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文檔簡介
1、隨著我國主要農(nóng)作物利用SSR分子標記法進行品種鑒定技術(shù)規(guī)程相繼頒布,如:玉米(NY/T1432-2014)、小麥(NY/T2470-2013)、水稻(NY/T1433-2014)、高粱(NY/T2467-2013)、大豆(NY/T2595-2014)等,基于各個作物行業(yè)標準的DNA指紋庫構(gòu)建工作也在不斷開展起來,其中玉米在基于行業(yè)標準的基礎(chǔ)上建立了標準DNA指紋圖譜數(shù)據(jù)庫,并形成一套成熟體系,為其他作物建庫提供了參考依據(jù)。作物特點直接影
2、響建庫方案,建庫的難易程度也不盡相同,為了盡快發(fā)揮主要農(nóng)作物品種DNA指紋圖譜數(shù)據(jù)庫在農(nóng)作物品種鑒定中的作用,需要尋求一種通用、簡單、便捷的建庫方案。本研究主要對玉米(Zea mays Linn.Sp.)、高粱[Sorghum bicolor(L.)]、大豆[Glycine max(Linn.)]、小麥(TriticumaestivumLinn.)4種主要農(nóng)作物進行品種DNA指紋圖譜數(shù)據(jù)庫構(gòu)建的通用性方案進行探索研究,主要研究結(jié)果如下:
3、
1.以166份高粱和6份玉米標準品種為例,對比兩種作物建庫方案存在的異同,并通過對兩種作物建庫方案驗證發(fā)現(xiàn):玉米品種標準DNA指紋庫的建庫方案表現(xiàn)出更為穩(wěn)定、簡單、準確的特點,并且高粱建庫能夠完全適用該方案。因此,在玉米標準的基礎(chǔ)上建立了166份高粱品種DNA指紋圖譜數(shù)據(jù)庫,并通過疑似篩查確定疑似樣品名單,進一步在田間進行表型鑒定。通過一年田間試驗測試,結(jié)果表明田間表型鑒定結(jié)果和室內(nèi)檢測結(jié)果基本一致,進一步說明玉米標準DNA
4、指紋庫構(gòu)建方案在跨作物高粱DNA指紋庫構(gòu)建中可以應(yīng)用,也為其他作物開展通用性建庫方案的探索奠定了基礎(chǔ)。
2.以5份大豆品種為例,探索玉米DNA指紋庫構(gòu)建方案在大豆中的通用性。通過整個試驗流程的對比分析,發(fā)現(xiàn)大豆基本可以適用玉米標準DNA指紋庫的構(gòu)建方案。在建立通用性建庫方案的過程中,最主要的問題一是樣品處理方式,二是引物退火溫度存在不統(tǒng)一的現(xiàn)象,使得建立通用的PCR反應(yīng)體系和反應(yīng)程序相對較為困難。但對于其他建庫環(huán)節(jié)可以和玉米標
5、準DNA指紋庫構(gòu)建方案上通用,如在數(shù)據(jù)分析上由于大豆一般屬于二倍體自花授粉作物,帶型相對簡單,在采用玉米數(shù)據(jù)分析參數(shù)時得到的效果較好,易于實現(xiàn)數(shù)據(jù)的自動化分析。
3.以5份小麥為例,探索玉米標準DNA指紋庫構(gòu)建方案在小麥中的通用性。通過整個試驗流程的對比分析,發(fā)現(xiàn)小麥基本可以適用玉米標準DNA指紋庫的構(gòu)建方案。通用性建庫中存在的主要問題是引物的問題,小麥屬于異源六倍體,本身峰型較為復(fù)雜,在數(shù)據(jù)分析環(huán)節(jié)采用二倍體的數(shù)據(jù)分析參數(shù)時
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