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    • 簡介:中國科學技術大學博士學位論文組蛋白分子伴侶RTT106的結構和生物學功能研究姓名黃鴻達申請學位級別博士專業(yè)結構生物學指導教師施蘊渝吳季輝20100425ABSTRACTIIABSTRACTWEHAVERESOLVEDTHESTRUCTUREOFTHECEDOMAINOFRTT106RTT106MWHICHISASACOMYCESCEREVISIAEHISTONECHAPERONEWITHROLESINHETEROCHROMATINSILENCINGNUCLEOSOMEASSEMBLYRTT106MADOPTSANUNUSUAL“DOUBLEPLECKSTRINHOMOLOGY”DOMAINARCHITECTURETHATREPRESENTSANOVELSTRUCTURALMODEFHISTONECHAPERONESAΒSHEETΒHAIRPINSTRUCTUREINRTT106MWASFOUNDOUTTOBINDHISTONEH3H4APOSITIVELYGEDCONSERVEDREGIONWASIDENTIFIEDINONESURFACEOFRTT106MTHISREGIONWASTHENFOUNDTOBINDDOUBLESTREDDNADSDNAMUTAGENESISSTUDIESREVEALTHATTHEHISTONEDNABINDINGACTIVITIESOFRTT106AREINVOLVEDINSIRPROTEINMEDIATEDHETEROCHROMATINFMATIONTHEREAREANINTRODUCTIONOVERVIEWOFHISTONECHAPERONEINCHAPTER1THEEUKARYOTICGENOMEDNAISCOMPACTEDINTOCHROMATINWHICHHASCOMPLEXDIFFERENTLEVELSOFSTRUCTURETHESTRUCTUREOFOMATINISDYNAMICLYCHANGEDDURINGTRANIONREPLICATIONDNARAPAIREPIGEICINFMATIONINHERITANCEMANYCELLULARPROTEINSAREINVOLVEDINREMODELINGTHESTRUCTUREOFCHROMATININCLUDINGTHEATPDEPENDENTCHROMATINREMODELINGCOMPLEXHISTONECHAPERONETHEHISTONECHAPERONESPLAYIMPTANTROLESINDNAREPLICATIONDEPENDENTTRANIONDEPENDENTNUCLEOSOMEDISASSEMBLYASSEMBLYTHEHISTONECHAPERONESAREALSOINVOLVEDINCELLULARHISTONESSTAGETRANSFERWEFOCUSONSTRUCTUREFUNCTIONOFHISTONECHAPERONESCHAPTER2INTRODUCESTHECELLULARFUNCTIONOFRTT106OURSTUDIESONTHISIMPTANTHISTONECHAPERONERTT106MADOPTSA“DOUBLEPH”DOMAINARCHITECTUREPH1PH2RTT106PH2DOMAINCLOSELYRESEMBLESTHESTARDPHDOMAINWHILEPH1ISADERIVANTOFPHDOMAINWITHIONSEQUENCEINLOOPREGIONSTHETWOPHDOMAINSAREINTIMATELYASSOCIATEDWITHEACHOTHERTHROUGHHYHOBICTYPECONSERVEDRESIDUESTHEOVERALLSTRUCTUREOFRTT106MPOB3MISSIMILARWIEHANRMSDOF27APOSITIVELYGEDREGIONSTRETCHINGACROSSONESIDEOFTHETWOPHDOMAINSISFOUNDTOBINDDSDNATHEPH2DOMAINCOULDBINDH3H4THEΒHAIRPINFMEDBYS12S13STRSISCRITICALINTHISINTERACTIONTHERESIDUESINTHELOOPREGIONOFTHEΒHAIRPINAREHIGHLYCONSERVEDWHENMUTATEDTHEINTERACTIONBETWEENRTT106MH3H4ISABOLISHEDRTT106COULDBINDBOTHDSDNAH3H4INDEPENTLYTHETPEIMMUNOFLUESCENCECHIPEXPERIMENTSREVEALTHAT
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      上傳時間:2024-03-02
      頁數: 154
