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簡介:浙江大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院博士學(xué)位論文中國腎形腎狀線蟲不同地理群體形態(tài)、分子及生物學(xué)特性研究姓名張燕申請學(xué)位級(jí)別博士專業(yè)植物病理學(xué)指導(dǎo)教師鄭經(jīng)武20100401殖兩個(gè)類群;兩性生殖群體中A型與GENBANK中登錄的腎形腎狀線蟲兩性生殖群體聚合在一起,而B、C型聚合在一起,腎形腎狀線蟲兩性生殖群體共形成了三個(gè)分支,該結(jié)果與腎形腎狀線蟲ITS區(qū)PCRRFLP結(jié)果一致。對ITS區(qū)中的ITSL和ITS2序列進(jìn)行了分別的分析和比對,結(jié)果顯示腎形腎狀線蟲兩性生殖群體間RDNAITS、ITSL及ITS2都存在明顯的變異,其中ITSL較ITS和ITS2變異相對較大,兩性生殖群體和孤雌生殖群體序列相似度相對較低。5腎形腎狀線蟲不同地理群體28SRNA基因中D2D3區(qū)的PCR擴(kuò)增及序列分析,結(jié)合GENBANK中登錄的腎形腎狀線蟲28SRNA基因中D2D3區(qū)序列DQ328713及足MACRODORATUS28SRNA基因中D2D3區(qū)序列DQ328711進(jìn)行比對分析,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果表明不同地理群體的腎形腎狀線蟲28SRNA基因中D2D3區(qū)擴(kuò)增片段長度約為780BP我國33個(gè)腎形腎狀線蟲群體與DQ328713比較相似度為982998%,其中HN8、HNL7和FJ56與DQ328713的相似度為991998%以上,而與足MACRODORATUSD2D3區(qū)序列DQ32871L相比較則差異較大,相似度僅為771。786%;本研究為國際上首次對腎形腎狀線蟲種內(nèi)各群體問的28SRNA中D2D3區(qū)進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化研究,有關(guān)的腎形腎狀線蟲的分子數(shù)據(jù),對該蟲的分子鑒定有直接的應(yīng)用價(jià)值。6系統(tǒng)研究了我國腎形腎狀線蟲的生活史及繁殖力。通過對大豆的接種實(shí)驗(yàn),確定了我國腎形腎狀線蟲在272℃條件下,從侵染大豆根部到完成整個(gè)生活史需27D,腎形腎狀線蟲的繁殖力隨接種量的增加而降低。7腎形腎狀線蟲梯度接種煙草、番茄和黃瓜的實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示在接種量低于50條/盆時(shí),腎形腎狀線蟲的危害不明顯,而接種量為500條/盆以上時(shí),植株地上部和根系統(tǒng)生長都受到影響,接種量為5000條/盆時(shí),植株地上部嚴(yán)重矮化,根系統(tǒng)不發(fā)達(dá),須根系很少;腎形腎狀線蟲在三種寄主上的繁殖情況與接種大豆的趨勢相同。本研究將有助于腎形線蟲的形態(tài)及分子分類的進(jìn)一步研究,為了解我國腎形腎狀線蟲的危害及加強(qiáng)防治提供了參考和依據(jù)。關(guān)鍵詞腎狀屬;腎形腎狀線蟲;足MACRODORAMS;兩性生殖群體;孤雌生殖群體;RDNAITS區(qū)28SRNA基因中D2D3區(qū);相似度;PCRRFLP;系統(tǒng)發(fā)育分析;生活史;繁殖系數(shù);致病性
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簡介:軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院研究生學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)性聲明秉承軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶W(xué)風(fēng)和科研作風(fēng),本人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下獨(dú)立進(jìn)行的研究工作和取得的研究成果,除了文中特別加以標(biāo)注和致謝之處外,論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包含為獲得芏圭墮堂盤鱟瞳或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示了謝意。論文作者簽字地簽字日期2Q年土月J衛(wèi)日軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院保護(hù)知識(shí)產(chǎn)權(quán)聲明本學(xué)位論文作者完全了解星圭匡堂鮭堂區(qū)對研究生在學(xué)其間撰寫的論文知識(shí)產(chǎn)權(quán)保護(hù)的相關(guān)規(guī)定。本人撰寫的論文是在導(dǎo)師具體指導(dǎo)下,并得到相關(guān)研究經(jīng)費(fèi)支持下完成的,其數(shù)據(jù)和研究成果歸屬于導(dǎo)師和作者本人,知識(shí)產(chǎn)權(quán)單位屬呈主匡堂登堂墮本人保證畢業(yè)后,以本論文數(shù)據(jù)和資料發(fā)表論文或使用論文工作成果時(shí)署名第一單位仍然為芏圭匿堂盤鱟瞳。芏圭墮堂盤堂睦有權(quán)保留學(xué)位論文及其電子版,公布論文的全部或部分內(nèi)容,可以采用影印、縮印或其他復(fù)制手段保存論文、匯編以供查閱和借閱。保密學(xué)位論文在解密后適用本聲明論文作者簽字鯉指導(dǎo)教師簽字掣簽字日期2Q年生月衛(wèi)日簽字日期2Q年生月』日
