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文檔簡介
1、目的:MicroRNA(miRNA)作為一種重要的生物標(biāo)志物,在腫瘤的早期診斷,代謝性疾病篩查,基因調(diào)控等方面都有著重要的作用,如miRNA-21在2型糖尿病、脂肪肝、結(jié)腸癌等患者的血清、尿液中異常表達(dá),受到廣大科研工作者的關(guān)注。目前,miRNA的傳統(tǒng)檢測技術(shù)的大多基于Northern印跡雜交、基因芯片和實時熒光定量PCR,但這些方法耗時費力,需要嚴(yán)格的溫度控制,并且設(shè)備要求較高,從了提高了miRNA檢測的成本與難度。本研究針對miRN
2、A檢測的現(xiàn)狀,建立了一種新的miRNA檢測策略,選取與2型糖尿病相關(guān)的miRNA-21為檢測對象。該研究策略具有快速、靈敏、低成本、易操作的特點,有望在臨床實踐中,為快速、低成本的檢測其他疾病的生物標(biāo)志物提供新的研究方向,具有較好的應(yīng)用前景。
方法:為了更好的檢測低豐度miRNA并解決異相分析檢測方法的缺陷,本研究策略采取均相反應(yīng)環(huán)境,即在同一體系內(nèi),完成靶物質(zhì)的識別,信號擴增與放大,均相分析具有更為均一的反應(yīng)動力學(xué)和熱力學(xué)特
3、點,從而最大程度保留了識別分子的親和力和特異性?;贙F exo-聚合作用和T7 pol的轉(zhuǎn)錄擴增作用,靶物質(zhì)miRNA-21與本研究設(shè)計的多功能直鏈上對應(yīng)的位點發(fā)生特異性結(jié)合,在核酸底物、KF聚合酶(KF exo-)、對應(yīng)模板鏈存在下即可發(fā)生鏈的聚合延伸,延伸出的DNA核酸序列中含有T7 RNA聚合酶(T7 pol)可特異性識別的 T7啟動子;T7 RNA聚合酶具有高效催化轉(zhuǎn)錄的特點,能夠在單鏈或雙鏈核酸上沿5’-3’方向在其啟動子下
4、游催化聚合出RNA片段,實現(xiàn)轉(zhuǎn)錄、擴增。擴增出來的大量短鏈RNA片段與金電極表面上的檢測及捕獲探針進行特異性結(jié)合,從而在電化學(xué)生物傳感技術(shù)平臺上實現(xiàn)電信號的放大并檢測,從而完成靶物質(zhì)miRNA-21的定量檢測。
結(jié)果:成功實現(xiàn)了靶物質(zhì)miRNA-21的定量檢測,所構(gòu)建的生物傳感技術(shù)最低檢測限約為0.6fM,線性檢測范圍為1fM到10nM,構(gòu)建的生物傳感器具有較高的敏感性;在具有高度序列相似性的miRNA中,能夠較好的區(qū)分單堿基
5、錯配、雙堿基錯配的靶物質(zhì),具有較高的特異性;在實際樣本的檢測中,我們將HepG2細(xì)胞株中提取的總RNA檢測對象,在較為復(fù)雜的檢測環(huán)境中,依然能夠完成miRNA-21的定量檢測,該傳感器具有一定的抗干擾能力,穩(wěn)定性較好。
結(jié)論:本研究基于均相反應(yīng)環(huán)境,結(jié)合KF exo-的聚合與T7 pol的轉(zhuǎn)錄特性構(gòu)建出均相靶識別轉(zhuǎn)錄擴增的生物傳感放大策略。該策略避免了序列之間的非均相聚合作用與復(fù)雜的操作步驟,具有高靈敏度,高特異性,低成本,易
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