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    • 簡介:廈門大學碩士學位論文深海PAHS降解菌的多樣性分析及重要降解菌的分子生物學研究姓名崔志松申請學位級別碩士專業(yè)生物化學與分子生物學指導教師邵宗澤徐洵20060701摘要第三部分,大西洋沉積物中PAHS降解菌的研究以PAHS混合物萘、菲、芘為碳源富集得到了5個不同的PAHS降解菌群。采用DGGE16SRDNA的V3區(qū)序列、單菌篩選、平板菌落計數相結合的方法對這些菌群的結構進行了解析。通過單菌和菌群的DGGE條帶對應,確定可培養(yǎng)優(yōu)勢菌主要有跟PSEUDOALTEROMONASGANGHWENSIS、NOVOSPHINGOBIUMPENTAROMATIVORANS、MARINOBACTERKOREENSIS、MARINOBACTERVINULENTU、HALOMONASMEEL“DIANA,ALCANIVOROXVENUSTI、DLCNNIVOFAXDIESELOLEI、TISTRELLAMOBILIS、RHALASSOSPIRALUCENTENSIS近緣的菌種,其中PSEUDOATERO岍ONAS、NOVOSPHINGOBIUM、MARINOBACTER、HALOMONAS屬的細菌都有報道過的PAHS降解菌。ALCANIVORAX屬的細菌是報道過的非常重要的烷烴降解菌。而跟“ISTRELJAMOBILIS、THAJASSOSPIRAUCENTENSIS近緣的菌種則沒有PAHS降解的有關報道。同時對DGGE圖譜中沒有和已分離單菌對應的菌群條帶進行回收測序,確定的未培養(yǎng)優(yōu)勢菌主要有解環(huán)菌屬、食烷菌屬的多株細菌、跟THALASSOSPIRA/UCENTENSIS、A1TETOMONASLITOREA、MARINOBACTERSEDIMINUM、MNRINOBACTERIUMGEORG/ENSE、艙£緲LOPHAGNMURATA、銅綠假單胞菌、糞產堿桿菌、食芳香物新鞘氨醇桿菌近緣的細菌,以及一株屬于紅螺旋菌科的細菌。/DARINOBACTER,墟ARINOBNCTERIUM、解環(huán)菌屬、假單胞菌屬、產堿桿菌屬、新鞘氨醇桿菌屬中都曾報道過PAHS降解菌,其中解環(huán)菌是海洋環(huán)境中最重要的PAHS降解菌。關鍵詞多環(huán)芳烴;生物降解雙加氧酶基因
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      上傳時間:2024-03-01
      頁數: 73
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    • 簡介:石河子大學碩士學位論文黃瓜芽黃突變的分子細胞生物學特性初步研究姓名李娟娟申請學位級別碩士專業(yè)生物化學與分子生物學指導教師高劍峰20090601THEPRELIMINARYRESEARCHONTHEMOLECULARANDCELLBIOLOGYOFTHECUCUMBERMUTANTOFVIRESCENTPOSTGRADUATELIJUANJUANBIOCHEMISTRYANDMOLECULARBIOLOGYSUPERVISORPROGAOJIANFENGABSTRACTOBJECTIVE1BASEDONSIXNORMALVARIETIESOFCUCUMBERSANDONEMUTANTOFVIRESCENT,WECOUNTEDTHECELLCHROMOSOMENUMBERSANDSTUDIEDTHEKARYOTYPEANALYSISOFCUCUMBERWHICHPROVIDEDAREFERENCEONTHEGENELOCATIONRELATEDTHECUCUMBERMUTANTOFVIRESCENT2DISCUSSIONABOUTTHEDIFFERENTIALLYEXPRESSEDGENESBETWEENTHEMUTANTOFVIRESCENTANDWILDTYPELEAFTISSUEMETHOD1WEANALYZEDTHERESETSWHICHWEPREPAREDCHROMOSOMESUSINGCUCUMBERROOTSBYCONVENTIONALCOMPRESSIONMETHOD,ANDTHENMADETHEMICROSCOPICALEXAMINATIONSANDMICROGRAPHY2THESUBTRACTIVEHYBRIDIZATIONLIBRARYOFTHEVIRESCENTMUTANTCUCUMBERWASCONSTRUCTEDBYSSHIDENTIFICATIONTHECLONESOFSUPPRESSIONSUBTRACTIVEHYBRIDIZATIONLIBRARYBYRESTRICTIONENZYMEDIGESTIONANDSEQUENCEDTHECLONESWHOSEFRAGMENTSAREBETWEEN200~900BPBYRESTRICTIONENZYMEDIGESTIONNESEQUENCESWEREBLASTEDINTHEGENBANKNUCLEICACIDDATABASEWHICHWEREREMOVEDRESTRICTIONSITESRESULTANDCONCLUSION1INACCORDANCEWITHTHENORMALANDTHEMUTANTCUCUMBERKARYOTYPEANALYSIS,THERESULTSSHOWEDTHATTHENORMALANDTHECUCUMBERMUTANTOFYELLOWVIRESCENT’SCHROMOSOMESAREBOTH2N14THATBELONGTODIPLOIDPLANTANDTHEBASICNUMBEROFCHROMOSOMEIS7KARYOTYPESBELONGTO1AANDTHEYARESYMMETRICALKARYOTYPETHEVARIANCEANALYSISOFDIFFERENTOFCUCUMBERVARIETIESOFCHROMOSOMES’LENGTHMOWEDTHATPO05ITSHOWEDTHATTHEREWASNODIFFERENCEBETWEENNORMALANDTHECUCUMBERMUTANTOFYELLOWVIRESCENTATTHELEVELOFCHROMO∞MES2WEIDENTIFIEDATOTALOF240POSITIVECLONES,INCLUDING152FORWARDSUBTRACTIVELIBRARYPOSITIVECLONESAND88REVERSESUBTRACTIVELIBRARYCLONES206SEQUENCESHAVEBEENSEQUENCEDSUCCESSFULLYAFTERMASTEDANALYSISOF159SEQUENCESWHICHWERETRANSFORMEDTOTHEF’ASL’AFORMATANDSUBMITTEDTOTHEGENBANK,ATLASTWEGOTASERIALSOFNUMBERSFROMGH270133TOGH270291KEYWORDSCUCUMBERMUTANTOFYELLOWVIRESCENTSUPPRESSIONSUBTRACTIVEHYBRIDIZATIONSSH,DIFFERENTIALLYEXPRESSIONGENEN
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      上傳時間:2024-03-01
      頁數: 69
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    • 簡介:知夫李側卜七學巾幼敘文一1一紫杉醇前體生物合成的分子生物學和抗癌菇類叫噪生物堿的代謝工程指導教師遺傳學專業(yè)博士研究生唐克軒廖志華教授學號011023456復旦大學生命科學學院,遺傳工程國家重點實驗室,復旦一交大一諾丁漢植物生物技術研發(fā)中上海市邯鄲路220號,中國,200433遺傳學研究所心摘要紫杉醇的生物合成來源于經典的MVA途徑和新近發(fā)現的DXP途徑。為研究紫杉醇前體生物合成途徑的分子生物學,本文首先建立了從成熟的曼地亞紅豆杉等裸子植物的各種成熟組織中提取高質量RNA的方法在此基礎上,采用RACE方法從曼地亞紅豆杉中首次克隆了MVA途徑上三個重要基因的全長CDNA,包括TMHMGR曼地亞紅豆杉3經基一3一甲基戊二酞COA合成酶基因,TMFPS曼地亞紅豆杉法呢基焦磷酸合成酶基因,TMIPI曼地亞紅豆杉異戊烯焦磷酸異構酶基因同時克隆了DXP途徑上的兩個限速酶TMDXS曼地亞紅豆杉5磷酸脫氧木酮糖合成酶基因和TMDXR曼地亞紅豆杉5磷酸脫氧木酮糖還原異構酶基因的全長CDNA克隆了為紫杉醇提供二裕骨架20碳原子的TMGGPPS曼地亞紅豆杉香葉基香葉基焦磷酸合成酶基因的基因組序列,并獲得全長CDNA由于這些基因都是首次從裸子植物中獲得,故對這些基因及其編碼的酶進行了詳盡的生物信息學分析采用遺傳功能互補的方法驗證了TMHMGRTMFPSTMGGPPS基因的功能,結果顯示,TMHMGR能夠彌補酵母IRY2394缺失的HMGR功能,TMFPS能夠彌補酵母CC25缺失的FPS功能,TMGGPPS能夠彌補酵母SFNY368缺失的GGPPS功能,證明它們編碼相應的功能蛋白在大腸桿菌中過量表達TMIPI推動DXP途徑代謝流向下游流動,促進P一胡蘿卜素的生物合成而驗證了TMIPI的功能SOUTHEM雜交結果表明,TMHMGRTMFPSTMIPITMDXS在曼地亞紅豆杉中都是其相應基因家族的成員NORTHERN雜交結果表明,TMHMGR在曼地亞紅豆杉根、莖和葉中都有表達,但表達量有差異,TMHMGR在地上部分的表達高于地下部分,這與紫杉醇的藥用部位相一致TMFP‘在根、莖、葉中都有表達,在根和樹千中的表達量沒有明顯差異,在針葉中的表達量高于根和樹千。首次發(fā)現IMGGPPS是一個沒有內含子的基因,有本底表達水平,在用甲基茉莉酸處理曼地亞紅豆杉細權S尖I栩阮七口沈彭淪歲仁WAM戴偉長犯翻洲身月T執(zhí)茜習腳陽拉摘習荊跳四I嘴犯書潤自均代月擴口醫(yī)花TIM代謝組的影響提供了重要的材料,同時為利用轉基因毛狀根開展長春花抗癌FE類ALL噪生物堿代謝工程莫定了堅實的基礎。關鍵詞曼地亞紅豆杉、紫杉醉、生物合成途徑、分子克隆、生物信息學、3輕基一3甲基戊二酞COA還原酶基因、法尼基焦磷酸合成酶基因、異戊烯焦磷酸異構酶基因、5磷酸脫氧木酮糖合成酶基因、5一脫氧木酮糖還原異構酶基因、香葉基香葉基焦磷酸合成酶基因、RACE、基因組步移、遺傳互補、功能驗證、抗癌菇類叫噪生物堿、色氨酸脫狡酶、異胡豆昔合成酶、10香葉醇脫氫酶、ORCA3、喜樹、輕基喜樹堿、喜樹堿、長春花、毛狀根、遺傳轉化、代謝工程、轉基因GENBANKACCESSIONNUMBERSAY277740TMHMGR全長MRNA己釋放AY461811TO功BS全長MRNAAY505129TMD“全長MRNAAY588482TMDRR全長MRNAAY566309TMGGPPS基因組序列已釋放AY453404TMGGPP‘全長MRNA已釋放縮略詞表AACTACETYCOAACETYCOACACETYLTRANSFERASE,乙酞COA乙酞COA一酞基轉運酶CDPME4CYTIDINE5DIPHOSPHO2CMETHYLDERYTHRITOL45’一焦磷酸胞昔2C一甲基一D一赤醉醇CDPMEP4CYTIDINE5DIPHOSPHO2CMETHYLDERYTHRITOL2PHOSPHATE45一焦磷酸胞昔卜2C一甲基一D一赤醉醇一磷酸CMK4CYTIDINE5DIPHOSPHO2CMETHYLDCRYTHRITOLKINASE45’一焦磷酸胞昔2C一甲基D赤醉醇激酶DMAPPDIMETHYLALLYLDIPHOSPHATE,二甲基烯丙基焦磷酸DXP1DEOXYDXYLULOSE5PHOSPHATE1一脫氧一木酮糖一5磷酸DXPS1DEOXYDXYLULOSE5PHOSPHATESYNTHASE1脫氧一木酮糖5磷酸合成酶
