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文檔簡介
1、目的:對變應性鼻炎(AR)患者和正常人的抗原處理相關轉運蛋白(TAP)的TAP1333和TAP1637位點進行基因及等位基因分型,探討該基因位點多態(tài)性與變應性鼻炎遺傳易感性之間的關系。
方法:①特異性IgE的檢測。各抽取AR組和對照組研究對象新鮮血液2ml,離心后吸取上層血清。應用阿羅格AD體外診斷盒對血清進行特異性變應原(9項)的檢測。根據(jù)試紙顯色深淺判定陽性結果的強弱程度,分別以+,++,+++表示。②外周血DNA的提
2、取。各抽取AR組和對照組研究對象新鮮抗凝血液2ml,用淋巴細胞分離液提取白細胞后,應用血液基因組DNA提取試劑盒提取出DNA,-20℃進行保存。應用紫外分光光度計測定DNA樣本的純度和濃度,記錄260nm、280nm波長時的OD值。③引物合成。根據(jù)TAP1333和TAP1637位點分別設計四條引物,包括一對共同引物和兩條特異引物。引物設計參照文獻Powis et al.[4]④ARMS-PCR擴增。根據(jù)TAP1333和TAP1637位點
3、等位基因型不同分別設計三組引物,每個研究對象需加A、B、C三管含不同引物對的反應體系,其每管的擴增產(chǎn)物代表同一研究對象的DNA在不同引物對作用下延伸的產(chǎn)物。⑤瓊脂糖凝膠電泳。將同一樣本在不同引物擴增下得到的PCR反應產(chǎn)物混合后進行水平電泳,完畢取出瓊脂糖凝膠,紫外分析燈下分析結果。⑥統(tǒng)計學處理應用SPSS11.0統(tǒng)計軟件分析,計算TAP基因的等位基因頻率、基因型頻率分布,分析基因多態(tài)性與疾病的相關性,組間比較用x2檢驗,P>0.05有統(tǒng)
4、計學意義。
結果:
1.特異性IgE檢測結果:特異性變應原分布情況檢測結果顯示屋塵螨檢測陽性率位于首位(86.67%),其次為花粉類和動物上皮。
2.DNA濃度及純度檢測結果:65例研究對象外周血DNA稀釋后在紫外分光光度計下測定的OD260/OD280比值在1.5~2.0之間。部分樣本可能存在RNA或蛋白質污染,但不影響PCR擴增結果。
3.ARMS-PCR結果:TAP1333位
5、點檢測出三種基因型,分別為Ile/Ile、Ile/Val、Val/Val。A、B、C三管擴增產(chǎn)物大小分別為533bp,351bp和241bp。TAP1637位點檢測出兩種基因型,分別為Asp/Asp和Asp/Gly,A、B、C三管擴增產(chǎn)物大小分別為429bp,180bp,和307bp,在兩組研究對象中均未檢測出Gly/G1y基因型。
4.統(tǒng)計學結果:TAP1333和TAP1637位點基因型的分布頻率在AR組及對照組中都分別
6、以Ⅱ和DD為主,經(jīng)統(tǒng)計學處理,前者差異有顯著性(P<0.05),后者無統(tǒng)計學意義(P>0.05);TAP1333和TAP1637位點等位基因型的分布頻率在AR組及對照組中都分別以I和D為主,經(jīng)統(tǒng)計學處理,前者差異有顯著性(P<0.05);后者無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
結論:TAP1333基因型和等位基因型頻率的分布在正常人和AR患者中不同,結果有統(tǒng)計學意義,說明此位點基因多態(tài)性與AR具有一定相關性,屬于AR易感基因群
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