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簡介:中圖分類號(hào)UDC學(xué)校代碼10055密級(jí)公開高鹽犬瀑博士學(xué)位論文低溫解烴菌T77的基因組學(xué)、蛋白組學(xué)研究及烷烴單加氧酶的分子生物學(xué)研究GENOMICANDPROTEOMICRESEARCHANDCHARACTERIZATIONOFTHEALKANEMONOOXYGENASEINPUSILLIMONASSP.T77申請學(xué)位理堂盟±培養(yǎng)單位生塑型堂堂瞳學(xué)科專業(yè)邀生塑堂研究方向基國組堂皇功能基固組堂答辯委員會(huì)主席鹽筮評(píng)閱人韭垂蠱王亟全查昱瞳盔奎麴南開大學(xué)研究生院二。一三年四月南開大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明所呈交的學(xué)位論文,是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行研究工作所取得的研究成果。除文中已經(jīng)注明引用的內(nèi)容外,本學(xué)位論文的研究成果不包含任何他人創(chuàng)作的、已公開發(fā)表或者沒有公開發(fā)表的作品的內(nèi)容。對本論文所涉及的研究工作做出貢獻(xiàn)的其他個(gè)人和集體,均已在文中以明確方式標(biāo)明。本學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明的法律責(zé)任由本人承擔(dān)。學(xué)位論文作者簽名奎注2013年6月5日非公開學(xué)位論文標(biāo)注說明本頁表中填寫內(nèi)容須打印根據(jù)南開大學(xué)有關(guān)規(guī)定,非公開學(xué)位論文須經(jīng)指導(dǎo)教師同意、作者本人申請和相關(guān)部門批準(zhǔn)方能標(biāo)注。未經(jīng)批準(zhǔn)的均為公開學(xué)位論文,公開學(xué)位論文本說明為空白。論文題目申請密級(jí)口限制≤2年.口秘密≤10年口機(jī)密≤20年保密期限20年月日至20年月日審批表編號(hào)批準(zhǔn)日期20年月日南開大學(xué)學(xué)位評(píng)定委員會(huì)辦公室蓋章有效注限制K2年可少于2年秘密★10年可少于LO年機(jī)密★20年可少于20年
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簡介:基于分子生物學(xué)技術(shù)的黃渤海沿岸兩種常見橈足類的現(xiàn)場食物研究PCRBASEDINSITUDIETARYANALYSISOFTWOCOMMONCOPEPODSINBOHAISEAANDYELLOWSEACOASTALWATERS學(xué)位論文答辯日期201362指導(dǎo)教師簽字答辯委員會(huì)成員簽字
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簡介:碩士學(xué)位論文碩士學(xué)位論文花生種子中黃曲霉生防細(xì)菌的分子生物學(xué)分類研究STUDYOFENDOPHYTICBACTERIAISOLATEDFROMPEANUTSEEDSINHIBITINGAFLATOXINBYMOLECULARBIOLOGYMETHOD任靜任靜哈爾濱工業(yè)大學(xué)哈爾濱工業(yè)大學(xué)2013年6月CLASSIFIEDINDEXQ939UDC5392DISSERTATIONFTHEMASTERDEGREEINSCIENCESTUDYOFENDOPHYTICBACTERIAISOLATEDFROMPEANUTSEEDSINHIBITINGAFLATOXINBYMOLECULARBIOLOGYMETHODCIDATERENJINGSUPERVISPROFYANPEISHENGACADEMICDEGREEAPPLIEDFMASTEROFSCIENCESPECIALITYMICROBIOLOGYAFFILIATIONSCHOOLOFMARINESCIENCETECHNOLOGYDATEOFDEFENCEJUNE2013DEGREECONFERRINGINSTITUTIONHARBININSTITUTEOFTECHNOLOGY
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簡介:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文聚磷菌多聚磷酸鹽激酶的分子生物學(xué)研究及高效除磷工程菌的構(gòu)建姓名李波申請學(xué)位級(jí)別碩士專業(yè)微生物學(xué)指導(dǎo)教師崔中利20080601聚磷菌多聚磷酸鹽激酶的分子生物學(xué)研究及高效除磷工程茵的構(gòu)建GM6PPKL和GM6PHA兩株工程茵除磷能力較原始菌株GM6和對照菌株GM6P5有了顯著提高,而且在無抗性條件下質(zhì)粒穩(wěn)定,因此有著潛在的應(yīng)用前景通過模擬EBPR工藝,發(fā)現(xiàn)GM6PPKL和GM6PHA在厭氧/好氧交替的環(huán)境條件下強(qiáng)化表達(dá)不但提高了菌體好氧段的吸磷能力,而且厭氧段磷的釋放和PHA的合成較之原始菌株也有顯著增加,這說E凋PPKL和PHA的強(qiáng)化表達(dá),不但增強(qiáng)了茵體的除磷能力,也在一定程度上提升了碳磷循環(huán)代謝的能力,使得菌體有更好的除磷和除COD的能力關(guān)鍵詞強(qiáng)化生物除磷、多聚磷酸鹽、多聚磷酸鹽激酶、基因工程茵Ⅱ