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      上傳時間:2024-03-01
      頁數: 169
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    • 簡介:復旦大學博士學位論文國產石杉科藥用植物的分子生物學研究姓名姬生國申請學位級別博士專業(yè)生藥學指導教師潘勝利20070401摘要摘要石杉科HUPERZIACCAE植物是一類多年生小型草本植物,土生、附生或生于苔蘚叢中,直立或下垂生長,喜陰涼潮濕環(huán)境。近年來隨著對石杉科植物的開發(fā)和利用,使得石杉科植物資源逐漸減少。因此,對石杉科植物資源有效的合理保護與科學的開發(fā)利用工作己迫在眉睫。本課題針對這一狀況,為了解決石杉科藥用植物的資源匱乏問題,保證石杉科藥用植物資源的可持續(xù)開發(fā)和利用,進行設計和研究。本論文首先對我國的石杉科植物的生態(tài)狀況、資源情況、分類情況以及石杉堿甲在石杉科植物中的分布、研究狀況、藥理作用等作了詳細的分析和描述,并著重進行如下研究。1對石杉科植物的分子生物學研究利用基因組學對石杉科藥用植物進行研究。通過對不同種石杉科植物的總DNA的提取,選擇葉綠體基因而CL,RPLL6,MATK及PSBATRNH間區(qū)進行PCR擴增并測序,通過序列比對并構建系統進化樹進行分析,結果闡明了石杉科植物系統位置和分類關系。系統進化樹中石杉科與石蔥屬PHYLLOGLOSUM位于系統樹的姊妹枝,共同組成的進化枝與石松科LYCOPODIACEAE植物平行排列,這一結果與形態(tài)學上的分類方法是一致的,支持了將石杉科獨立于石松科植物的分類觀點。對石杉科的屬下分類,系統進化拓撲樹表明,該科植物中明顯的包含了兩個進化枝,即石杉屬植物進化枝和馬尾杉屬植物進化枝,這一結果提示了石杉科植物中兩個屬的劃分的正確性,確立了石杉科植物的系統分類關系,即石杉屬HUPERZIA與馬尾杉屬PHLEGMARIURUS的分類方法。這一方法與形態(tài)學的分類方法相輔相成,這一結果是對于捷克植物學家HOLUB對該屬分類的不確定性的有力的答復。并對屬下的分類做了進一步的研究,系統樹上石杉屬中石杉組和小杉蘭組的植物明顯地被分為兩個聚群,這一結果同張麗兵、孔憲需的分類學觀點相一致。由于馬尾杉屬的供試材料不足,其屬內系統演化結果尚不明朗,有待于進一步的研究。本研究還確立了長柄石杉應為蛇足石杉的一個變種,這一觀點得到了系統樹的支持。伏貼石杉雖然與小杉蘭在形態(tài)學上很難區(qū)分,在系統樹上該兩種植物分別聚于不同的演化枝,并有很高的BOOTSTRAP支持率,這一結果可以明顯的把小杉蘭和伏貼石杉區(qū)分開,伏貼石杉應該為一個獨立的種。
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      上傳時間:2024-03-01
      頁數: 138
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    • 簡介:浙江大學博士學位論文硫磺礦硫化葉菌(SULFOLOBUSSULFATARICUSP2)小熱激蛋白(HSP20)分子生物學特征和功能姓名李東哲申請學位級別博士專業(yè)生物化學及分子生物學指導教師楊衛(wèi)軍20110610浙江大學學位論文似的功能。所有體外和體內的分析顯示,SSOHSP20能幫助硫磺礦硫化葉菌抵抗不適環(huán)境的變化。研究硫磺礦硫化葉菌的小熱激蛋白SHSP有助于認識古菌的基本蛋白質折疊過程及其熱適應性基礎,為生命的起源和進化提供更多的信息。關鍵詞古菌;硫磺礦硫化葉菌;SHSP20;分子伴侶VI
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      上傳時間:2024-03-01
      頁數: 102
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    • 簡介:內蒙古師范大學碩士學位論文內蒙古園蛛屬蜘蛛的分子生物學研究(蜘蛛目園蛛科)姓名盧曉亮申請學位級別碩士專業(yè)動物學指導教師唐貴明20100501內蒙古師范大學碩士學位論文ABSTRACTITWASTHEFIRSTTIMEREPORTEDTHATANALYZEDASEQUENCEDATASETOFAPORTIONOFMITOCHONDRIAL12SRRNAGENESEQUENCESOFTHESPIDERSOFPARDOSA9SPECIESININNERMONGOLIA,ANDUSEDCYCIOSACONICAWHICHWASDOWNLOADFROMTHENETWORKANDPARDOSAASTRIGERAWHICHWASDETERMINEDBYOTHERSASOUTSIDEGROUPSBASEDONTHEOBTAINEDDATA,ACONSENSUSPHYLOGENETICTREEOFTHEARANEUSWASCONSTRUCTEDUSINGNJANDMPANDMEMETHODSOFPHYLIPSOFTWAREANDUPGEMAMETHODOFMEGASOFTWARETHEEXPERIMENTALRESULTSASFOLLOWS1PCRAMPLIFICATIONANDDNASEQUENCINGWEREUSEDBYPRIMERS12STL一145035GGTGGCATTTTATTTTATTAGAGC一3’AND12SBIH一142145AAGAGCGACGGGCGGGCGATGTGT3’WECANGETTHEBANDABOUT300BPAFTERTHEELECTROPHORESIS’2AFTERSEQUENCINGFORALLINDIVIDUALS,THELENGTHOFAPORTIONOF12SRRNAGENEWHOSEAVERAGELENGTHIS275BP,ITSAVERAGEBASEISMDAEUPA379%、T372%IC126%、G123%,THEANALYZEDSEQUENCESOF9SPECIESHADANAVERAGEA/THIGHERTHANG/C3AFTERMULTIPLESEQUENCEALIGNING,OFTHESE227VARIABLEAND48WEREALSOPHYLOGENTICALLYINFORMATIVEINPARSIMONYANALYSIS,MUTATIONRATEWAS175%,ITWASPROVEDTHAT12SRRNAGENESEQUENCEISACONSERVATIVESEQUENCE,ANDITWASSUITABLEFORTHESTUDYOFSYSTEMATICDEVELOPMENTINTHESPECIES4THEHIGHESTAMOUNTOFTVANDTSAMONGDIFFERENTSEQUENCESIS47ANDTHELOWEST5THEOCCURINGOFTSISMAINLYCENTEREDONTA,ATANDTVISMAINLYCENTEREDONCTTC5DIFFERENTMETHODSOFPHYLOGENETICTREECONSTRUCTEDBASICALLYTHESAME,9KINDSDIVIDEDINTOTHREETHEGRANITEGRANITEGARDENSPIDERGARDENSPIDERANDTHETYPEANDDISTRIBUTIONOFAFATGARDENSPIDERNORTHERNGARDENSPIDERGARDENSPIDERISONEWITHTHECROSS,CRACKSUDDENGARDENSPIDERGARDENSPIDERTATARMISCELLANEOUSSPOTSGARDENSPIDERBIGBELLIEDASAFOURKINDSOFGARDEN
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      上傳時間:2024-03-01
      頁數: 54
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    • 簡介:華中科技大學博士學位論文SK66抗菌肽的分子設計、優(yōu)化表達和生物學功能研究姓名馮志國申請學位級別博士專業(yè)生物化學與分子生物學指導教師陳正望20081030華中科技大學博士學位論文華中科技大學博士學位論文II菌強,對抗菌藥物的開發(fā)有重要意義。4SK66-HIS能殺滅子宮頸癌細胞HELA。經SK66-HIS處理后,子宮頸癌細胞HELA的貼壁性很快被破壞,大量細胞懸浮并死亡。通過MTT實驗,我們發(fā)現SK66-HIS能夠顯著抑制子宮頸癌細胞HELA的增殖。采用膜片鉗技術,發(fā)現SK66-HIS能在DRG細胞上形成陽離子通道。說明SK66-HIS對癌細胞和細菌的殺滅機制可能相同細胞膜出現大量穿孔、原生質泄漏,細胞破裂死亡。5為了研究SK66的抗菌機制,我們融合表達并純化了一個融合蛋白TRXSK66,用腸激酶(ENTEROKINASE)裂解該融合蛋白將裂解后的溶液多肽進一步用反相高效液相色譜(RPHPLC)分離、收集各洗脫峰、凍干成功制備了AMASK66,該蛋白在SK66的氮端加了三個非極性氨基酸2個丙氨酸和一個甲硫氨酸。通過對SK66-HIS、AMASK66和TRX-SK66三個蛋白殺滅細菌和癌細胞活性的比較,TRX-SK66沒有殺滅細菌和癌細胞活性,AMASK66殺滅細菌和癌細胞活性大大降低,表明氮端氨基酸對SK66殺滅細菌和癌細胞活性很重要,尤其氮端氨基酸的極性??傊覀儼l(fā)現了一個新的衍生于果蠅的富甘氨酸具有生物活性的多肽,該多肽有抗菌和抗癌多種功能,能夠很方便的大規(guī)模生產,具有潛在的商業(yè)價值。關鍵詞關鍵詞抗菌肽,序列分析,原核表達,離子交換層析,殺菌活性,抗癌活性,膜片鉗,
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      上傳時間:2024-03-01
      頁數: 93
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    • 簡介:蘇州大學碩士學位論文鼠抗人CD40突變體分子的單克隆抗體的研制及其生物學功能研究姓名鄭舒丹申請學位級別碩士專業(yè)免疫學指導教師張學光20090501鼠抗人CD40突變體分子的單克隆抗體的研制及其生物學功能研究中文摘要基因轉染細胞L929/CD40WT為陰性篩選細胞,通過間接免疫熒光標記法對雜交瘤細胞株進行篩選,經多次克隆化培養(yǎng),最終獲得3株持續(xù)、穩(wěn)定分泌鼠抗人CD40MU單克隆抗體的雜交瘤細胞株,命名為3E4、684和10C5,其重鏈分別為IGG2B、IGGL、IGG3,輕鏈為1C鏈。三株抗體均可用于免疫組織化學分析,3E4和10C5可用于WESTERNBLOT檢測。雜交瘤細胞株經體外連續(xù)傳代40代培養(yǎng),液氮凍存半年后復蘇,仍生長良好,穩(wěn)定分泌抗體。