pubmed使用攻略醫(yī)學生必備

1、http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed,PUBMED數(shù)據(jù)庫,張士靖醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院zhangsj9999@163.com,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,一、PubMed簡介,二、檢索途徑和方法,三、檢索結果處理,四、其他輔助檢索,主要內(nèi)容,五、免費獲取全文,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,一、PubMed簡介,1.PubMed基本情況2.PubMed的由來3.PubMed的數(shù)據(jù)范圍

2、4.PubMed的特點5.PubMed主頁,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,一、PubMed簡介,1.PubMed基本情況PubMed是美國NLM所屬的國家生物技術信息中心（NCBI）開發(fā)的一個以Web方式向用戶提供服務的生物醫(yī)學文獻檢索系統(tǒng)，是繼MEDLINE數(shù)據(jù)庫國際聯(lián)機檢索和光盤檢索之后推出的一種網(wǎng)絡免費檢索方式。,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,包括2,100多萬篇來自MEDLINE和其他生命科學期刊的生物

3、醫(yī)學文獻最早可回溯到1948年提供部分全文和其他相關資源的鏈接,一、PubMed簡介,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,一、PubMed簡介,2.PubMed的由來 創(chuàng)刊:最早可以追溯到1879年美國NLM編譯出版的醫(yī)學文獻檢索刊物《醫(yī)學索引》（Index Medicus, IM）。,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,1964年:為了實現(xiàn)IM的自動化編輯出版，NLM開發(fā)了“醫(yī)學文獻分析與檢索系統(tǒng)”（Medi

4、cal Literature Analysis and Retrieval System, 簡稱MEDLARS）.目前MEDLARS已擁有40多個數(shù)據(jù)庫，其中最重要、最大、且發(fā)展最早的為MEDLINE(MEDLARS ON LINE) 生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,1971年: MEDLINE正式建成聯(lián)機數(shù)據(jù)庫，并通過MEDLARS開展國際聯(lián)機檢索服務。自MEDLINE投入聯(lián)機檢索服務以來，一直成為ME

5、DLARS最大的使用頻率最高的數(shù)據(jù)庫。,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,1983年：隨著光盤技術的發(fā)展，MEDLINE光盤數(shù)據(jù)庫建成，并得到了廣泛的應用。1997年9月26日， MEDLINE網(wǎng)絡版開通，取名PubMed，并向全球免費開放。,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,很多醫(yī)務工作者寧可在每次檢索時都花上成倍的時間，卻不愿花上幾個小時去認真研究一下PubMed。"君欲善其事，必先利其器"，Pu

6、bMed就好像一把功能強大的槍，你決不能僅僅滿足于知道扣動扳機就可以發(fā)射子彈，更重要的是，你要知道如何利用準星瞄準，如何把這把槍的功能發(fā)揮到及至。,一、PubMed簡介,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,一、PubMed簡介,,,,出版商提供的書目信息,PreMedline,MEDLINE,,與NCBI其它數(shù)據(jù)庫的鏈接,3.PubMed的數(shù)據(jù)范圍,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,3.1 MEDLINE基本情況出版：美國

7、國家醫(yī)學圖書館（National Library of Medicine, NLM）。印刷版 1879聯(lián)機版 1971光盤版 1983網(wǎng)絡版 1997,MEDLINE數(shù)據(jù)庫簡介,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,MEDLINE數(shù)據(jù)庫簡介,收錄范圍：收錄7538種（2009.10.11） 權威期刊，包含50種語言，涉及70多個國家（其中中國48種），約40萬篇/年，已經(jīng)累計2100余萬篇。內(nèi)容涉及生物

8、醫(yī)學各個領域；85%原文為英語。回溯年代：1948年至今每條記錄標有[indexed for MEDLIEN]標記,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,內(nèi)容涵蓋三種重要的紙本醫(yī)學文獻檢索工具：Index Medicus Index to dental Literature International Nursing Index,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院