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簡介:16SRDNA分子生物學(xué)分析技術(shù)在水處理工藝中的初步應(yīng)用聲明聲明本人鄭重聲明本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下,獨(dú)立進(jìn)行研究工作所取得的成果,撰寫成碩士學(xué)位論文“16SRDNA分子生物學(xué)分析技術(shù)在水處理工藝中的初步應(yīng)用”。除論文中己經(jīng)注明引用的內(nèi)容外,對本文的研究做出重要貢獻(xiàn)的個(gè)人和集體,均已在文中以明確方式標(biāo)明。本論文中不含任何未加明確注明的其他個(gè)人或集體已經(jīng)公開發(fā)表或未公開發(fā)表的成功。本聲明的法律責(zé)任由本人承擔(dān)。學(xué)位論文作者簽名2004年2月20日_一一一一一一216SRDNA分子生物學(xué)分析技術(shù)在水處理工藝中的初步應(yīng)用ABSTRACTABSTRACTITISREPORTEDTHATWITHOUTCULTIVATIONDNACOULDBEDIRECTLYEXTRACTEDFROMENVIRONMENTALSAMPLESWITHMOLECULARBIOLOGICALMETHODSSUCHASPOLYMERASECHAINREACTIONPCRANDDENATURTINGGRADIENTGELELECTROPHORESISDGGETHECOMMUNITYDIVERSITYANDMAINBACTERIASPECIESOFENVIRONMENTALSAMPLECANBESTUDIEDBYANALYZING16SRDNAINTHISWORKPCR一DGGETECHNOLOGYHASBEENUSEDINMICROORGANISMANALYSISOFENVIRONMENTALSAMPLEINTHEMAINFILEDOFENVIRONMENTALSCIENCEANDENGINEERINGINCLUDINGACTIVATEDSLUDGEINTRADITIONALMUNICIPALSEWAGETREATMENTANDCHEWBIOFLOCCULATIONPROCESSBIOFILMINNITRIFICATIONSUSPENSIONPACKEDBEDSLUDGEINTREATMENTOFMUNICIPALSEWAGESLUDGESLUDGEIMPACTED妙HIGHCONCENTRATIONNI14ANDN03SLUDGEAFTERCULTUREANDSLUDGEINTHICKOILWASTEWATERTREATMENTTHECOMPARISONOFMICROORGANISMCOMMUNITIESINSLUDGEANDBIOFILMSAMPLESINTRADITIONALMUNICIPALSEWAGETREATMENTANDDIFERPROCESSOFCHEWBIOFLOCCULATIONTREATMENTWASGIVENTHEIMPACTEDINFLUENCEOFHIGHCONCENTRATIONNWANDN03INMICROORGANISMCOMMUNITIESOFSLUDGEWASBEENANALYSEDINPAPERTHEMUTATIVECOURSEINDIVERSITYOFBACTERIALINEFICIENTMUNICIPALSEWAGESLUDGETREATMENTWASALSOBEENSTUDIEDANDBESIDESWEANALYSEDTHEDIFERENCEOFBACTERIASPECIESANDBACTERIUMDIVERSITYINTHICKOILWASTEWATERMIDTEMPERATUREANDHIGHTEMPERATURETREATMENTTHESEQUENCESOFSEVERAL16SRDNADGGEFRAGMENTSHAVEBEENDETERMINEDANDSOMEPOSSIBLEBACTERIASHAVEBEENCONFIRMEDINCOMPARISIONINGENEBANKNCBITHERESULTHASSHOWEDTHAT山EPCRDGGETECHNOLOGYCOMBINEDWITHSEQUENCESDETERMINATIONISAFEASIBLEANDEFFICIENTMETHODFORMICROORGANISMANALYSISINENVIRONMENTALSAMPLETHISPAPERALSODISCUSSEDSOMEPROBLEMSINANALYZINGENVIRONMENTALSCIENCEUSINGTHISTECHNOLOGYTHETRENDOFTHESTU勿認(rèn)THEFIELDOFENVIRONMENTALSCIENCEANDENGINEERINGWASALSOSIMPLYINTRODUCEDKEYWORD16SRDNAPCRDGGEMOLECULARBIOTECHNOLOGYENVIRORTMENTALSAMPLEACTIVATEDSLUDGEBIOFILM,,目戶,加,、_6_
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簡介:東北大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要MBR活性污泥菌群結(jié)構(gòu)的分子生物學(xué)解析摘要隨著環(huán)境科學(xué)的發(fā)展,由于傳統(tǒng)的純培養(yǎng)分析方法存在著一定的缺陷,不能滿足環(huán)境分析的要求。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的迅猛發(fā)展,許多分子生物學(xué)技術(shù)被應(yīng)用于環(huán)境中微生物群落的分類、鑒定和微生物種群結(jié)構(gòu)的動(dòng)態(tài)分析中。