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文檔簡介
1、microRNA(miRNA)是一類近些年發(fā)現(xiàn)的在轉(zhuǎn)錄后水平上對基因表達(dá)水平起到負(fù)調(diào)控作用的小的、進(jìn)化保守的RNA分子。越來越多的研究顯示miRNAs在癌癥和其他惡性疾病的產(chǎn)生和發(fā)展的過程中起重要的調(diào)控作用。雖然目前發(fā)現(xiàn)了700多個(gè)人類miRNA并積累了大量相關(guān)數(shù)據(jù),但是受到實(shí)驗(yàn)技術(shù)的限制其中只有很少的一部分得到了深入研究確定了其與疾病的關(guān)聯(lián)。因此,發(fā)展生物信息學(xué)的方法建立計(jì)算模型預(yù)測miRNA和疾病的關(guān)聯(lián)對于揭示miRNA與疾病的關(guān)系
2、,為疾病診斷和藥物開發(fā)提供依據(jù)都具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。而基于生物網(wǎng)絡(luò)研究生命現(xiàn)象,有助于系統(tǒng)地闡明生物體內(nèi)各種復(fù)雜事件發(fā)生的內(nèi)在機(jī)理,尤其是揭示人類疾病的發(fā)病機(jī)理。但是目前基于miRNA網(wǎng)絡(luò)研究疾病—miRNA關(guān)聯(lián)還處于空白狀態(tài)。
本文提出了基于表型—miRNA網(wǎng)絡(luò)預(yù)測疾病—miRNA關(guān)聯(lián)的模型,借鑒以往的生物網(wǎng)絡(luò)研究的思路和方法,并結(jié)合miRNA自身功能的生物學(xué)特點(diǎn)分別構(gòu)建了布爾型和帶權(quán)miRNA網(wǎng)絡(luò)。接著分析網(wǎng)絡(luò)特性并分別針
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