帶有基因型誤判的關聯(lián)分析中的反復測量方法.pdf

1、在人類遺傳學關聯(lián)分析研究中，基因型誤判(genotype misclassification)是非常常見的現(xiàn)象。當病例組和對照組所對應的誤判模型是一致的時候，雖然Pearson x<'2>檢驗的Ⅰ型錯誤仍然是正確的，但是功效可能會有所降低。目前，絕大部分處理基因型錯誤(genotypingerrors)的方法是假定誤判模型為先驗已知，或者誤判概率模型可以通過無誤差的金標準(gold standard)的儀器測量得到。但是，在實際應用中，

2、誤判概率通常沒有先驗信息，另外金標準方法通常因為過于昂貴而無法實施。 重復測量(repeated measurement)設計提供了可以估計誤判概率的一種可行性方法。在這個設計中，當誤判模型足完全未知的情況下，一部分研究對象需要被重復測量(5次或5次以上)。我們將這種重復測量方法應用于基因關聯(lián)分析(genetic association analysis)?；ㄙM-效用(cost-effectiveness)研究表明，當測量表現(xiàn)型

3、(phenotype)與基因型(genotype)所需的費用的比值，或者誤判率比較大的時候，重復測量設計比常用的病例對照設計(case-control de-sign)更有效。同時，功效的增加量(power gain)對遺傳模型、遺傳相對風險率(genetic relativerisk)以及總體高風險等位基因頻率(high-risk allele frequency)等因素不敏感，而這些因素在傳統(tǒng)的關聯(lián)分析中都是些重要的因素，并且在研究