2鼠抗人CD40MU單克隆抗體的體外生物學特性研究運用制備的單抗檢測發(fā)現,部分惡性B細胞株及上皮性腫瘤細胞株表達CD40MU,其在新鮮腫瘤組織中也有高水平的表達。三株單抗與野生型CD40單抗5C11識別的抗原位點不同,對細胞株的識別譜也不相同。不同于已報道的抗人CD40單克隆抗體,三株單抗能識別多種腫瘤細胞株H08910,H460等以及腫瘤’新鮮組織表達的CD40分子,其中10C5不識別血管內皮細胞株EAHY926以及一些正常組織表達的CD40分子。繼而采用抗CD40MU單抗對表達CD40MU的人卵巢癌細胞株H08910的體外實驗初步表明,單抗3E4能夠促進H08910細胞的體外生長,單抗10C5能夠抑制H08910細胞的體外生長,并且促使其凋亡。綜上所述,本研究成功制備了3株特異性鼠抗人CD40MU單克隆抗體,初步探討了CD40MU在腫瘤中的表達及其生物學意義,證實了腫瘤細胞表達突變的CD40分子;單抗激發(fā)表達相應突變的腫瘤細胞后引起了生物學效應促進/抑制腫瘤細胞的體外生長,并且誘導其凋亡。三株特異性抗體的獲得為深入探討腫瘤細胞表達CD40MU分子的生物學意義提供了物質基礎,也為腫瘤的靶向生物治療提供了新思路。關鍵詞CD40,突變體,雜交瘤,單克隆抗體,腫瘤細胞Ⅱ碩士研究生鄭舒丹指導教師張學光教授
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      上傳時間:2024-03-01
      頁數: 62
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    • 簡介:湖南師范大學博士學位論文多倍體魚轉座子的遺傳變異和雌核發(fā)育魚性腺發(fā)育的分子生物學研究姓名劉東申請學位級別博士專業(yè)發(fā)育生物學指導教師劉少軍20090501雜交后代四倍體鯽魴基因組中完全切離,而在雜交后代三倍體鯽魴基因組中,TRAM序列僅發(fā)生堿基轉換和插入突變,表明在遠源雜交過程中,轉座子具有2種分子遺傳變異方式1垂直失活,轉座子以點突變的方式積累突變;2隨機丟失,轉座子以切除方式脫離于雜交后代基因組。3、通過PCR方法,在4NRB基因組中檢測到一種新的轉座子,命名為TTEL屬于TCL家族的第1群。斑點雜交檢測,在大小為176PG的四倍體鯽魴基因組中,該轉座子具有880個拷貝數。本研究首次報道了脊椎動物遠源雜交導致了轉座子迸發(fā)。4、利用RACE技術,獲得了三倍體鯽魴、四倍體鯽魴、紅鯽和團頭魴的高遷移率族蛋白1基因MRNA全長序列,其開放閱讀框包含579NT,翻譯成193個氨基酸。序列比較分析表明核苷酸水平上,四倍體鯽魴與母本紅鯽的同源性99%高于同父本團頭魴的同源性97%,三倍體鯽魴與父母本同源性95%低于親本之間的同源性98OA;氨基酸水平上,四倍體鯽魴與父母本的同源性100%高于三倍體鯽魴與雙親的同源性97%。結果表明遠源物種間的雜交對兩性不育的三倍體鯽魴HMGL基因造成了一定的沖擊,分子遺傳效應表現為三倍體鯽魴HMGL基因位點發(fā)生了變異;四倍體鯽魴HMGL氨基酸序列與雙本的完全一致性,克服了等位基因的雜交不親和性,為兩性可育的異源四倍體鯽魴遺傳穩(wěn)定奠定了基礎。5、采用抑制性消減雜交技術,G。卵巢生長期CDNA為驅動方,異源四倍體鯽鯉雌核發(fā)育第3代第4代G卵巢增殖期CDNA為檢測方,構建了一個正向消減CDNA文庫。通過斑點雜交篩選文庫,獲得了73個特異于G。表達的克隆,對其中部分克隆進行了測序。BLASTX搜索結果表明,一些克隆EDNA推測的編碼蛋白與NCBI數據庫內已知序列具有明顯的同源性。這些蛋白包括信號識別顆粒9蛋白,
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    • 簡介:分類號學校代碼10542密級學號墊0921411018不同倍性鯽鯉相關分子生物學特征研究STUDYONRELATEDMOLECULARBIOLOGYOFDIFFERENTPLOIDYCYPRINIDS研究生姓名指導教師姓名、職稱學科專業(yè)研究方向湖南師范大學學位評定委員會辦公室二零一二年六月摘要通過紅鯽旱CARASSIUSAURATUSREDVFLR.和鯉魚杏CYPRINUSCARPIOL.屬問遠緣雜交,在其后代成功培育出了異源四倍體鯽鯉群體,目前已繁殖了19代F。一F2,。該群體兩性可育,遺傳性狀穩(wěn)定,為探討魚類多倍體的形成提供了重要研究模型,為多倍體進化的相關遺傳和表觀遺傳研究提供了良好的實驗材料。以雄性異源四倍體鯽鯉與雌性二倍體日本白鯽CARASSIUSCUVIERI的倍性雜交形成了不育的三倍體湘云鯽。該三倍體、四倍體魚的形成為開展不同倍性魚的生物學比較研究提供了重要的生物學平臺。不改變DNA序列而能影響生物體基因表達與表現型的表觀遺傳效應,對雜交多倍體生物的形成與進化適應具有重要的調控作用。DNA甲基化是表觀遺傳調控的最主要方式,進行異源四倍體鯽鯉及其親本,紅鯽和鯉魚的DNA甲基化研究,探討異源四倍體魚與親本相比所發(fā)生的DNA甲基化模式的變化,甲基化水平增加或降低的程度,甲基化對相關序列的修飾等內容,有助于了解雜交四倍體魚形成所經歷的表觀遺傳效應。另外,在已有的有關不同倍性魚育性研究的基礎上,本文開展了促性腺激素FSH和LH的兩類旁分泌調節(jié)物質,活化素ACTIVIN及卵泡抑素FOLLISTATIN基因的分子克隆及序列分析,為進一步從遺傳學角度探討三倍體湘云鯽不育和四倍體鯽鯉可育的機制奠定了基礎。本論文的研究結果如下1.利用甲基化敏感擴增多態(tài)性MSAP方法分析了紅鯽、鯉魚和異源四倍體鯽鯉的DNA胞嘧啶甲基化模式。根據條帶的位置和有無情況,顯示在變性聚丙烯酰胺凝膠上的甲基化條帶呈4種不同模式非甲基化CCGG模式;內胞嘧啶全甲基化CMCGG模式;外胞嘧啶半甲基化MCCGG模式;還有一種模式在MSPI和HPAII的泳道中都沒有條帶,該位點上可能所有胞嘧啶都被甲基化,