本文通過以PCRPOLYMERASECHAINREACTIONDGGEDENATURINGGRADIENTGELELECTROPHORESIS、FISHFLORESCENCEINSITUHYBRIDIZATION技術(shù)為主的一些分子生物學(xué)技術(shù),對活性污泥中微生物種群結(jié)構(gòu)的時(shí)空分布特性進(jìn)行了初步探索,旨在從分子生物學(xué)的水平上對膜生物反應(yīng)器中活性污泥樣品的微生物種群結(jié)構(gòu)的變化情況進(jìn)行研究。結(jié)果表明在膜生物反應(yīng)器中試裝置運(yùn)行后期,污泥濃度過高,導(dǎo)致種群結(jié)構(gòu)發(fā)生變化、ZOOGLOEA菌的含量降低、污泥顆粒的粒徑變小,并最終導(dǎo)致處理水質(zhì)的惡化,說明了反應(yīng)器污泥濃度過高對應(yīng)采取一些解決方案;隨著膜生物反應(yīng)器中試裝置運(yùn)行時(shí)間的推移、污泥濃度的增長,種群結(jié)構(gòu)發(fā)生劇烈變化,ZOOGLOEA菌占全菌的比重也隨之變化。為了排除中試裝置的雜質(zhì)干擾問題,簡化實(shí)驗(yàn)方案,進(jìn)行了膜生物反應(yīng)器小試實(shí)驗(yàn)裝置的運(yùn)彳亍研究,采用的原水為人工配制的模擬生活廢水,排除了不必要的干擾因素。在膜生物反應(yīng)器小試實(shí)驗(yàn)裝置的運(yùn)行過程中,觀察梯度凝膠電泳圖譜,可知菌群結(jié)構(gòu)產(chǎn)生變化,且污泥培養(yǎng)一周左右后,優(yōu)勢菌種數(shù)目穩(wěn)定,系統(tǒng)穩(wěn)定運(yùn)行,處理水質(zhì)效果良好。隨著反應(yīng)器的運(yùn)行,ZOOGLOEA菌的比重呈現(xiàn)變化。接種污泥中ZOOGLOCA菌的含量不高,污泥顆粒未成大團(tuán)狀態(tài),不利于水質(zhì)的處理。在接下來的反應(yīng)器運(yùn)行的時(shí)間里,MLSS一直在增長,污泥成大顆粒狀態(tài),ZOOGLOEA菌分泌出大量粘性物質(zhì),吸附菌體及有機(jī)物質(zhì)進(jìn)行分解,水質(zhì)處理效果逐漸轉(zhuǎn)好。關(guān)鍵訶分子生物學(xué);活性污泥;菌群結(jié)構(gòu);梯度凝膠電泳;膜生物反應(yīng)器H東北大學(xué)碩士學(xué)位論文英文縮寫表APSBODCODDGGEDNTPDONSHMBRMLSSMI。VSSPBSPCRSBR英文縮寫表AMMONIMNPERSULFATEBIOLOGICALOXYGENDEMANDCHEMICALOXYGENDEMANDDENATURINGGRADIENTGDELECNOPHORESISDEOXYNUCLEOSIDETRIPHOSPHATEDISSOLVEDOXYGENFLUORESCENCEINSITUHYBRIDIZATIONMEMBRANEBIOREACTORMIXEDLIQUORSUSPENDEDSOLIDSMIXEDVOLATILELIQUORSUSPENDEDSOLIDSPHOSPHATEBUFFEREDSALINEPOLYMERASECHAINREACTIONSEQUENCINGBATCHREACTORⅣ過硫酸銨生化需氧量化學(xué)需氧量變形梯度凝膠電泳脫氧核糖核苷三磷酸溶解氧熒光原位雜交膜生物反應(yīng)器懸浮固體濃度揮發(fā)性懸浮固體濃度磷酸鹽緩沖液聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)序批式反應(yīng)器
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簡介:內(nèi)循環(huán)三相生物流化床生物反應(yīng)器ITFB因其處理效率高、負(fù)荷高、抗沖擊能力強(qiáng)、少發(fā)生污泥膨脹、占地省、易于設(shè)備化等特點(diǎn)已成為一種人們青睞的高效好氧生物反應(yīng)器。就本質(zhì)而言它是一類既具有固定生長法特征又有懸浮生長法特征的反應(yīng)器。其固定生長法特征使得世代時(shí)間長的硝化細(xì)菌能夠在反應(yīng)器內(nèi)生長和積累。因此在適宜條件下內(nèi)循環(huán)生物流化床反應(yīng)器有可能成為高效的硝化反應(yīng)器。近幾年廢水生物脫氮出現(xiàn)了許多新型工藝其中含氨廢水的短程硝化因其能夠節(jié)能降耗、提高反應(yīng)速率、降低剩余污泥產(chǎn)量等特點(diǎn)已經(jīng)成為目前廢水生物脫氮領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。為尋求一種高效穩(wěn)定長期的短程硝化工藝本論文嘗試將短程硝化理念與好氧生物流化床反應(yīng)器結(jié)合通過強(qiáng)化啟動(dòng)、調(diào)控運(yùn)行參數(shù)等方法強(qiáng)化內(nèi)循環(huán)生物流化床生物膜的硝化功能探討內(nèi)循環(huán)生物流化床用于高濃度氨氮廢水處理并實(shí)現(xiàn)亞硝化過程的可行性在此基礎(chǔ)上分析運(yùn)行參數(shù)對實(shí)現(xiàn)穩(wěn)定亞硝化過程的影響從而優(yōu)化運(yùn)行參數(shù)。本研究首先探討了ITFB反應(yīng)器快速啟動(dòng)的條件發(fā)現(xiàn)較短的水力停留時(shí)間和較少的接種污泥量有利于附著生物的增長可以實(shí)現(xiàn)反應(yīng)器的快速啟動(dòng)。根據(jù)課題組的試驗(yàn)結(jié)果采用高NC和低COD的水質(zhì)條件對反應(yīng)器進(jìn)行強(qiáng)化啟動(dòng)。反應(yīng)器經(jīng)強(qiáng)化啟動(dòng)后分別考察了進(jìn)水氨氮濃度、不同影響因子和有機(jī)物對硝化作用和亞硝酸鹽積累的影響并且以成熟的生物膜為對象運(yùn)用熒光原位雜交FISH技術(shù)和聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)PCR技術(shù)分別對生物膜內(nèi)菌群分布情況和優(yōu)勢菌屬進(jìn)行了研究。