黑龍江口岸城市嚙齒類動(dòng)物感染漢坦病毒的分子流行病學(xué)研究.pdf

1、漢坦病毒（Hantavirus，HV）是一種有包膜分節(jié)段的負(fù)鏈RNA病毒，屬布尼亞病毒科。HV的自然宿主為嚙齒類動(dòng)物。其對(duì)嚙齒類只造成一過(guò)性感染，并不影響其宿主的壽命和繁衍。但其可通過(guò)野生嚙齒類宿主的排泄物如唾液、尿和糞便等感染人類，并引發(fā)兩種嚴(yán)重的臨床疾病:腎綜合征出血熱(hemorrhgic fever with renal syndrome，HFRS)和漢坦病毒肺綜合癥（hantavirus cardiopulmonary syn

2、drome，HPS）。中國(guó)擁有世界上最高的HFRS發(fā)病率，而黑龍江是最嚴(yán)重的疫區(qū)之一。
　　進(jìn)行疫病監(jiān)測(cè)和流行病學(xué)研究，是有效防控疫病的重要基礎(chǔ)。黑龍江省與俄聯(lián)邦、蒙古等多國(guó)接壤，是動(dòng)物疫病跨國(guó)傳播的重要防控區(qū)域，而口岸地區(qū)人員、貨物交流頻繁，又會(huì)提升動(dòng)物疫病傳播的風(fēng)險(xiǎn)。開(kāi)展口岸地區(qū)疫病監(jiān)測(cè)和流行病學(xué)研究，尤其具有其重要性。因此，本研究對(duì)2014年黑龍江省主要口岸城市漢坦病毒在自然宿主中的流行情況進(jìn)行了調(diào)查，并重點(diǎn)對(duì)從嚙齒類動(dòng)物體

3、內(nèi)分離的HV進(jìn)行了分子流行病學(xué)研究。
　　本研究中，共在黑龍江地區(qū)選取12個(gè)口岸城市，捕獲嚙齒動(dòng)物645只，其中主要為11種嚙齒目動(dòng)物，此外包括4只鼩鼱（Sorex araneus Linnaeus）。在捕獲的嚙齒目動(dòng)物中，數(shù)量最多的是黑線姬鼠（Apodemus agrarius），其次是褐家鼠（Rattusnorvegicus）。對(duì)上述捕獲的動(dòng)物進(jìn)行PCR檢測(cè)以確定HV感染情況。結(jié)果表明黑線姬鼠中HV的有感染率是4.9％(14/

4、282)，而褐家鼠的HV感染率是8.3％(15/180)。進(jìn)一步完成的基于基因序列測(cè)定和遺傳進(jìn)化分析結(jié)果表明，分離到的HV中，包含兩種HV基因型:漢灘病毒(Hantaan virus，HTNV)和漢城病毒(Seoul virus，SEOV)。其中HTNV有10株，SEOV有19株，SEOV感染的檢出率略高于HTNV。而遺傳進(jìn)化樹(shù)分析表明，黑龍江口岸地區(qū)流行的SEOV和HTNV各存在兩個(gè)和一個(gè)進(jìn)化分支，與之前報(bào)道的檢測(cè)結(jié)果相一致，未檢測(cè)到

5、有新進(jìn)化分支的出現(xiàn)。為了更好地了解在黑龍江口岸地區(qū)HV的流行情況，我們獲得了一株分離于褐家鼠的TJ分離株(HTNV)的M序列全長(zhǎng)和一株DN2分離株(SEOV)的全基因組序列，來(lái)分析其基因信息。其中，HTNV的M基因氨基酸序列與國(guó)內(nèi)外參考毒株對(duì)比后，并未發(fā)現(xiàn)有重要氨基酸位點(diǎn)突變。而DN2分離株與國(guó)內(nèi)外代表毒株SEOV L99的核苷酸同源率是:S基因96.5％，M基因98.3％，L基因96.0％。氨基酸序列的同源率為:S基因93.3％，M基