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    • 簡介:中國海洋大學博士學位論文鰈形目分類檢索及分子生物學應用模式研究姓名楊俊杰申請學位級別博士專業(yè)海洋生物學指導教師張全啟20090601引體系和數據庫模式,為分類檢索系統的開發(fā)奠定了數據基礎。2設計了可兼容不同GTI數據庫分類目錄的數字化分類階元系統。基于樹型數據窗口TREEVIEWDATAWINDOW,建立了可擴展上下級階元、可任意組合不同階元的數字化分類階元系統模塊,為動態(tài)應用階元組合動態(tài)整合數據、開展信息比較分析、構建專項數據庫等數據操作等奠定了索引目錄結構基礎。3、提出了定距式二歧檢索表BIOSKEY算法。建立了以數據過濾模式調取檢索表的特征性狀并進行組合查詢的方法,討論了傳統二歧檢索表的樹數據結構的同組層無序化特征,及其將之與二叉樹結構進行辨分的必要性,為紙質分類檢索表的數字化提供了新的工具。同時,基于各種系統的樹結構相似性、階層體系相似性和物種階元單位的高度一致性,探索了將BIOSKEY算法應用于建立支序回溯系統,用以集成各類系統信息的可行性。4從序列信息檢索直觀化角度出發(fā),基于MTDNA和NDNA基因組結構和數據窗口DATAWINDOWDW,建立了直觀的分子標記熱鍵檢索模式;設計了通過鼠標控制函數檢索DNA條碼、分子標記等序列信息,并與分類系統目錄進行階元關聯的方法。5研究了大尺寸數據庫的快速處理技術,同時建立了不同DOS模式的BLAST、CLUSTAL、PHYLIP軟件包的WINDOWS平臺運行的優(yōu)化環(huán)境。為加速數據檢索、提取和數據庫重建,設計了將數據存儲DATASTORE嵌入內存數據塊進行索引化操作的快速算法,為WINDOWS系統中大文件訪問與處理中的I/O與內存限制的瓶頸技術問題。6研究了以平臺模塊方式處理不同分類學信息的系統設計與構建方法。按分別設計、系統集成模式,開發(fā)了9個數據模塊、9個分類學功能模塊和3個數據處理輔助模塊。各種標準化數據用于有序化伺服系統初始化、數據庫和檢索索引,或通過程序內建函數轉化為分類學專業(yè)格式如林奈分類目錄、分類檢索表、分子序列表和系統發(fā)育樹等,或為系統的可見與不可見控件如選擇列表、數據存儲索引等提供初始化參數。7針對GTL分類學信息門戶,基于微軟WEB瀏覽控件建立了物種WEB信息瀏覽與編輯工具,方便于使用者自定制WEB信息的采集與管理,并基于復合索引實現了WEB信息與系統階元目錄的有效關聯。關鍵詞鰈形目;分類學信息;數據庫;分類檢索表;DNA條碼;系統發(fā)育樹II
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    • 簡介:中山大學碩士學位論文大蕉MPRCI基因鹽脅迫應答機制的分子生物學研究姓名張碧佩申請學位級別碩士專業(yè)遺傳學指導教師王金發(fā)20100601與其對NA/K的協調相關。4為了探究MPRCI基因對植株體內NA/K水平的影響,我們用ICPAES原子發(fā)散測定脅迫下擬南芥體內鈉鉀含量,發(fā)現植株地上莖葉部分的高NA和高K積累直接導致了表型上的敏感。在高NA環(huán)境中,轉基因植株的地上莖葉部分NA含量相比野生型和RCI2A突變體最低,而在高K環(huán)境中,該植株地上莖葉部分則顯著積累L,提示MPRU基因可能參與植株地上部分的NA■K調控過程。5為了研究MPRCI蛋白對質膜的物理性質的影響,我們分離了擬南芥葉細胞的原生質體測定質膜流動性,檢測到無論在高NA還是高K處理后,葉細胞的質膜流動性會比正常條件的下降,但轉基因植株的質膜流動性下降程度相對最小,提示MPRCI基因所編碼蛋白可以在高NA或高K環(huán)境中穩(wěn)定膜的流動性以維持膜的功能。6根據我們的研究結果并結合已有的文獻報道,我們提出了一個可能的模型為了闡釋MPRCI及其同源蛋白ATRCL2A的調控NA/K吸收和排放的作用機制。關鍵字MPRCIRCL2,擬南芥ARABIDOPSISTHALIANA,鹽脅迫應答,細胞質膜N
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    • 簡介:II復Ⅱ太博畢業(yè)論女指導老師管坤良教授熊躍教授雷群英教授趙世民教授限黼峰燃隧愀澄陲T。摘要3ABSTRACT4第一章引言目錄IIM_十∞H∞P硼路5I2哺乳動物的HIPPOJ自路8L3轉錄共澈≠TAZ13第二章TEAL轉錄因子家族成員介導了轉錄共激活子TAZ促進細胞增殖、細胞遷移以及誘導上皮細胞向間充質細胞轉化的功能2ITEAL家族成員是與轉錄菇擻活子TAZ栩E結合的主要轉錄因子2822TEAD家族&璺介0T錄菸№TAZ誘0∞G目轉I表達2923TEALI女錄日子與轉I共№FTAZ的結NFTAZ刺馓細M增殖£的孫24TEAD家族轉錄因子與轉錄共激活于TAZ∞結對TAZ誘上蝴№向目≈質細胞的轉化是需3625TEAL家族轉錄目子與轉錄井№镕1址白勺結合NFTAZ促進目№Ⅱ£M的3826討論及參考文獻39第三章ASPP2協同蛋白磷酸酶IPPL調控轉錄共激活子TAZ的去磷酸化3L自磷&IPROTEINPHOSPHATICLPPI是月拉轉錄菇№活予TAZ∞女磷&M日勰32ASPP2促進轉錄共融曬子TAZ與蛋自酸酶PPLA的結合ITAZ的磷№他M平5133ASPP2和蛋自磷酸酶PPIA可U促M擻镕FTAZ曲核定位5434ASPP2和蚩自磷酸酶PPIA日以Ⅷ控轉IJ々激镕FTAZ的F游耙基目的基目達5635蛋自碡&酶PROTEINPHOSPL㈣L,PPLT是調控轉共擻活YAP的碡酸酶5836H№與參考女58第四章激酶CⅪ£協同激酶LATS調控依賴于SCFL3啊P的E3泛素連接酶的轉錄共激活子TAZ的泛素化蛋白質降解4I轉錄澉活于TAZ的蛋自質降解F&鞍F26S蛋自酶體6342轉錄撒活子TAZ與SCF小’的町泛索毒矮酶目分目互作月6443I№干TAZ的SET31I&ANQT;/№自LATS磷&化S。