P311蛋白與金屬硫蛋白ⅡA相互作用位點的計算機預測.pdf

1、P311蛋白廣泛表達于多種組織，它參與體內細胞分化、調節(jié)其它蛋白/基因轉錄、創(chuàng)傷修復、腫瘤發(fā)生等多種正?；虍惓５纳飳W活動。金屬硫蛋白是一類廣泛存在于生物界的低分子量富含半胱氨酸的金屬結合蛋白，因其獨特的生物學功能，近年來國內外對金屬硫蛋白各方面的研究日益受到重視。經實驗研究發(fā)現(xiàn)，金屬硫蛋白亞型ⅡA(MT2A)參與P311基因表達，并起著關鍵性的調節(jié)作用，說明它們之間存在著相互作用的關系。
　　 由于P311蛋白的結構信息缺失，

2、因此，本文首先采用同源建模的方法構建P311蛋白的三維結構，并使用ProTable分析和Ramachandran圖驗證了其合理性。
　　 其次，將配體金屬硫蛋白ⅡA與P311蛋白的模建結構用Autodock4.0軟件進行分子對接，分析二者之間的相互作用。在生成的10個對接結果中，篩選出最合理的結構模型。
　　 最后通過對最終復合物的結構分析，預測出了兩者的作用區(qū)域，并發(fā)現(xiàn)受體蛋白中殘基GLU14、SER48以及GLU56