進(jìn)水氨氮影響試驗(yàn)結(jié)果表明強(qiáng)化啟動(dòng)條件有利于反應(yīng)器在初期NH3N100MGL獲得較高水平的亞硝酸鹽積累亞硝化率平均為79%。但在溶解氧充足的條件下完全硝化反應(yīng)發(fā)生。提高進(jìn)水氨氮濃度從100MGL升至300MGL可以實(shí)現(xiàn)亞硝化但屬于不穩(wěn)定積累當(dāng)反應(yīng)器內(nèi)游離氨濃度隨進(jìn)水氨氮濃度升高而增加至8MGL時(shí)系統(tǒng)內(nèi)硝酸細(xì)菌和亞硝酸細(xì)菌活性均受到抑制系統(tǒng)的硝化效果降低并且硝酸細(xì)菌能夠逐步適應(yīng)高濃度的游離氨使其活性不再受到原來濃度的游離氨的抑制并且這一過程是不可逆的所以通過高濃度游離氨抑制作用來實(shí)現(xiàn)亞硝酸鹽的積累是不穩(wěn)定的。溫度、DO和PH等影響因素試驗(yàn)結(jié)果表明反應(yīng)器實(shí)現(xiàn)亞硝化的最佳運(yùn)行參數(shù)為PH7881DO2030MGLT3335℃。反應(yīng)器在最佳控制參數(shù)條件下運(yùn)行15天亞硝化率從37上升至74氨氮平均去除率達(dá)81。有機(jī)物影響試驗(yàn)結(jié)果表明進(jìn)水添加有機(jī)物異養(yǎng)菌與硝化細(xì)菌對溶解氧的競爭是造成硝化效果降低的主要原因。對添加有機(jī)物前后的生物膜進(jìn)行電鏡掃描發(fā)現(xiàn)添加有機(jī)物后硝化生物膜由致密變成松散生物膜內(nèi)由單一的桿菌演變成包含多種絲狀異養(yǎng)菌的菌群。FISH試驗(yàn)結(jié)果表明處理高濃度氨氮廢水的成熟生物膜樣品硝酸細(xì)菌生長在生物膜內(nèi)層而亞硝酸細(xì)菌沿整個(gè)生物膜厚度方向均有分布然而更多地生長在生物膜的外層且兩種微生物的數(shù)量分布也比較均勻。在處理高氨氮廢水系統(tǒng)中亞硝酸細(xì)菌的主要類型為NITROSOCOCCSP和NITROSOMONASSP硝酸細(xì)菌的主要類型為NITROBACTERSP和AFIPIASP。
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簡介:分類號(hào)UDC密級(jí)1.932286學(xué)位論文金屬膜MBR中活性污泥菌群結(jié)構(gòu)變化的分子生物學(xué)解析作者姓名張攀指導(dǎo)教師朱彤副教授東北大學(xué)機(jī)械工程與自動(dòng)化學(xué)院申請學(xué)位級(jí)別碩士學(xué)科類別工學(xué)學(xué)科專業(yè)名稱化工過程機(jī)械論文提交日期2008年1月18日論文答辯日期2008年Z月1日學(xué)位授予日期2008年3月日答辯委員會(huì)主席評(píng)閱人訓(xùn)盛笠一、專鈺蚌東北大學(xué)2008年1月一。芝,ATHESISFORTHEDEGREEOFMASTERINCHEMICALPROCESSMACHINERYTHECHANGESOFMICROBIALCOMMUNITIESANALYSEINACTIVITIEDSLUDGEOFMETALMEMBRANEBIOLOGYREACTORBYZHANGPANSUPERVISORPROFESSORZHUTONGNORTHEASTERNUNIVERSITYJANUARY2008譬,∥
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簡介:②申請黼濟(jì)大學(xué)工學(xué)碩£學(xué)位論文16SRDNA分子生物學(xué)技術(shù)在除磷菌種群結(jié)構(gòu)分析中的應(yīng)用項(xiàng)粉編譬;瀚寐高技術(shù)礤蟯黢鼴計(jì)劃鶘黜頊融2092AA801320。K海前曙光詩矧資助碉};L03SG繃J培養(yǎng)單位環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院一級(jí)學(xué)科昂境科學(xué)與工程二緞學(xué)科蝰境工程礴究生戴睿指導(dǎo)教師夏圓消教授副指導(dǎo)教師傅以鋼講澤二二OO七年一月摘要變化,表明生物除磷過程中的微生態(tài)系統(tǒng)在此PH范圍內(nèi)的穩(wěn)定性。結(jié)果顯示,研究中所采用的16SRDNA分子生物學(xué)技術(shù),可以對環(huán)境樣品中的微生物進(jìn)行快速分析,真實(shí)而完整的反映其中微生物群落結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性和多樣性,且環(huán)境樣品中具有的多種復(fù)雜成分對分析的影響不大。FISH、RTPCR等分子生物學(xué)定量分析技術(shù),將是后續(xù)研究的熱點(diǎn)。如何將這一分析技術(shù)用于指導(dǎo)工程實(shí)踐,是進(jìn)一步深入研究的主要方向。關(guān)鍵詞16SRDNA,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),變性梯度凝膠電泳,克隆,生物除磷,活性污泥Ⅱ
