房顫伴瓣膜性心臟病致病的混合調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與機(jī)理分析.pdf

1、房顫伴瓣膜性心臟?。ˋtrial fibrillation with valvular heart disease,AF-VHD）是一類(lèi)瓣膜性疾病，易于引起一系列連鎖疾病的發(fā)生，比如心力衰竭、心肌梗塞、血栓等嚴(yán)重的并發(fā)癥，故具有非常高的傷害性以及致死率。隨著現(xiàn)代分子生物學(xué)理論和技術(shù)不斷的發(fā)展，國(guó)內(nèi)外對(duì)于AF-VHD的致病分子機(jī)制研究有了較大的發(fā)展，但是其研究角度相對(duì)單一，沒(méi)有從網(wǎng)絡(luò)的整體性去探尋疾病的致病機(jī)理。因此，本文結(jié)合數(shù)學(xué)網(wǎng)絡(luò)的篩

2、選方法和生物信息分析的手段，分別構(gòu)建出瓣膜性心臟?。╒HD）和AF-VHD兩種疾病的共調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，主要研究?jī)?nèi)容為：
　?。?）從已經(jīng)發(fā)表的文獻(xiàn)中收集到與VHD相關(guān)的15個(gè)miRNAs，根據(jù)基因、miRNA、轉(zhuǎn)錄因子共調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建方法，構(gòu)建VHD的混合共調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。對(duì)網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)進(jìn)行度篩選，找出了關(guān)鍵的4個(gè)miRNA、4個(gè)TF、31個(gè)基因，利用關(guān)鍵miRNA和靶基因進(jìn)行GO功能富集分析和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)以及單獨(dú)解析34個(gè)基因的生物功能，映射到

3、生物空間揭示VHD致病的分子機(jī)理。
　?。?）基于本實(shí)驗(yàn)室APCA&靴帶抽樣方法提取的32個(gè)與AF-VHD疾病相關(guān)的miRNAs，利用與上一部分相同的網(wǎng)絡(luò)構(gòu)造方法原理，構(gòu)建出 AF-VHD混合調(diào)控共網(wǎng)絡(luò)。通過(guò)網(wǎng)絡(luò)特征分析，篩選出關(guān)鍵的5個(gè)miRNA、5個(gè)TF、41個(gè)基因，映射到生物空間挖掘AF-VHD致病的分子機(jī)理。隨后對(duì)比VHD和AF-VHD兩者的網(wǎng)絡(luò)，提取共同的生物特征進(jìn)行分析，從而挖掘出其中的重要分子調(diào)節(jié)機(jī)制，闡述從VHD到