山東省H3N2亞型流感病毒的分子流行病學(xué)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、[背景]
  流行性感冒病毒共分為甲、乙、丙、丁型,其中季節(jié)性H3N2亞型流感在人群中普遍流行。HA蛋白和NA蛋白是H3N2流感病毒表面主要的兩種抗原,經(jīng)常頻繁地發(fā)生變異,對發(fā)生流感感染和造成流行具有重要意義,其中HA蛋白的遺傳變異進化發(fā)生得最頻繁。HA蛋白的抗原位點、受體結(jié)合部位及關(guān)鍵的糖基化位點如果發(fā)生氨基酸替換,病毒的致病性和感染的宿主種類就會相應(yīng)發(fā)生改變。NA蛋白又作為藥物治療的重要靶點,酶活性中心的關(guān)鍵位點發(fā)生變異會導(dǎo)致

2、耐藥性。因此研究H3N2亞型流感病毒的HA基因和NA基因在流感流行中的基因進化規(guī)律和分子變異特點具有重要意義。
  [目的]
  了解2014年4月至2015年3月山東省流感病毒病原學(xué)監(jiān)測的描述性流行病學(xué)分布情況,以及在H3N2亞型流感病毒的流行過程中HA基因和NA基因的分子流行病學(xué)分布特點,為預(yù)測流感發(fā)展趨勢及預(yù)防控制流行提供基礎(chǔ)理論依據(jù)。
  [方法]
  本研究首先對山東省流感監(jiān)測數(shù)據(jù)庫進行流感病毒病原學(xué)監(jiān)

3、測情況的基本描述,然后選擇山東省疾病預(yù)防控制中心流感實驗室于2014年4月至2015年3月期間分離保存的H3N2亞型流感毒株102株,并對其進行復(fù)蘇,最后共95株H3N2亞型流感病毒毒株進行RT-PCR擴增和基因測序。利用DNAStar軟件的EditSeq模塊編輯序列及MegAlign模塊分析同源性;多序列比對采用Molecular EvolutionaryGenetics Analysis5.0(MEGA5.0)軟件的ClustalW

4、程序;系統(tǒng)發(fā)生樹的構(gòu)建使用MEGA5.0軟件Neighbor-Joining(NJ)法。
  [結(jié)果]
  1.山東省于2014年4月至2015年3月共收集了21276份流感樣病例鼻咽拭子標(biāo)本,描述分析發(fā)現(xiàn)2014年10月至2015年3月為流感流行高峰期,感染人群主要為0~15歲人群,以5歲以下比例最高;共分離出2371株流感病毒細(xì)胞株,其中A(H3N2)流感病毒占比例最高(1665株),并且2014年11至2015年1月是

5、H3N2亞型流感的流行高峰期。
  2.山東省所分離的H3N2亞型流感病毒的HA和NA基因序列的同源性分析結(jié)果分別為98.0~100%和97.7~100%。HA基因系統(tǒng)發(fā)生樹分析顯示,大多數(shù)山東省分離的H3N2流感病毒的HA基因聚集成一簇,與A/Switzerland/9715293/2013(H3N2)的親緣關(guān)系最近,與A/Texas/50/2012(H3N2)的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。NA基因系統(tǒng)發(fā)生樹分析提示,大多數(shù)山東省分離的H3N

6、2流感病毒NA基因聚集分布在一個大分支,與A/Switzerland/9715293/2013(H3N2)的遺傳距離最短,與A/Texas/50/2012(H3N2)的遺傳距離最長,均未發(fā)現(xiàn)明顯的地域和時間特征。
  3.HA蛋白共52個位點發(fā)生氨基酸替換,其中抗原決定簇(HA1蛋白)位點發(fā)生了17個,裂解位點序列并沒有發(fā)生變異,丟失糖基化位點NES134-136和NSS156-158,同時新增糖基化位點NYT170-172。NA

7、蛋白有51個位點發(fā)生氨基酸替換,酶活性中心位點118(D-N)、371(V-I)發(fā)生變異,催化位點156(V-I)、425(T-N)發(fā)生變異,5個抗原位點發(fā)生變異,丟失糖基化位點NWS7779和NDS320-322,同時新增糖基化位點NIT84-86和NAS236-238。
  [結(jié)論]
  1.2014年4月至2015年3月山東省流感病毒流行的優(yōu)勢毒株是H3N2亞型流感病毒,其流行高峰時間為冬春季(2014年11月、201

8、4年12月、2015年1月)。
  2.2014年4月至2015年3月山東省分離的H3N2亞型流感流行株的HA基因和NA基因的同源性較高,但與當(dāng)年疫苗株的遺傳距離稍遠(yuǎn),與下一年的疫苗株遺傳距離較近;HA蛋白和NA蛋白均有部分抗原決定位點出現(xiàn)氨基酸替換現(xiàn)象,HA基因普遍可能發(fā)生了抗原性漂移,WHO推薦的2014~2015年疫苗株對H3N2亞型流感病毒保護效果可能較差,而2015~2016年的疫苗株可能對其具有一定保護效果。
 

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