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簡介:浙江大學(xué)博士學(xué)位論文假單胞菌菌株HF1的尼古丁代謝途徑及其分子生物學(xué)研究姓名邵鐵娟申請學(xué)位級(jí)別博士專業(yè)微生物學(xué)指導(dǎo)教師閔航20070501摘要能與尼吉丁降解無關(guān)。3尼古丁的微生物降解研究結(jié)果表明,假單胞菌HFI可在21H內(nèi)降解培養(yǎng)基中996%終濃度為10GLL的尼古丁,對數(shù)生長期菌體的生長與尼吉丁降解之間存在顯著的相關(guān)性。同時(shí)。培養(yǎng)基PI在菌株生長和尼古丁降解過程中基本保持恒定。菌株HF一1在應(yīng)用微生物技術(shù)處理煙草廢棄物方面具有較強(qiáng)的潛力。利用GCMS和LCMS檢測HF1菌株的尼古丁代謝中間產(chǎn)物發(fā)現(xiàn),假單胞菌HF1代謝尼古丁的途徑與己知的假單胞菌尼古丁代謝途徑存在明顯差異,而與尼古丁在哺乳動(dòng)物中的代謝過程比較相似。除檢測到其他假單胞菌中未曾報(bào)到的尼古提林、脫甲基尼吉丁、可鐵寧、麥斯明等物質(zhì)外,且沒有發(fā)現(xiàn)其他假單胞菌株的尼古丁代謝產(chǎn)物N甲基麥斯嘎,同時(shí)形成一種從未報(bào)道過的、浚綠色的代謝產(chǎn)物。這一切均表明假單胞菌HF可能以一條新的代謝途徑進(jìn)行尼古丁降解利用制備型液相色譜分離褥到4種尼古丁代謝產(chǎn)物,分離峰保留時(shí)間分別為3650,5667,7584和102109RAIN。后3個(gè)樣品在負(fù)離子模式下進(jìn)行ESIMS分析,測得3種物質(zhì)的分子量分別為179DA、195DA和48“/DA,其中分子量為179DA和I95DA的代謝產(chǎn)物初步鑒定為3琥珀酰吡啶和6羥基3琥珀酰吡啶。這2種尼吉丁代謝中間產(chǎn)物的存在表明自3琥珀酰吡啶開始菌株HF1降解尼古丁的途徑與己知假單胞蘑的尼古丁代謝途徑相似。6羥基3琥珀酰吡啶在PSEUDOMONASSPHFI中的去向尚有待于進(jìn)一步研究。4利用雙向電泳及生物質(zhì)譜技術(shù)研究了尼古丁誘導(dǎo)條件下菌株HFI的蛋自質(zhì)表達(dá)圖譜,并對尼古丁誘導(dǎo)的特異性蛋白進(jìn)行了鑒定。研究表明,菌株HFI在尼古丁脅迫條件下新誘導(dǎo)合成65個(gè)特異性蛋白。實(shí)驗(yàn)切取22個(gè)特異性蛋白質(zhì)點(diǎn),利用MALDITOF佃OFMS和ESIMS進(jìn)行了蛋白質(zhì)的鑒定。根據(jù)蛋白質(zhì)某一方面的主要功能,可以將尼古丁誘導(dǎo)襲達(dá)的22個(gè)蛋白分為氨基酸合成、能量代謝、蛋白折疊、脫毒和熱激蛋白、尼古丁代謝相關(guān)及其他功能蛋白等5大類菌株HF1誘導(dǎo)表達(dá)了一系列氨基酸合成相關(guān)蛋白OMITLLINECARBAMOYLTRANSFERASE,THIOLASE等、A1RP合成相關(guān)蛋白SUCCINATEDEHYDROGENASEMALEATECISTRANSISOMERASE等、解毒蛋白及運(yùn)輸?shù)鞍譎SP20FAMILYCATALA∞SUPEROXIDEDISMUTASE等等蛋白來應(yīng)激尼古丁的脅迫,減少尼古丁對菌體細(xì)胞的傷害。尼古丁脅迫條件下菌株HFOL誘導(dǎo)表達(dá)了一種內(nèi)酰胺酶METALLOBETALACTAMASE和一種水解酶HYDROLASEALLAMIDASERELATEDTONICOTINAMIDASE,這兩種酶的誘導(dǎo)表達(dá)表明菌株HF1可能沿著與哺乳動(dòng)物代謝尼古丁相同的途徑將尼古丁轉(zhuǎn)化成為3一琥珀酰吡啶4OXA一3PYRIDYIBUTANAOICACID。尼古丁代謝形成3一琥珀酰毗啶后菌株IIF1沿著已知假單胞菌II
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簡介:山東大學(xué)博士學(xué)位論文惡臭假單胞菌代謝尼古丁分子生物學(xué)研究姓名唐鴻志申請學(xué)位級(jí)別博士專業(yè)微生物學(xué)指導(dǎo)教師許平20080310山東大學(xué)博十學(xué)位論文酶家族I有60%相似性L1’UELGI乇NLPTKARTKHNIKRIDRLLGNRHLHKE,也與轉(zhuǎn)座子TNL0中的轉(zhuǎn)座酶一段序列相似性高達(dá)100%,其功能還未知。通過高分辨質(zhì)譜儀確定了三個(gè)重要化合物化合物1CLOHL3N202的分子離子峰為M/Z19309715MH,化合物2CIOHL5N202的分子離子峰為M/Z19511280MH,化合物3C10H13N20的分子離子峰為M/Z17710224MH,這三種化合物都不是尼古丁降解吡咯途徑的中間化合物,它們的結(jié)構(gòu)信息還需要進(jìn)一步分析。通過高效液相色譜、薄層層析和質(zhì)譜檢測發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化子GTPF能夠通過吡咯途徑降解尼古丁生成Ⅳ甲基麥喔斯明、假氧化尼古丁、3琥珀酰吡啶、6羥基3琥珀酰吡啶、2,5二羥基吡啶,與原始菌株S16代身途徑吻合,說明該轉(zhuǎn)化子含有毗咯降解途徑關(guān)鍵基因,本文主要針對該轉(zhuǎn)化子開展研究。轉(zhuǎn)化子GTPF含有的尼古丁降解基因簇的長度為4,879BP,該基因簇中含有三個(gè)ORF。所有的ORF都是以纈氨酸或者甲硫氨酸起始的,長度都長于100個(gè)氨基酸。在基因簇的兩端都含有轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)子的序列。通過分析,在ORFL的上游有SD序列。NCBIBLAST分析發(fā)現(xiàn),ORFL與細(xì)胞色素C氧化酶亞基I和NADH脫氫酶亞基I有40%的相似性,ORF2序列與PHOTOBACTERIUMPROFUNDUMSS9假設(shè)蛋白有38%相似性,與其它已知功能的蛋白沒有任何相似性。ORF3位于ORF2上游,ORF3序列與尸PUTIDAF1菌中超螺旋蛋白有97%的相似性,與PPUTIDAKT2440的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)子ASNC家族有97%的相似性。