感染有CEVd,這是中國首次在葡萄上發(fā)現(xiàn)CEVd;有35%的葡萄樣品感染有HSVd。將獲得的CEVd擴增產(chǎn)物進行了克隆,每個分離物隨機挑選10個克隆進行測序和群體結構分析。結

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