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文檔簡介
1、本論文利用線粒體基因序列和微衛(wèi)星標記對我國菜蛾盤絨繭蜂地理種群的遺傳結(jié)構(gòu)進行了研究,通過分析種群遺傳多樣性參數(shù)、種群遺傳結(jié)構(gòu)和群口歷史,明確了不同地理種群間的遺傳分化程度,探討了影響種群分化的因素,具體結(jié)果如下:
(1)擴增得到我國菜蛾盤絨繭蜂12個地理種群共158個個體的2段線粒體基因序列和17個微衛(wèi)星位點標記,覆蓋了我國代表性區(qū)域。其中cox1共7個單倍型,cytb共8個單倍型,cox1和cytb聯(lián)合區(qū)域共12個單倍型。1
2、7個微衛(wèi)星位點共檢測到242個等位基因,每個種群的等位基因總數(shù)均大于50。
(2)利用兩種分子標記進行分析,分析我國12個菜蛾盤絨繭蜂種群內(nèi)存在明顯的遺傳分化。其中基于2個線粒體基因序列的遺傳分化系數(shù)Fst在–0.074~0.917之間,66組兩兩種群間共42組存在顯著的遺傳分化;基于17個微衛(wèi)星位點的遺傳分化系數(shù)Fst在–0.006~0.286之間,66組兩兩種群間共50組存在顯著的遺傳分化。
云南地區(qū)種群的核苷酸
3、多樣性和單倍型多樣性大于其他種群,各種群的多態(tài)信息含量均大于0.500。12個種群的等位基因平均數(shù)(MNA)、觀測雜合度(Ho)、期望雜合度(He)、基因豐富度(Ar)范圍分別為:4.765到8.000,0.590到0.783,0.656到0.788,3.067到3.821。
(3)基于兩種分子標記構(gòu)建的NJ樹,以及2個線粒體基因單倍型網(wǎng)狀分析表明,我國菜蛾盤絨繭蜂很可能分化成遺傳上不同但與地理位置相關(guān)的3個支系:北方支系、中
4、部支系和西南支系。北方支系包括新疆地區(qū)及東北地區(qū)范圍的種群,中部支系包括陜西地區(qū)、北京地區(qū)、山東地區(qū)、湖南地區(qū)及兩廣地區(qū)范圍的種群,西南支系包括云南地區(qū)及四川地區(qū)的種群。以云南種群為代表的西南支系明顯與其他支系間存在遺傳分化,新疆種群和東北種群為代表的北方支系也明顯與中部支系間存在遺傳分化。單倍型進化樹分化時間分析表明,西南支系與其他支系最早于410萬年前出現(xiàn)分化,北方支系與中部支系最早于90萬年前出現(xiàn)分化。
?。?)利用兩種分
5、子標記方法計算出的種群遺傳距離與種群地理距離作的相關(guān)性狀點狀分析(Mantel-test)表明,菜蛾盤絨繭蜂種群間的遺傳分化與地理位置存在顯著相關(guān)性(線粒體基因:r=0.595;P=0.001;微衛(wèi)星標記:r=0.651;P=0.012)。
利用 BAPS(線粒體基因序列和微衛(wèi)星標記)、GENELAND(線粒體基因序列和微衛(wèi)星標記)和STRUCTURE(微衛(wèi)星標記)等3種方法進行分析。基于線粒體基因和微衛(wèi)星標記的BAPS分析均
6、將我國菜蛾盤絨繭蜂分為3個群組?;诰€粒體基因的GENELAND分析將我國菜蛾盤絨繭蜂分為4個群組(新疆兩個種群被分為兩個不同分支),基于微衛(wèi)星標記則分為3個群組。基于微衛(wèi)星標記的STRUCTURE分析同樣將我國菜蛾盤絨繭蜂分為3個群組。發(fā)現(xiàn)兩種分子標記的結(jié)果因數(shù)據(jù)類型的不同,產(chǎn)生的結(jié)果并不完全一致,但均表明:我國菜蛾盤絨繭蜂存在3個群組,即西南群組、中部群組與北方群組,與進化樹結(jié)果一致。
?。?)通過兩種分子標記對菜蛾盤絨繭蜂
7、12個種群的基因流進行分析,結(jié)果表明3個群組間基因流水平都較低,低水平的基因流是由于菜蛾盤絨繭蜂不具有遷飛性且本身存在地理隔離現(xiàn)象引起。
(6)基于線粒體基因序列的中性檢驗結(jié)果表明,黑龍江哈爾濱、陜西楊凌、廣西南寧、吉林長春、新疆烏魯木齊、新疆阿拉爾、云南昆明等7個種群的Tajima’s D值從–2.333~2.611,顯著背離0。通過分析3個群組菜蛾盤絨繭蜂的錯配分布發(fā)現(xiàn),觀測值與模擬值基本符合,說明該群組均符合群體擴張假說
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