R31I的磷酸化對FTAZ與BTRCP∞臺是需的黼44№C∞啪KJM∞1£觸目LAFS∞怍F碡睛化轉I菇№十1他目FAZSOTRCP∞結合6945M自CASEINKIMSEL&M酶LATS∞M”F月拉轉R,激镕FTAZ自M7246A№FLM的女索化%GM目LAGS、№目CASEINKI目SC一附的E3泛4接酶7447C%M≈F轉I“№F1他∞生日&中的月控作用7648自∞№酶TIPROEINPH僻PHAI戰(zhàn)1,PPIM月轉I馓%FTAZ與口TRFP∞結“日促進TAZ雖
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    • 簡介:學位論文獨創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明所提交的學位論文是本人在導師指導下進行的研究工作和取得的研究成果。本論文中除引文外,所有實驗、數據和有關材料均是真實的。本論文中除引文和致謝的內容外,不包含其他人或其它機構已經發(fā)表或撰寫過的研究成果。其他同志對本研究所做的貢獻均已在論文中作了聲明并表示了謝意。學位論文作者簽名輯斌日期訓。肜學位論文使用授權聲明研究生在校攻讀學位期間論文工作的知識產權單位屬南京師范大學。學校有權保存本學位論文的電子和紙質文檔,可以借閱或上網公布本學位論文的部分或全部內容,可以采用影印、復印等手段保存、匯編本學位論文。學??梢韵驀矣嘘P機關或機構送交論文的電子和紙質文檔,允許論文被查閱和借閱。保密論文在解密后遵守此規(guī)定保密論文注釋本學位論文屬于保密論文,保密期限為年。靴論文作者簽名夠獻日期沙/,.F.,礦指導教師簽名芴糯日期必糾.S.訕C蘆’L’√。摘要摘要洲ILLIIL1LLLLILLIILLY192204220072010年,中國黃海海域連續(xù)4年發(fā)生大規(guī)模綠潮,綠潮的優(yōu)勢種是滸苔ULVAPROLIFERA。衛(wèi)星數據分析表明這次綠潮是在黃海南部海域江蘇外海形成,并在季風和海洋環(huán)流的作用下漂移到青島,部分研究認為江蘇近海的紫菜栽培區(qū)和海水養(yǎng)殖池塘等區(qū)域是黃海綠潮滸苔的可能來源地。弄清江蘇海域綠潮生物的具體物種、分布范圍、發(fā)生特點,對研究黃海綠潮的發(fā)生機制顯得尤為重要。2009年4月,江蘇省啟動了“江蘇海域綠潮生物調查”的項目。作者隨項目組在2009年4月至2010年3月間,對江蘇近海海區(qū)、海島、岸基、河口、沿海養(yǎng)殖池塘和紫菜栽培區(qū)的6個居群、27個站位,約5萬KM2的區(qū)域32.34AN、119.1220E進行了定期調查,系統分析了調查區(qū)域內綠潮物種、分布、發(fā)生及其與環(huán)境因子間的關系。本研究以形態(tài)學鑒定為主,結合分子系統學研究的手段獲得的結果表明,調查區(qū)域內生存的綠潮藻物種至少有10種,ULVAPROLIFERA和ULINZA是優(yōu)勢物種,UINTESTINALIS和UCOMPRESSA是常見物種;主要物種形態(tài)多變,UPROLIFERA隨棲息環(huán)境、生長季節(jié)表現出復雜的形態(tài)變化特點;根據我國以往的海藻區(qū)系研究,UPROLIFERA屬于長江以南沿海分布的物種,ULINZA分布生長在山東半島至遼寧的黃、渤海區(qū)域。海洲灣以南至長江口的黃海南部海域,幾乎沒有綠藻的分類學研究報道。黃海綠潮的出現引起了各方對該區(qū)域的關注,目前對本地滸苔群體分類研究中,有學者根據分子系統學研究結果提出了ULVALINZAPROCERAPROLIFERALPP進化枝。本論文的形態(tài)學鑒定也總結出4種具有交叉特征的滸苔物種,結合前人對滸苔雜交測試的研究,經過系統的比較認為部分ULVA近緣種可以互交甚至出現某些變種,該區(qū)域滸苔物種的形態(tài)多樣性與生物學變遷機制相關。根據逐月對養(yǎng)殖池塘和紫菜栽培區(qū)的生物量、溫度、繁殖體等調查發(fā)現這兩個調查區(qū)內滸苔居群生物量相對較大,其發(fā)生規(guī)律與定生居群相似,但受人為因素影響較大,與海區(qū)綠藻發(fā)生規(guī)律不同,調查證據顯示其斷枝與引發(fā)黃海綠潮無直接關聯;綜合2009年對海區(qū)水溫、海水透光度、海區(qū)綠潮藻發(fā)生規(guī)模、繁殖體分布數量等指標的調查發(fā)現,U.PROLIFERA是黃海綠潮的主要物種,僅發(fā)生在透明度2M渾濁海區(qū)離岸數十公里外側,其發(fā)展規(guī)律與水溫密切相關,在13℃時開始出現絲狀的幼藻發(fā)生體,約17℃聚集發(fā)展,25℃以上衰退消失,顯示為獨立種群的發(fā)生特點。關鍵詞黃海南部海域,綠潮,形態(tài)多樣性,分子系統學,調查}I
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