這三個(gè)ORF與其它雜環(huán)化合物降解基因沒有相似性,是全新的降解基因。因此,通過進(jìn)一步的亞克隆分析單個(gè)基因的功能是非常必要的。通過PCR的方法對轉(zhuǎn)化子GTPF的基因簇進(jìn)行了亞克隆,構(gòu)建了多個(gè)重組子,對它們代謝尼古丁、3琥珀酰吡啶、6羥基3琥珀酰吡啶的活力進(jìn)行了檢測。獲得了尼古丁降解關(guān)鍵基因NICA,該基因大小為1854BP,能夠?qū)⒛峁哦〗到庵?琥珀酰吡啶,該基因與其它雜環(huán)化合物降解基因沒有相似性,將NICA基因在PET系列載體中表達(dá),純化重組NICA蛋白,初步研究NICA蛋白的性質(zhì)。通過轉(zhuǎn)化子的休止細(xì)胞降解實(shí)驗(yàn)、純酶轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)推測出了尼古丁代謝途徑,補(bǔ)充了與我們課題組報(bào)道的代謝途徑,并第一次用同位素標(biāo)記的實(shí)驗(yàn)證明了Ⅳ甲基麥喔斯明能夠自發(fā)水解生成假氧化尼古丁。VI
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簡介:摘要摘要病原茵檢測是關(guān)系到食品衛(wèi)生、臨床診斷、環(huán)境監(jiān)測等多個(gè)領(lǐng)域的重要研究方向之一。檢測手段的創(chuàng)新能夠迅速推動(dòng)這些領(lǐng)域的發(fā)展。本文介紹了三種基于DNA水平的病原體檢測方法的研究,其中一種和臨床診斷相關(guān),另外兩種和海洋環(huán)境病原菌污染監(jiān)測有關(guān)。這三種方法分別是1豚鼠氣單胞菌AEROMONASCAVIAE的環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測方法研究;2沿岸海水中毒性創(chuàng)傷弧菌VIBRIOVULNIFICUS檢測技術(shù)的研究;3沿岸海水中致病菌污染的檢測方法研究。1豚鼠氣單胞菌環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測方法研究近些年來,有關(guān)于豚鼠氣單胞菌的感染病例報(bào)道越來越多,并逐漸引起人們的重視。豚鼠氣單胞菌主要在病人,尤其是兒童的糞便中分離到。目前從糞便中檢測豚鼠氣單胞菌的常規(guī)方法是選擇性培養(yǎng)和生化鑒定。這些方法需要約3“5天的時(shí)間,因此難以及時(shí)給出診斷結(jié)果。用分子生物學(xué)方法檢測豚鼠氣單胞菌無疑是更好的選擇。在本研究中,針對16S一23SRRNA基因轉(zhuǎn)錄間區(qū)16S一23SRRNAINTERNALTRANSCRIBEDSPACER,ITS序列,本學(xué)位論文研究設(shè)計(jì)和驗(yàn)證了一種環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增100PMEDIATEDISOTHERMALAPPLIFICATION,LAMP檢測豚鼠氣單胞菌的方法,并同時(shí)設(shè)計(jì)了一個(gè)特異性PCR檢測方法作為LAMP法的對照。結(jié)果表明,該LAMP檢測法特異性好、靈敏度高,和PCR方法相比,操作更簡單,檢測時(shí)間更短,并且對設(shè)備要求低,適合于推廣應(yīng)用。2沿岸海水中毒性創(chuàng)傷弧菌檢測技術(shù)的研究創(chuàng)傷弧菌是一種條件致病菌,廣泛分布于河灣、沿岸海水中。它能夠引起胃腸道疾病、敗血癥和傷口感染等病癥,給沿岸居民、游客和海事工作者造成健康威脅。然而,并不是所有的創(chuàng)傷弧菌菌株都具有致病性。而目前已發(fā)表的從海水中檢測創(chuàng)傷弧菌的方法中,都沒有對創(chuàng)傷弧菌的毒性進(jìn)行區(qū)分。本研究建立了兩種用于檢測毒性創(chuàng)傷弧菌的方法。一種是基于VVHA基因和訂凹基因的DNA微陣列雜交法,另一種是基于創(chuàng)傷弧菌毒性相關(guān)基因VCGC的LAMP擴(kuò)增方法。此外,我們分別用了60個(gè)和30個(gè)海水樣本對這兩種方法進(jìn)行了評(píng)估,結(jié)果表明這兩種方法準(zhǔn)確、靈敏、特異性好,適合用于海水中毒性創(chuàng)傷弧菌的檢測。I㈣6㈣054眥5哩Y20ABSTRACTABSTRACTPATHOGENDETECTIONISTHEMOSTIMPORTANCEFORFOODSAFETYCLINICALDIAGNOSISANDENVIRONMENTALMONITORINGTHEINNOVATIONOFNEWPROCEDURESFORPATHOGENDETECTIONCARTBOOSTTHEWORKSIN也ESEFIELDSINTHISDISSERTATIONTHREENEWMOLECULARBIOLOGICALMETHODSHAVEBEENDEVELOPEDFORTHEPATHOGENDETECTIONONEOFTHESEMETHODSISDEVELOPEDFORCLINICALDIAGNOSISWHILETHEOTHERTWOAREUSEDTOMONITORINGPATHOGENICBACTERIAPOLLUTIONINMARINEENVIRONMENTTHEYARE1L00PMEDIATEDISOTHERMALAPPLIFICATIONLAMPLMETHODFORDETECTIONOFAEROMONASCAVIAEINSTOOLSAMPLES,2THEMETHODFORDETECTIONOFVIRULENTVIBRIOVULNIFICUSINCOASTALSEAWATERAND3THEPROCEDUREFORMONITORINGPATHOGENICBACTERIAINCOASTALSEAWATER1LOOPMEDIATEDISOTHERMALAPPLIFICATIONMETHODFORTHEDETECTIONOFAEROMONASCAVIAEINSTOOLSAMPLESAEROMONASCAVIAERECENTLYATTRACTEDAGREATDEALOFATTENTIONBECAUSEOFAGROWINGNUMBEROFCASESCAUSEDBYACAVIAETHISPATHOGENHASBEENMOSTLYISOLATEDFROMSTOOLSPECIMENSESPECIALLYFROMCHILDRENCONVENTIONALIDENTIFICATIONOFTHEPATHOGENSFROMSTOOLSPECIMENSBYSELECTIVECULTURINGANDBIOCHEMICALASSAYSREQUIRED3TO5DAYS,ANDRESULTSARENOTAVAILABLETIMELYFORDETECTIONOFTHISPATHOGENFROMSTOOLSPECIMEN,MOLECULARBIOLOGYMETHODSAREUNDOUBTEDLYMOREDESIRABLETHANTHATOFCONVENTIONALCULTUREMETHODSINTHISSTUDYWEDEVELOPEDALOOPMEDIATEDISOTHERMALAMPLIFICATIONMETHODFORACAVIAEDETECTIONTARGETINGTHE16S23SRRNAINTERNALTRANSCRIBEDSPACERITSREGIONANOTHERSPECIFICPCRASSAYWASALSODEVELOPEDASACONTROLMETHODTOEVALUATETHISLAMPDETECTIONASSAYTHERESULTSSHOWEDTHELAMPMETHODISHI曲SPECIFICANDSENSITIVECOMPAREDWITHPCRITISMORETIMEEFFICIENTANDCONVENIENTBESIDES,THEMETHODDOESNOTREQUIRESPECIALEQUIPMENTWHICHMAKESITSUITABLEFOREXPANDEDUSE2METHODSFORDETECTIONOFVIRULENTHBRIOVULNIFICUSHACOASTALSEAWATERVIBRIOVUTN驢CUSISANOPPORTUNISTICPATHOGENWIDELYDISTRIBUTEDINESTUARINEANDCOASTALSEAWATERSANDPOSESTHREATENTOTHESAFETYOFCOASTALRESIDENTS,TOURISTSAND1II
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簡介:華北水利水電學(xué)院碩士學(xué)位論文河流污染物水節(jié)霉群落特性分子生物學(xué)研究姓名張樂申請學(xué)位級(jí)別碩士專業(yè)環(huán)境工程指導(dǎo)教師朱靈峰;王海燕201105華北水利水電學(xué)院碩士學(xué)位論文IIRIVERPOLLUTANTCOMMUNITYACTERISTICSOFLEPTOMITUSMOLECULARBIOLOGYABSTRACTINTHISPAPERCOMBINEDWITHTHEDEFMATIONGRADIENTGELELECTROPHESISDGGECLONELIBRARYOFMOLECULARBIOLOGYMETHODSTHELEPTOMITUSLACTEUSOFTHEMUDANJIANGRIVEROUTBREAKOFSEDIMENTLEPTOMITUSLACTEUSOFTHEWATERENVIRONMENTSYMBIOSISMOLDBACTERIAFUNGICOMMUNITYSTRUCTUREARECOMPAREDANALYZEDSUCHASMAPPINGBYUSINGMEGASOFTWARESHANNONWIENERINDEXETCCULTIVATIONSEDIMENTSAMPLESSAMPLESOFTHEMICROBIALSYMBIONTDIVERSITYASSESSMENTOBTAINEDTHEFOLLOWINGCONCLUSIONS1RECEIVED576SEQUENCESBACTERIALPOPULATIONSWEREOBTAINEDASACIDOBACTERIAPLANCTOMYCETESACTINOBACTERIABETAPROTEOBACTERIAALPHAPROTEOBACTERIADEINOCOCCUSTHERMUSFIRMICUTESGEMMATIMONADETESDELTAPROTEOBACTERIACYANOBACTERIACHLOBICHLOFLEXIFUNGALTAXAAREBASIDIOMYCOTAOMYCOTABLASTOCLADIOMYCOTACHYTRIDIOMYCOTACERCOZOAZYGOMYCETESOTHERGROUPSCHOANOFLAGELLIDARHODOPHYTA2CONSTRUCTIONOFTHE12OFCLONELIBRARYASPECTRUMOFDGGEANALYSISVISUALANGLEFROMAMOLDOUTBREAKINTHELEPTOMITUSLACTEUSOFTHEMICROBIALCOMMUNITYTOSHOWITWITHTHEDIVERSITYINDEXANALYSISDISCUSSIONSECTIONOFMOLDGROWTHREPRODUCTIONOFWATERENVIRONMENTALFACTSSYMBIOTICMICROBIALCOMMUNITYCHANGESKEYWDSLEPTOMITUSPCRDGGECLONELIBRARYMICROBIALDIVERSITY
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