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文檔簡介
1、目的:初步研究分枝桿菌噬菌體Guo1生物學(xué)特性及環(huán)狀基因組特征。
方法:測定分枝桿菌噬菌體Guo1的最佳感染復(fù)數(shù)、一步生長曲線以及對紫外線、氯仿、酒精、溫度、pH的敏感性。采用鳥槍法和重疊群組裝策略完成Guo1全基因組測序;使用DNAStar、tRNAscan-SE、Promoter predictions、TRF、Glimmer、BLAST軟件分別對噬菌體的一般基因組學(xué)特征、tRNA、啟動子、串聯(lián)重復(fù)序列和編碼基因進行分析;
2、運用 BLAST軟件檢索與 Guo1基因組相似的噬菌體并構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,推斷Guo1的分群。
結(jié)果:Guo1對紫外線有較強抵抗力,對酒精、氯仿和高溫敏感;最適溫度為37℃,最適pH為7.0,最佳感染復(fù)數(shù)為0.01;一步生長曲線顯示:潛伏期120 min,裂解期120 min,裂解量為47個。噬菌體Guo1的基因組為全長40086 nt的環(huán)狀雙鏈DNA,屬于G群分枝桿菌噬菌體;Guo1基因組中含有59個推定基因,7個啟動子序列和
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