環(huán)二肽及其與十二烷基磺酸鈉相互作用的理論化學(xué)研究.pdf

1、環(huán)二肽是環(huán)肽中氨基酸個(gè)數(shù)最少的一類化合物，具有明顯的生理活性，在生物體的生命活動(dòng)中扮演著極其重要的角色。環(huán)二肽穩(wěn)定性的研究對(duì)藥物合成以及生物活性機(jī)理的探究具有重要的指導(dǎo)意義。本文構(gòu)建了含賴氨酸、精氨酸、組氨酸的環(huán)二肽及其相應(yīng)直鏈肽的構(gòu)型，對(duì)其進(jìn)行量子化學(xué)計(jì)算，分析分子的穩(wěn)定性。在此基礎(chǔ)上，對(duì)這些環(huán)二肽與十二烷基磺酸鈉(SDS)的相互作用進(jìn)行理論化學(xué)研究。
　　對(duì)含賴氨酸、精氨酸、組氨酸的環(huán)二肽進(jìn)行幾何全優(yōu)化，初始構(gòu)型中的船式六圓環(huán)

2、轉(zhuǎn)變?yōu)閯傂云矫姝h(huán)；以含lys二肽為例分析比較了含賴氨酸的環(huán)二肽和相應(yīng)直鏈肽優(yōu)化后的能量值。對(duì)不同氨基酸組成的含lys二肽，能量值的大小順序都是環(huán)二肽>H型直鏈二肽>coated型直鏈二肽。lys-gln和lys-asn的二肽能量差明顯小于大多數(shù)二肽，lys-glu和lys-asp的二肽能量差明顯大于大多數(shù)二肽。coated型直鏈肽優(yōu)化后，呈現(xiàn)出β片層結(jié)構(gòu)。影響二肽能量的主要因素是側(cè)鏈氨基酸上R基團(tuán)的不同。
　　本文對(duì)計(jì)算所得的二肽

3、與DS-相互作用的的結(jié)合能進(jìn)行分析比較。結(jié)果表明，含賴氨酸二肽中，lys-pro環(huán)二肽比相應(yīng)直鏈二肽更容易與SDS結(jié)合。含精氨酸二肽中有7種二肽的相應(yīng)環(huán)二肽比直鏈二肽更容易與SDS結(jié)合，含組氨酸二肽中有10種二肽的相應(yīng)環(huán)二肽比直鏈二肽更容易與SDS結(jié)合。其余的二肽相反。從結(jié)合值的大小來看，這三類堿性氨基酸二肽與SDS作用結(jié)合的容易程度順序?yàn)椋航M氨酸>賴氨酸>精氨酸。
　　對(duì)與SDS作用后的直鏈二肽進(jìn)行二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測，根據(jù)構(gòu)型中的二面