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文檔簡介
1、目的:建立皮膚擴張模型,探究皮膚擴張早期中miRNA和mRNA表達譜的變化情況。
方法:取6-8周SD大鼠建立擴張模型,在擴張早期取下擴張皮膚,并利用未擴張皮膚作為對照,采用Affymetrix microRNA3.0平臺和Affymetrix GeneChip Rat Gene1.0 ST檢測擴張早期miRNA和mRNA的表達變化;利用統(tǒng)計學方法初步篩選出表達發(fā)生變化的miRNA和mRNA,并根據(jù)差異表達的倍數(shù)篩選出表達差異
2、較大的關鍵miRNA。采用TargetScan、miRDB和IPA數(shù)據(jù)庫對關鍵miRNA進行靶點預測;利用miRNA與靶點mRNA數(shù)量變化呈負相關的關系初步明確擴張早期miRNA可能調(diào)控的mRNA靶點,建立miRNA-靶mRNA的一一對應關系。對靶點mRNA進行功能分析和通路分析,明確擴張早期關鍵miRNA-靶mRNA-通路的對應關系。
結(jié)果:篩選出了11個滿足統(tǒng)計學差異和表達倍數(shù)變化的miRNA,明確了miRNA-靶mRNA
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