9、,,學科范圍：基礎生命科學臨床生命科學 生物科學 解剖學組織學化學與藥物心理學社會醫(yī)學農(nóng)業(yè) 醫(yī)技設備學 　醫(yī)技工業(yè)學 醫(yī)學信息學使用詞表：MeSH（醫(yī)學主題詞表）,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,3.2 PreMEDLINE,是一種由正在加工處理中的文獻記錄組成的數(shù)據(jù)庫，這些新記錄還未被標引，暫時存放在PreMEDL

10、INE數(shù)據(jù)庫中。每天更新，經(jīng)過標引（增加主題詞、文獻類型、數(shù)據(jù)庫存取號等字段）以后轉入Medline，一旦記錄被轉入到Medline數(shù)據(jù)庫，就被從PreMEDLINE數(shù)據(jù)庫中刪除。每條記錄標有[in Process]標記。,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,Pre-Medline最新信息,Medline,New Data,Collect,PubMed,Process,,,PubMed,一周以后,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理

11、學院,（Publisher-Supplied Citation） 出版商直接向PubMed提供的非Medline收錄的電子刊物，每條記錄標有[ as supplied by publishers]標記。（如：Science或Nature中的地質學文獻等）。,3.3出版商提供的書目信息,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,標記不同，其數(shù)據(jù)來源亦不同,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,3.4與NCBI其它數(shù)據(jù)庫的鏈接,

12、Nucleotide：DNA序列數(shù)據(jù)庫Protein：蛋白質序列數(shù)據(jù)庫Genome：基因組序列數(shù)據(jù)庫Structure：分子結構模型數(shù)據(jù)庫OMIM：人類孟德爾遺傳學在線數(shù)據(jù)庫PMC: PubMed中心，免費全文期刊檢索,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,與NCBI其它數(shù)據(jù)庫的鏈接,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,3.特點收錄生物醫(yī)學權威期刊最多 世界上70多個國家的7000多種權威期

13、刊多種檢索方法，多條檢索途徑時效性極強(每周更新)回溯年代久遠（1948年至今）利用MeSH作為轉換詞表，標引質量高部分文獻可以免費獲取全文檢全率、檢準率高,PubMed簡介,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,4、PubMed主頁網(wǎng)址：http://www. nlm.nih.gov,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,,,,簡介,基本檢索,華中科技大學同濟醫(yī)

14、學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,PubMed簡介,PubMed comprises more than 21 million citations for biomedical literature from MEDLINE, life science journals, and online books. Citations may include links to full-text content from PubMed Central

15、 and publisher web sites.,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,一、PubMed簡介,二、檢索途徑和方法,三、檢索結果處理,四、其他輔助檢索,主要內(nèi)容,五、免費獲取全文,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,1、基本檢索 2、高級檢索 3、主題詞檢索,二、檢索途徑和方法,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,1.基本檢索,MeSH轉換表（詞語檢索及自動詞語匹配

16、）期刊轉換表短語表作者姓名索引邏輯運算符檢索,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,Pubmed基本檢索實例例一     “肝癌和肝炎的關系” “l(fā)iver cancer ” 和 “hepatitis”第一步 選擇關鍵詞 輸入檢索框 liver cancer hepatitis,華中科技大學同濟

17、醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,1.基本檢索,,檢索前，選擇需查詢數(shù)據(jù)庫。下拉菜單中顯示Entrez系統(tǒng)提供的所有數(shù)據(jù)庫，可任意選擇進行檢索。,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,,,,可看到該檢索詞下命中的所有文章、綜述及免費全文,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,Combined Functional Genome Survey of Therapeutic Target

18、s for Hepatocellular Carcinoma.Satow R, Shitashige M, Kanai Y, Takeshita F, Ojima H, Jigami T, Honda K, Kosuge T, Ochiya T, Hirohashi S, Yamada T.Clin Cancer Res. 2010 Apr 13. [Epub ahead of print]PMID: 20388846 [PubMe

