29189.抗癌藥物敏感性預(yù)測的網(wǎng)絡(luò)流模型

1、上海師范大學(xué)學(xué)位論文中文摘要摘要癌癥是由控制細(xì)胞生長機(jī)制異常引起的，基因突變，染色體變異，拷貝數(shù)變異等都會(huì)引發(fā)癌癥抗癌藥物多種多樣，抗癌藥物的敏感性研究具有重大意義考慮到基因之間的調(diào)控作用，本文提出了一種網(wǎng)絡(luò)流模型預(yù)測抗癌藥物敏感性的方法在此模型中，基因之間原本存在調(diào)控作用，假定基因突變，拷貝數(shù)變異會(huì)對(duì)網(wǎng)絡(luò)流中基因之間的調(diào)控作用產(chǎn)生一定的影響抗癌藥物通過作用某一特定的目標(biāo)靶基因，以此降低細(xì)胞通路的活性我們以實(shí)施藥物前后通路活性差值的大小

2、作為衡量某一種藥物敏感性的指標(biāo)基于該假設(shè)，我們構(gòu)造了一個(gè)滿足所有樣本參數(shù)的模型，通過交叉驗(yàn)證的方法，此模型具有較好的預(yù)測結(jié)果在MAPK通路中，我們得到不同的癌癥相關(guān)基因?qū)Σ煌幬锏拿舾行砸约安煌乃幬飳?duì)不同癌癥相關(guān)基因的藥物作用根據(jù)我們的結(jié)果，雖然指向同一靶基因的抑制劑有相似的藥物作用，但是它們有不同的抑制機(jī)制通過10輪交叉驗(yàn)證的方法，BRAF和MEK抑制劑預(yù)測值與真實(shí)值的皮爾遜相關(guān)系數(shù)大約是O4，這個(gè)結(jié)果和彈性網(wǎng)模型的結(jié)果是可以比較的

3、并非使用龐大的基因數(shù)據(jù)特征，包含轉(zhuǎn)錄分析，基因突變和拷貝數(shù)變異我們的特征僅僅是基于MAPK通路的致癌基因的突變和拷貝數(shù)變異因此我們得結(jié)果是相當(dāng)可觀的，并且具有較好的泛化能力此外，不同藥物作用整合在同一個(gè)模型中，我們可以預(yù)測藥物組合的敏感性關(guān)鍵詞彈性網(wǎng)絡(luò)模型網(wǎng)絡(luò)流模型通路活性抗癌藥物敏感性目錄目錄摘要IAbstractII第1章緒論411課題背景4第2章抗癌藥物敏感性預(yù)測的常用方法5第3章抗癌藥物敏感性預(yù)測的彈性網(wǎng)絡(luò)模型6第4章抗癌藥物敏