19、d - as supplied by publisher]Related citations,這條記錄包含幾個字段?,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,文摘格式,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,注意檢索詞的使用,,截詞檢索 當檢索詞結尾不確定時,可用 * 替代精確檢索 用雙引號“ ”將要檢索的多個詞限定為一個詞進行檢索,看下面的例子!,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,截詞檢索和字段限定檢

20、索,,,,,,例如：輸入cell*[ti]可以查出標題中含cell、cells、celliferous、cellophane和cellular等詞的文獻。,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,“ ”將短語做為不可分割的整體進行檢索。如：“oxygen free radicals”注意：“ ”必須為英文半角狀態(tài)下輸入,,,,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,1、基本檢索 2、高級檢索

21、 3、主題詞檢索,二、檢索途徑和方法,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,2.高級檢索,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,高級檢索界面下可進行多種檢索條件的限定。同時可顯示檢索歷史，允許使用檢索史序號進行組配檢索。,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,檢索框,,,檢索史,限定檢索,,30個字段,可選擇作者、刊名、出版日期等多個項目進行任意組合檢索 。如果輸入框不夠，可點擊“Add More F

22、ields”添加,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,限定檢索,字段限定檢索,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,高級檢索—限定檢索,設定只搜索包含摘要、全文或免費全文的文獻在特定的年齡組、性別組、人類或動物學范圍內(nèi)搜索只搜索某語種出版的文獻或特定的文章類型只搜索PubMed數(shù)據(jù)庫的某一子數(shù)據(jù)庫只在某一特定的字段中搜索，缺省是所有字段,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,Eg.檢索2002年以來發(fā)表在Nature

23、雜志上關于糖尿?。╠iabetes）的英文文獻，要求能獲得免費全文,限制檢索案例,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,檢索框輸入檢索詞,對應字段名稱填寫期刊名稱和時間范圍,,,,限定只鏈接到可免費獲取的全文,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,限定語種為英文,最后點擊檢索輸入框后的Search,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,,13篇。大大減少了文獻數(shù)量,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,高級檢

24、索——檢索史（ Search History ）,當至少運行一次檢索后，即可使用History檢索史中顯示的是你前面所做的查詢方案和查詢結果（檢索序號、檢索式、檢索時間和檢索結果數(shù)量） 注:1、檢索史中最多可保留100個檢索式，超過100個時將自動刪除最早的檢索式。 2、系統(tǒng)在休止狀態(tài)對檢索式的保留時間為8小時，8小時后檢索式自動消失。,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院

25、,詳細檢索策略（Details）,主要用于描述所輸入檢索式的詳細檢索過程，即系統(tǒng)將用戶所輸入的檢索詞自動轉換為哪些詞（如MeSH詞等），并使用什么樣的句法（檢索規(guī)則）來進行檢索。同時也包含了任何的錯誤信息。,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,,系統(tǒng)將輸入的檢索詞與MeSH轉換表進行對照,自動按照轉換后的檢索式進行組配和檢索.,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,1、基本檢索

26、 2、高級檢索 3、主題詞檢索,二、PubMed的檢索途徑和方法,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,3、主題檢索,主題詞檢索,,,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,3、主題檢索,單篇/多篇引文匹配 臨床咨詢專題咨詢,主題詞檢索 期刊檢索臨床實驗外部鏈接,,,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,3、主題詞檢索（MeSH Database）,主題詞數(shù)據(jù)庫（MeSH

27、 Database）在“MeSH Database”]檢索提問框內(nèi)輸入檢索詞后系統(tǒng)將自動主題詞表進行匹配檢索，有的非主題詞將轉換為主題詞，可瀏覽主題詞的定義、瀏覽樹狀結構并進行選擇，并能提供可供組配的副主題詞進行檢索，還提供是否只針對主要主題詞檢索及是否進行擴展檢索等功能,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,MeSH Database：例：從主題途徑查找 FK506副作用和腎移植的文獻,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥

28、衛(wèi)生管理學院,,,,,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,主題詞輪排,,,提示相關詞,,主題詞輪排表,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,主題詞細節(jié)屏,主題詞詞義注釋,,,,主題詞細節(jié)屏,副主題詞選擇,主題詞詞義注釋,不擴展檢索,,,,,加權檢索,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,曾用詞,藥理作用,樹狀結構,,,,曾用詞,入口詞,樹狀結構,藥理作用,,,,,華中科技大學

29、同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,選擇發(fā)送方式Search Box with ANDSearch Box with ORSearch Box with NOT,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,,search box,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,,,題錄格式界面,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,一

30、、PubMed簡介,二、檢索途徑和方法,三、檢索結果處理,四、其他輔助檢索,主要內(nèi)容,五、免費獲取全文,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,三、檢索結果處理,1、檢索結果的顯示與標記 2、檢索結果的保存及定購,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,檢索結果顯示默認為題錄格式每頁顯示20條記錄,,,結果顯示格式,,每頁顯示記錄數(shù),,結果排序方式,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,純文本方式顯示,,華中科技大學同濟

31、醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,純文本顯示記錄,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,文摘顯示格式,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,MEDLINE格式,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,,可鏈接到SpringerLink數(shù)據(jù)庫獲取全文 ，但是是收費的,可鏈接到PubMed中心獲取免費全文,全文鏈接圖標,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,剪切板靜止狀態(tài)下最長

32、保存8小時，最多可以保存500條記錄,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,以郵件方式發(fā)送記錄,,填寫郵箱地址,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,一、PubMed簡介,二、檢索途徑和方法,三、檢索結果處理,四、其他輔助檢索,主要內(nèi)容,五、免費獲取全文,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,四、其他輔助檢索,PubMed Service期刊數(shù)據(jù)庫(Journal Database) 單篇引文匹配器（Single Cit

33、ation Matcher）多篇引文匹配器（Batch Citation Matcher）臨床咨詢（Clinical Queries）我的NCBI （My NCBI ）,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,Journal Database (期刊數(shù)據(jù)庫),,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,Journal Database (期刊數(shù)據(jù)庫),Journal Database (期刊數(shù)據(jù)庫) 可輸入刊名全稱、縮寫或國

34、際標準期刊號（ISSN)檢索特定期刊的編目信息； 可通過 links to full-text websites 鏈接進入所有與PubMed建立鏈接的生物醫(yī)學期刊列表；,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,檢索： PubMed中收錄關于高血壓(hypertension)的期刊有哪些？,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,單篇引文匹配器,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,單篇引文匹配器,輸入刊名、日期、卷、期、頁碼

35、、作者、題目中的一項或多項內(nèi)容進行檢索，系統(tǒng)返回文獻記錄結果,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,單篇引文匹配器,例：引文匹配器（Single Citation Matcher） nursing，2008，38（12）：61,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,Clinical Queries（臨床咨詢）,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,Clinical Queries（臨床咨詢）,應用Clinical Querie

36、s（臨床提問）檢索循證醫(yī)學文獻：1、列有臨床醫(yī)生常用的類目，如therapy（治療）、Diagnosis（診斷）、etiology（病因）和prognosis（預后）2、可以用來檢索臨床實踐過程中遇到的一些具體問題，如系統(tǒng)評價、Mete分析、臨床試驗、循證醫(yī)學、實踐指導以及有關遺傳學方面的問題等,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,Clinical Queries（臨床咨詢）,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,Clini

37、cal Queries（臨床咨詢）,檢索有關“高血壓合并糖尿病的診斷”,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,一、PubMed簡介,二、檢索途徑和方法,三、檢索結果處理,四、其他輔助檢索,主要內(nèi)容,五、免費獲取全文,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,五、免費獲取原文（Open Access）在PubMed有約5%的期刊 ，可以免費瀏覽到全文。（1）通過自由詞直接查找全文（2）通過期刊列表查找全文,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)

38、藥衛(wèi)生管理學院,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,Full text 格式,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,PDF 格式,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,Advanced search,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,,華中科技大學同濟醫(yī)學院醫(yī)藥衛(wèi)生管理學院,,